| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| Index | 第8-10页 |
| Chapter Ⅰ-Introduction | 第10-17页 |
| ·Protein interaction networks | 第10-11页 |
| ·Protein interaction databases | 第11-12页 |
| ·Previous work | 第12-14页 |
| ·Motivation | 第14-15页 |
| ·Outline | 第15-17页 |
| Chapter Ⅱ-Protein Complexes Detection State Of The Art | 第17-26页 |
| ·Introduction | 第17-18页 |
| ·Protein interaction network models | 第18-20页 |
| ·Random graph model | 第19页 |
| ·Scale-Free model | 第19页 |
| ·The STICKY model | 第19-20页 |
| ·Protein complex detection methods | 第20-24页 |
| ·Algorithms based solely on PPI networks | 第20-22页 |
| ·Algorithms integrating biological data | 第22-23页 |
| ·Predicted complex validation methods | 第23-24页 |
| ·Summary | 第24-26页 |
| Chapter Ⅲ-Fuzzy Set Theory | 第26-33页 |
| ·Introduction | 第26-27页 |
| ·Basic notions | 第27-29页 |
| ·Fuzzy c-Means Algorithms | 第29-31页 |
| ·FCM Validation Indices | 第31-32页 |
| ·Summary | 第32-33页 |
| Chapter Ⅳ-Spectral Graph Theory | 第33-41页 |
| ·Introduction | 第33-34页 |
| ·Eigenvectors and the Min-Cut problem | 第34-36页 |
| ·Spectral Clustering Algorithms | 第36-39页 |
| ·Similarity Metric | 第39-40页 |
| ·Summary | 第40-41页 |
| Chapter Ⅴ-Proposed Method | 第41-62页 |
| ·Introduction | 第41-43页 |
| ·A discussion about FCM convergence | 第43-44页 |
| ·Proposed algorithm | 第44-48页 |
| ·Results | 第48-60页 |
| ·Applying to MCL | 第50-56页 |
| ·Applying to MCODE | 第56-58页 |
| ·Applying to DPClus | 第58-60页 |
| ·Summary | 第60-62页 |
| Chapter Ⅵ-Conclusions and Future Work | 第62-66页 |
| ·Conclusions | 第62-64页 |
| ·Future work | 第64-66页 |
| References | 第66-71页 |
| ACKNOWLEDGMENTS | 第71-72页 |
| 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第72页 |
