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酿酒酵母ARO9和人源ZO-2蛋白PDZ2结构域的结构生物学研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一篇 酿酒酵母AR09的结构生物学研究第12-78页
 第一章 研究背景综述第13-34页
   ·5-磷酸吡哆醛依赖酶简介第13-20页
   ·转氨酶简介第20-25页
   ·第一亚类转氨酶第25-29页
   ·酿酒酵母ARO9简介第29-34页
 第二章 实验材料、设备和方法第34-45页
   ·ARO9蛋白的基因克隆第34-36页
   ·ARO9蛋白的载体构建第36-41页
   ·ARO9的重组表达及纯化第41-43页
   ·蛋白理化性质的研究第43-44页
   ·晶体生长和数据收集第44页
   ·晶体结构解析与分析第44-45页
 第三章 结果与讨论第45-70页
   ·ARO9表达载体的构建第45-47页
     ·引物设计第45页
     ·ARO9基因的PCR扩增第45页
     ·酶切、连接和重组质粒的构建第45-47页
   ·ARO9在E.coli中的表达和纯化第47-50页
     ·ARO9在原核表达系统中的表达情况第47页
     ·ARO9的纯化和浓缩第47-48页
     ·ARO9在溶液中聚集状态的测定第48-50页
   ·ARO9转氨酶活性分析第50-52页
     ·转氨酶活性测定体系第50页
     ·ARO9转氨酶作用动力学性质的分析第50-52页
   ·ARO9的初步晶体学研究第52-53页
     ·ARO9的晶体生长第52页
     ·衍射数据收集及数据处理第52-53页
   ·晶体结构解析和结构模型的质量分析第53-57页
     ·ARO9蛋白晶体的结构解析第53-54页
     ·ARO9蛋白结构模型质量分析第54-57页
   ·ARO9的结构描述和分析第57-69页
     ·ARO9的整体结构第57页
     ·两个单体分子的结构比较第57-59页
     ·二聚体作用第59-61页
     ·ARO9的类似结构第61-63页
     ·ARO9的活性区域第63-69页
   ·本篇小结第69-70页
 参考文献第70-78页
第二篇 人源紧密连接蛋白ZO-2(Zonula OCCludens-2)的第二个PDZ结构域的结构生物学研究第78-115页
 第一章 背景介绍第79-91页
   ·PDZ结构域的简介第79-88页
     ·PDZ结构域的结构第79-80页
     ·PDZ结构域的结合功能第80-84页
     ·PDZ蛋白的生物学功能第84-88页
   ·ZO-2的结构和功能第88-91页
 第二章 ZO-2 PDZ2结构域的表达和纯化第91-94页
   ·ZO-2 PDZ2结构域的表达第91-92页
   ·ZO-2 PDZ2的纯化第92-94页
 第三章 ZO-2 PDZ2结构域的晶体结构测定第94-99页
   ·ZO-2 PDZ2晶体生长条件的筛选和优化第94页
   ·ZO-2 PDZ2晶体的数据收集及处理第94-95页
   ·ZO-2 PDZ2晶体的结构模型的构建和修正第95页
   ·ZO-2 PDZ2结构模型质量分析第95-99页
 第四章 ZO-2 PDZ2结构域的晶体结构分析第99-107页
   ·ZO-2 PDZ2整体结构描述第99-100页
   ·ZO-2 PDZ2同二体的作用界面第100-102页
   ·与同源结构的比较第102-103页
   ·和ZO-1 PDZ2小肽结合区的比较第103-104页
   ·4.5 ZO-2 PDZ2与Connexin43的C端序列结合机制的推测第104-106页
   ·结论第106-107页
 参考文献第107-115页
附录第115-117页
在读期间发表的学术论文第117-118页
致谢第118页

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