摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-12页 |
第一篇 酿酒酵母AR09的结构生物学研究 | 第12-78页 |
第一章 研究背景综述 | 第13-34页 |
·5-磷酸吡哆醛依赖酶简介 | 第13-20页 |
·转氨酶简介 | 第20-25页 |
·第一亚类转氨酶 | 第25-29页 |
·酿酒酵母ARO9简介 | 第29-34页 |
第二章 实验材料、设备和方法 | 第34-45页 |
·ARO9蛋白的基因克隆 | 第34-36页 |
·ARO9蛋白的载体构建 | 第36-41页 |
·ARO9的重组表达及纯化 | 第41-43页 |
·蛋白理化性质的研究 | 第43-44页 |
·晶体生长和数据收集 | 第44页 |
·晶体结构解析与分析 | 第44-45页 |
第三章 结果与讨论 | 第45-70页 |
·ARO9表达载体的构建 | 第45-47页 |
·引物设计 | 第45页 |
·ARO9基因的PCR扩增 | 第45页 |
·酶切、连接和重组质粒的构建 | 第45-47页 |
·ARO9在E.coli中的表达和纯化 | 第47-50页 |
·ARO9在原核表达系统中的表达情况 | 第47页 |
·ARO9的纯化和浓缩 | 第47-48页 |
·ARO9在溶液中聚集状态的测定 | 第48-50页 |
·ARO9转氨酶活性分析 | 第50-52页 |
·转氨酶活性测定体系 | 第50页 |
·ARO9转氨酶作用动力学性质的分析 | 第50-52页 |
·ARO9的初步晶体学研究 | 第52-53页 |
·ARO9的晶体生长 | 第52页 |
·衍射数据收集及数据处理 | 第52-53页 |
·晶体结构解析和结构模型的质量分析 | 第53-57页 |
·ARO9蛋白晶体的结构解析 | 第53-54页 |
·ARO9蛋白结构模型质量分析 | 第54-57页 |
·ARO9的结构描述和分析 | 第57-69页 |
·ARO9的整体结构 | 第57页 |
·两个单体分子的结构比较 | 第57-59页 |
·二聚体作用 | 第59-61页 |
·ARO9的类似结构 | 第61-63页 |
·ARO9的活性区域 | 第63-69页 |
·本篇小结 | 第69-70页 |
参考文献 | 第70-78页 |
第二篇 人源紧密连接蛋白ZO-2(Zonula OCCludens-2)的第二个PDZ结构域的结构生物学研究 | 第78-115页 |
第一章 背景介绍 | 第79-91页 |
·PDZ结构域的简介 | 第79-88页 |
·PDZ结构域的结构 | 第79-80页 |
·PDZ结构域的结合功能 | 第80-84页 |
·PDZ蛋白的生物学功能 | 第84-88页 |
·ZO-2的结构和功能 | 第88-91页 |
第二章 ZO-2 PDZ2结构域的表达和纯化 | 第91-94页 |
·ZO-2 PDZ2结构域的表达 | 第91-92页 |
·ZO-2 PDZ2的纯化 | 第92-94页 |
第三章 ZO-2 PDZ2结构域的晶体结构测定 | 第94-99页 |
·ZO-2 PDZ2晶体生长条件的筛选和优化 | 第94页 |
·ZO-2 PDZ2晶体的数据收集及处理 | 第94-95页 |
·ZO-2 PDZ2晶体的结构模型的构建和修正 | 第95页 |
·ZO-2 PDZ2结构模型质量分析 | 第95-99页 |
第四章 ZO-2 PDZ2结构域的晶体结构分析 | 第99-107页 |
·ZO-2 PDZ2整体结构描述 | 第99-100页 |
·ZO-2 PDZ2同二体的作用界面 | 第100-102页 |
·与同源结构的比较 | 第102-103页 |
·和ZO-1 PDZ2小肽结合区的比较 | 第103-104页 |
·4.5 ZO-2 PDZ2与Connexin43的C端序列结合机制的推测 | 第104-106页 |
·结论 | 第106-107页 |
参考文献 | 第107-115页 |
附录 | 第115-117页 |
在读期间发表的学术论文 | 第117-118页 |
致谢 | 第118页 |