蛋白质分子自然构象和二级结构的计算分析及预测
| 学位论文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第1章 课题研究背景 | 第8-28页 |
| ·课题的意义 | 第8-9页 |
| ·保持蛋白质分子结构的原子间相互作用 | 第9-11页 |
| ·原子间的势 | 第10-11页 |
| ·稳定蛋白质分子三维结构的作用力 | 第11页 |
| ·蛋白质分子的结构 | 第11-22页 |
| ·氨基酸——蛋白质分子的基础构件 | 第13-15页 |
| ·氨基酸的分类与氨基酸的连接——肽键 | 第15-18页 |
| ·蛋白质的一级结构 | 第18页 |
| ·蛋白质的二级结构 | 第18-21页 |
| ·超二级结构和结构域 | 第21-22页 |
| ·蛋白质的三级结构 | 第22页 |
| ·蛋白质结构的测定 | 第22页 |
| ·蛋白质结构预测的方法 | 第22-26页 |
| ·基于模板的蛋白质结构预测方法 | 第23-24页 |
| ·从头预测方法 | 第24-25页 |
| ·蛋白质二级结构预测 | 第25-26页 |
| ·论文的研究内容 | 第26-28页 |
| 第2章 蛋白质折叠的toy模型计算分析 | 第28-64页 |
| ·模拟蛋白质折叠的力场简化模型的发展 | 第28-30页 |
| ·toy二维模型简介 | 第30-32页 |
| ·提高计算速度方法的分析 | 第32-33页 |
| ·遗传算法简述 | 第33-46页 |
| ·王朝更替策略和皇室通婚策略 | 第46-48页 |
| ·王朝更替和皇室通婚策略遗传算法的数值计算 | 第48-55页 |
| ·进化规划中的变异算子 | 第55-56页 |
| ·杂合进化算法 | 第56页 |
| ·基于杂合进化算法的标准测试函数数值计算 | 第56-60页 |
| ·基于杂合进化算法的蛋白质能量最小化算例和结果 | 第60-62页 |
| ·小结 | 第62-64页 |
| 第3章 蛋白质结构二级预测的短序列统计方法 | 第64-86页 |
| ·Chou-Fasman方法 | 第64-68页 |
| ·GOR方法 | 第68-70页 |
| ·基于短序列的统计方法 | 第70-85页 |
| ·小结 | 第85-86页 |
| 第4章 总结和展望 | 第86-89页 |
| ·本文所作的主要工作 | 第86页 |
| ·贡献及创新点 | 第86-87页 |
| ·对本工作的展望 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-98页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 附录A | 第100-101页 |
| 附录B | 第101-103页 |
| 附录C | 第103-104页 |
| 附录D | 第104-108页 |
| 附录E | 第108-109页 |
| 附录F | 第109-110页 |
