| 中文摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-20页 |
| 第1章 | 第20-36页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第20-23页 |
| ·基因和人类基因组计划 | 第20-22页 |
| ·后基因组时代需要解决的问题 | 第22-23页 |
| ·生物信息学(Bioinformatics)概念 | 第23-26页 |
| ·生物信息学定义 | 第23-24页 |
| ·生物信息学的重要性 | 第24-26页 |
| ·生物信息学的研究内容 | 第26-28页 |
| ·生物信息学数据库的发展 | 第28-34页 |
| ·生物信息学数据库发展现状 | 第28-31页 |
| ·生物信息学网络上的数据库服务进展 | 第31-32页 |
| ·国内生物信息学数据库发展现状 | 第32-33页 |
| ·现存的问题 | 第33-34页 |
| ·论文的主要研究内容和组成 | 第34-36页 |
| 第2章 生物信息数据库概述 | 第36-50页 |
| ·生物信息学数据库及相关知识 | 第36-45页 |
| ·DNA数据库 | 第38-40页 |
| ·蛋白质序列数据库 | 第40-43页 |
| ·基因组数据库 | 第43-44页 |
| ·蛋白质结构数据库 | 第44页 |
| ·其它数据库资源 | 第44-45页 |
| ·国内外数据库信息检索系统发展现状 | 第45-49页 |
| ·SRS检索系统 | 第46-47页 |
| ·Entrez | 第47-48页 |
| ·国内生物信息学数据库检索系统 | 第48-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 第三章 系统分析与总体设计 | 第50-76页 |
| ·需求分析 | 第50-51页 |
| ·体系结构 | 第51页 |
| ·功能设计 | 第51-53页 |
| ·系统功能说明 | 第52页 |
| ·系统功能结构图 | 第52-53页 |
| ·数据库设计 | 第53-75页 |
| ·设计原则 | 第53-54页 |
| ·概念设计 | 第54-66页 |
| ·逻辑设计 | 第66-72页 |
| ·基于Gene Ontology的数据库整合设计 | 第72-73页 |
| ·数据库的物理设计与优化 | 第73-75页 |
| ·本章小结 | 第75-76页 |
| 第四章 基于XML的生物信息数据的格式 | 第76-91页 |
| ·XML的特点 | 第76-77页 |
| ·数据库中数据与XML文档中数据的映射 | 第77-78页 |
| ·基于模板驱动的映射 | 第77-78页 |
| ·基于模型驱动的映射 | 第78页 |
| ·XML与关系数据库的双向映射 | 第78-85页 |
| ·XML文档映射到关系数据库 | 第79-81页 |
| ·组合优化生成一个XML文档 | 第81页 |
| ·SQL Server2000对XML技术的支持 | 第81-85页 |
| ·XML与面向对象数据库的双向映射 | 第85-87页 |
| ·XML文档文件映射到面向对象数据库 | 第86页 |
| ·面向对象数据库信息转换为XML文档文件 | 第86-87页 |
| ·本系统XML数据格式转换的实现 | 第87-89页 |
| ·对生物信息学数据库定义统一的DTD的建议 | 第89-90页 |
| ·本章小结 | 第90-91页 |
| 第五章 HDbio生物学数据库系统实现 | 第91-106页 |
| ·系统开发环境 | 第91页 |
| ·系统软件开发环境 | 第91页 |
| ·系统硬件开发环境 | 第91页 |
| ·系统的功能实现 | 第91-105页 |
| ·数据库管理功能包括 | 第92-94页 |
| ·用户查询系统 | 第94-105页 |
| ·本章小结 | 第105-106页 |
| 结论 | 第106-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第108-109页 |
| 参考文献 | 第109-118页 |
| 附录1 Genbank数据库序列条目示例 | 第118-120页 |
| 附录2 NCBI的蛋白质数据条目示例 | 第120-125页 |
| 附录3 MMDB数据库数据条目示例 | 第125-128页 |
| 附录4 GO数据库部分条目示例 | 第128-130页 |
| 附录5 GenBank中的核酸序列数据库一个条目的XML文档 | 第130-135页 |
| 独创性声明 | 第135页 |