| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-20页 |
| 第1章 绪论 | 第20-56页 |
| ·研究背景 | 第20-37页 |
| ·蛋白质折叠、误折叠、淀粉样化病 | 第20-22页 |
| ·淀粉样化纤维的晶体结构 | 第22-25页 |
| ·短多肽积聚的动力学研究简介 | 第25-33页 |
| ·尿素对于肽链积聚的影响简介 | 第33-34页 |
| ·尿素诱导蛋白质变性机制研究简介 | 第34-35页 |
| ·碳纳米管与蛋白质相互作用研究简介 | 第35-37页 |
| ·研究方法简介 | 第37-42页 |
| ·什么是分子动力学模拟 | 第37-39页 |
| ·分子动力学的优缺点 | 第39-40页 |
| ·力场 | 第40-42页 |
| ·模拟软件 | 第42页 |
| ·研究内容及意义 | 第42-46页 |
| ·论文组织结构 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-56页 |
| 第2章 人类胰岛淀粉样多肽NFGAIL片段积聚的理论研究 | 第56-85页 |
| ·研究背景 | 第57-61页 |
| ·研究模型及方法 | 第61-65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-80页 |
| ·单体系统 | 第65-68页 |
| ·四体系统 | 第68-77页 |
| ·成核生长系统 | 第77-80页 |
| ·本章小结 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-85页 |
| 第3章 NFGAIL原纤维丝自组装过程中的去浸润相变及不同界面形态的重要性 | 第85-110页 |
| ·研究背景 | 第86-89页 |
| ·研究模型和方法 | 第89-93页 |
| ·结果和讨论 | 第93-105页 |
| ·浸润和去浸润模拟 | 第93-96页 |
| ·自组装模拟 | 第96-103页 |
| ·“A25I”突变系统模拟 | 第103-105页 |
| ·本章小结 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-110页 |
| 第4章 酵母朊病毒Sup35多肽片段GNNQQNY二聚化过程的理论研究 | 第110-136页 |
| ·研究背景 | 第110-114页 |
| ·研究模型及方法 | 第114-116页 |
| ·复本交换方法 | 第114-115页 |
| ·模拟系统 | 第115-116页 |
| ·研究结果及讨论 | 第116-131页 |
| ·GNNQQNY单体的构象特性 | 第116-119页 |
| ·二聚化的自由能面 | 第119-123页 |
| ·原生型contact的概率分布 | 第123-125页 |
| ·二聚化机制的研究 | 第125-128页 |
| ·肽链骨架的contact图谱 | 第128-130页 |
| ·二聚化过程中水分子的作用 | 第130-131页 |
| ·本章小结 | 第131-133页 |
| 参考文献 | 第133-136页 |
| 第5章 不同浓度的尿素溶液对于人类胰岛淀粉样多肽(hIAPP_(22-27))积聚早期的影响 | 第136-166页 |
| ·研究背景 | 第137-140页 |
| ·研究模型及方法 | 第140-144页 |
| ·结果和讨论 | 第144-162页 |
| ·尿素溶液对于NFGAIL单体结构的影响 | 第144-150页 |
| ·不同浓度的尿素溶液对于NFGAIL肽链早期积聚的影响 | 第150-162页 |
| ·本章小结 | 第162-163页 |
| 参考文献 | 第163-166页 |
| 第6章 尿素诱导蛋白质变性机制的研究 | 第166-184页 |
| ·研究背景 | 第167-169页 |
| ·研究模型及方法 | 第169-170页 |
| ·结果与讨论 | 第170-180页 |
| ·尿素在蛋白第一水合层中取代水 | 第170-171页 |
| ·能量分析 | 第171-180页 |
| ·本章小节 | 第180-181页 |
| 参考文献 | 第181-184页 |
| 第7章 分子力学及量子力学方法对于刻画氨基酸类似物与碳纳米管间π-π相互作用的比较研究 | 第184-197页 |
| ·研究背景 | 第185-187页 |
| ·研究模型及方法 | 第187-190页 |
| ·结果与讨论 | 第190-192页 |
| ·本章小结 | 第192-193页 |
| 参考文献 | 第193-197页 |
| 第8章 总结与展望 | 第197-201页 |
| ·本学位论文的总结 | 第197-199页 |
| ·本学位论文的展望 | 第199-201页 |
| 攻读学位期间发表及待发表的学术论文 | 第201-202页 |
| 致谢 | 第202页 |
