| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 英文缩写符号及中英文对照表 | 第12-14页 |
| 1. 引言 | 第14-31页 |
| ·海洋海绵与多孔动物门 | 第14-19页 |
| ·海洋海绵 | 第15页 |
| ·多孔动物门的主要特征 | 第15-18页 |
| ·体型多不对称 | 第15页 |
| ·海绵体细胞的分化与身体结构 | 第15-16页 |
| ·特有的水沟系 | 第16-17页 |
| ·不同种类的骨骼 | 第17页 |
| ·生殖和发育 | 第17-18页 |
| ·海绵的分类 | 第18-19页 |
| ·钙质海绵纲(Calcarea) | 第18-19页 |
| ·六放海绵纲(Hexactinellida) | 第19页 |
| ·寻常海绵纲（Demopongiae） | 第19页 |
| ·硬海绵纲（Sclerospongea） | 第19页 |
| ·海洋海绵研究进展 | 第19-24页 |
| ·海洋海绵共生微生物 | 第19-21页 |
| ·海绵活性物质研究 | 第21-22页 |
| ·海洋海绵及其共生微生物的化学防御 | 第22-24页 |
| ·抵御病原微生物 | 第22-23页 |
| ·抵御捕食者 | 第23页 |
| ·竞争生存空间 | 第23页 |
| ·污染降解 | 第23-24页 |
| ·海洋海绵相关微生物研究方法 | 第24-29页 |
| ·分类研究方法 | 第24-28页 |
| ·荧光原位杂交（FISH） | 第25页 |
| ·聚合酶链反应（PCR） | 第25-26页 |
| ·16S rRNA 基因序列测定 | 第26页 |
| ·变性梯度凝胶电泳（DGGE） | 第26-27页 |
| ·RFLP 和T-RFLP | 第27-28页 |
| ·活性物质相关基因来源及表达的研究 | 第28-29页 |
| ·海绵 M.armata 在夏威夷瓦胡岛 Kaneohe 海湾的生长及危害 | 第29-31页 |
| ·海绵 M.armata 在夏威夷瓦胡岛 Kaneohe 海湾的生长 | 第29页 |
| ·海绵M.armata 对夏威夷瓦胡岛Kaneohe 海湾造成的生态危害 | 第29-31页 |
| 2. 材料与方法 | 第31-47页 |
| ·材料 | 第31-32页 |
| ·菌株及质粒 | 第31页 |
| ·酶与各种生化试剂 | 第31页 |
| ·实验用的引物和寡核苷酸 | 第31-32页 |
| ·海绵材料及采样地点 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-47页 |
| ·海绵样品的采集 | 第32页 |
| ·海绵样品处理及相关细菌的分离与培养 | 第32-33页 |
| ·海绵样品总 DNA 的提取 | 第33-34页 |
| ·使用 Dneasy Tissue Kit（QIAgen）提取海绵总DNA | 第33-34页 |
| ·使用 DNeasy Plant Mini Kit（QIAgen）提取海绵总DNA | 第34页 |
| ·海水样品采集及处理 | 第34-35页 |
| ·海水样品采集与样品中微生物的获得 | 第34页 |
| ·使用 FastDNA Kit（Qbiogene）提取海水样品总DNA | 第34-35页 |
| ·本研究所用的 PCR 反应体系及程序 | 第35-36页 |
| ·用QIAquick Gel extraction Kit（QIAgen）回收凝胶电泳中DNA 片段 | 第36-37页 |
| ·用QIAquick PCR purification Kit （QIAgen）纯化PCR产物 | 第37页 |
| ·DNA 片段与克隆载体的连接 | 第37-38页 |
| ·与pGEM -T easy vector 的连接体系 | 第37页 |
| ·与pCR2.1-TA TOPO Clone Kit的连接体系 | 第37-38页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第38-39页 |
| ·大肠杆菌电转化感受态细胞的制备 | 第38-39页 |
| ·大肠杆菌化学转化感受态细胞的制备 | 第39页 |
| ·大肠杆菌细胞转化法 | 第39-40页 |
| ·大肠杆菌细胞电转化法 | 第39页 |
| ·大肠杆菌细胞化学转化法 | 第39-40页 |
| ·大肠杆菌质粒 DNA 的提取 | 第40-41页 |
| ·煮沸法提取大肠杆菌质粒 DNA | 第40页 |
| ·用QIAprep Spin Miniprep Kit（QIAgen）提取大肠杆菌质粒DNA | 第40-41页 |
| ·可培养型海绵相关细菌的分子分类 | 第41页 |
| ·细菌 16S rRNA 基因克隆文库的构建 | 第41-42页 |
| ·变性凝胶梯度电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis—DGGE)分析 | 第42-44页 |
| ·用于 DGGE 的海绵相关细菌 16S rRNA 基因片段的获得及 处理 | 第42页 |
| ·DGGE 变性溶液贮存液的配制 | 第42页 |
| ·DGGE 凝胶配置 | 第42-43页 |
| ·DGGE 检测及胶的处理 | 第43页 |
| ·DGGE 16S rDNA 亚克隆文库的构建 | 第43-44页 |
| ·T-RFLP | 第44-45页 |
| ·测序及系统发生分析 | 第45-47页 |
| 3. 结果与分析 | 第47-58页 |
| ·入侵型海绵 M. armata 的生态影响 | 第47-48页 |
| ·可培养型海绵相关细菌的分类 | 第48-51页 |
| ·利用 T-RFLP 技术初步分析海绵及海水样品 | 第51-52页 |
| ·16S rDNA 文库的建立与分类 | 第52-54页 |
| ·入侵型与非入侵型外来海洋海绵中共生微生物群落的比较 | 第54-56页 |
| ·本研究获得的核苷酸序列 | 第56-58页 |
| 4. 讨论 | 第58-62页 |
| ·依赖培养分离法的入侵性海洋海绵微生物多样性分析 | 第58页 |
| ·海洋海绵内共生微生物对于其寄主及相关生境的影响 | 第58-60页 |
| ·海绵共生微生物有利于其寄主 | 第58-59页 |
| ·海绵中的微生物病原菌对寄主可能的影响 | 第59-60页 |
| ·DGGE 结果显示入侵型与非入侵型海绵微生物群落结构差异 | 第60-62页 |
| ·海绵 M. armata 与海绵 S. zeteki 的微生物群落的组成差异 | 第60页 |
| ·不同分子分类手段差异比较与分析 | 第60-61页 |
| ·海绵M. armata 入侵本质的探索 | 第61-62页 |
| 5. 结论 | 第62-64页 |
| ·系统发生分析可培养的海绵相关细菌菌群均为低 G+C 的革 兰氏阳性菌 | 第62页 |
| ·α-变形杆菌纲(alpha-proteobacteria)在海洋海绵 M. armata 16S rRNA 基因克隆文库中成为优势菌群 | 第62页 |
| ·首次分离到微生物病原菌 | 第62-63页 |
| ·首次发现不同分子分类手段之间有差异 | 第63-64页 |
| 附录 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
| 攻读学位期间的论文发表情况 | 第77页 |
