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亚洲香菇系统发育学地位的重新评估与遗传多样性分析

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-14页
缩略语表第14-16页
1 文献综述第16-35页
   ·分子进化概述第16页
   ·分子进化的动力第16-19页
     ·突变第17页
     ·自然选择第17-18页
     ·随机遗传漂变第18页
     ·基因流第18-19页
   ·分子进化的中性理论第19-20页
   ·分子钟假说第20-22页
   ·分子系统发育及其应用第22-30页
     ·分子系统发育概述第22页
     ·蛋白质水平的分子数据检测第22-24页
     ·DNA水平的标记与检测第24-28页
     ·数据处理(系统发育树的重建)方法第28-30页
   ·遗传多样性第30-31页
   ·群体遗传学概述及其应用第31-33页
   ·核糖体DNA在丝核菌系统演化研究中的意义及作用第33-35页
2 香菇及所在属的系统学的研究进展第35-37页
   ·香菇概述第35页
   ·香菇及其所在属的分类地位的变迁第35-36页
   ·香菇所在属内的种及其地理分布第36页
   ·香菇及所在属内的分子系统学研究进展第36-37页
3 研究的目的和意义第37页
4 材料与方法第37-48页
   ·供试菌株第37-44页
   ·序列第44-47页
     ·自行测序序列第44-47页
     ·已报道的序列第47页
   ·系统发育分析第47-48页
   ·分子钟分析第48页
   ·群体遗传学分析第48页
5 结果第48-74页
   ·总DNA及PCR扩增电泳检测图谱第48-49页
   ·序列及特征第49-50页
     ·序列登录与下载第49页
     ·序列特征与多态性第49-50页
   ·全球Lentinula属菌株的系统发育分析结果第50-53页
   ·亚洲香菇群体的系统发育及多样性分析第53-57页
     ·亚洲群体的系统发育关系第53-54页
     ·亚洲香菇群体的地缘关系多样性分析第54-57页
   ·分子钟检验及分歧时间的估计第57-58页
   ·洲香菇的群体遗传学分析第58-74页
     ·序列特征第59页
     ·种群统计参数的估计第59-65页
     ·层次变异分析第65-66页
     ·群体的遗传分化第66-67页
     ·群体间的基因流第67-68页
     ·群体间的遗传距离第68-69页
     ·中性检验和不配对分析第69-74页
6 分析与讨论第74-82页
   ·Lentinula属的自然分布与研究样本的代表性第74-75页
   ·Lentinula属的系统发育格局第75-76页
   ·谱系Ⅴ作为亚洲主流谱系地位的确立第76页
   ·Lentinula属系统发育格局与传统分类的对照第76-77页
   ·中国(亚洲)群体是宏观谱系层次上的遗传多样性中心第77页
   ·以亚洲为主的东半球范围内各群体的遗传多样性差异第77-78页
   ·群体遗传结构下东半球的居群关系及演化推断第78-80页
   ·谱系的分歧与分子钟的校正第80-81页
   ·亚洲群体的谱系分布与自然条件的关系第81-82页
   ·亚洲Lentinula属群体自然种质的保护第82页
7 结论第82-85页
创新点第85-86页
参考文献第86-96页
致谢第96-98页
在读期间发表文章第98-99页
附录1第99-108页
附录2第108-115页

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