| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-34页 |
| ·植物转座子概述 | 第12-15页 |
| ·植物反转录转座子的类型、结构和特点 | 第13-14页 |
| ·植物DNA转座子的类型、结构和特点 | 第14-15页 |
| ·Mutator转座子 | 第15-27页 |
| ·Mutator转座子及其家族的发现 | 第15-16页 |
| ·Mu转座子及其家族 | 第16-18页 |
| ·Mu转座子的功能域 | 第18-20页 |
| ·Mu转座子的转座活动 | 第20-21页 |
| ·Mu转座子转座活动的主要方式 | 第20页 |
| ·Mu转座子的插入位点特征 | 第20-21页 |
| ·Mu转座子的沉默与表观调控 | 第21-23页 |
| ·Mu转座子的甲基化与Mu转座子沉默 | 第22-23页 |
| ·RNA与Mu转座子的沉默 | 第23页 |
| ·玉米以外的植物基因组中MULEs转座子 | 第23-25页 |
| ·MULEs广泛存在于玉米以外的植物基因组中 | 第23-24页 |
| ·玉米以外的植物中MULEs的转录表达 | 第24页 |
| ·Mu转座子同源基因的演化 | 第24-25页 |
| ·Mu转座子在植物基因和基因组进化中的作用 | 第25-26页 |
| ·Mu转座子的应用 | 第26-27页 |
| ·水平转移及其研究进展 | 第27-31页 |
| ·水平转移概述 | 第27页 |
| ·基因水平转移的判断标准 | 第27页 |
| ·基因水平转移特点 | 第27-29页 |
| ·普遍性 | 第27-28页 |
| ·非特异性 | 第28页 |
| ·转座序列和原核生物的插入序列易于发生水平转移 | 第28-29页 |
| ·水平转移与环境的关系 | 第29页 |
| ·真核生物中基因水平转移 | 第29-30页 |
| ·基因水平转移在基因组进化中的作用 | 第30-31页 |
| ·加快基因组的进化速度 | 第30页 |
| ·促进生物的进化 | 第30-31页 |
| ·狗尾草属和稻属植物简介 | 第31页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第31-34页 |
| 2 狗尾草属植物MULEs的克隆以及进化分析 | 第34-53页 |
| ·材料和试剂 | 第34-35页 |
| ·材料 | 第34-35页 |
| ·试剂 | 第35页 |
| ·实验方法 | 第35-40页 |
| ·植物基因组DNA的提取 | 第35页 |
| ·狗尾草属植物全长MULEs的PCR扩增 | 第35-36页 |
| ·狗尾草属植物全长MULEs旁侧序列的PCR扩增 | 第36-38页 |
| ·PCR产物的纯化 | 第38页 |
| ·目的片段与T载体(pGEM-T)的连接 | 第38-39页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第39页 |
| ·连接产物的转化 | 第39页 |
| ·阳性克隆的鉴定 | 第39-40页 |
| ·测序 | 第40页 |
| ·实验结果及分析 | 第40-53页 |
| ·狗尾草属不同材料MULEs全长及其旁侧序列PCR克隆 | 第40-45页 |
| ·狗尾草属不同材料MULEs全长PCR克隆 | 第40页 |
| ·狗尾草属MULEs全长旁侧序列PCR克隆 | 第40-41页 |
| ·狗尾草属不同种MULE转座子测序结果 | 第41-42页 |
| ·狗尾草属MULEs旁侧序列测序结果 | 第42-45页 |
| ·狗尾草属不同种MULEs片段结果分析 | 第45-53页 |
| ·狗尾草属Mu转座子两端TIR同源性及其结构分析 | 第45-47页 |
| ·狗尾草属转座酶编码区分析 | 第47-51页 |
| ·狗尾草属MULE旁侧序列分析 | 第51-53页 |
| 3 MULEs在稻属和狗尾草属的进化关系和水平转移分析 | 第53-68页 |
| ·材料 | 第53-55页 |
| ·方法 | 第55-56页 |
| ·结果与分析 | 第56-68页 |
| ·狗尾草属和稻属PCR及测序结果 | 第56-59页 |
| ·狗尾草属不同材料PCR结果 | 第56页 |
| ·稻属不同材料PCR结果 | 第56-57页 |
| ·狗尾草属和稻属测序结果 | 第57-59页 |
| ·稻属和狗尾草属不同种MULEs的分布 | 第59-66页 |
| ·狗尾草属和稻属中MULE转座子的分布及其水平转移 | 第66-68页 |
| 4 讨论 | 第68-73页 |
| ·狗尾草属中MULEs的克隆及其分析 | 第68-70页 |
| ·狗尾草属MULEs片段旁侧序列 | 第70页 |
| ·MULE转座子广泛存在于狗尾草属和稻属植物中 | 第70-71页 |
| ·MULEs在稻属和狗尾草属中可能发生了大量的基因水平转移 | 第71-73页 |
| 5 结论 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 附录 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 攻读学位期间取得的科研成果清单 | 第84页 |
