| 摘要 | 第1-13页 |
| ABSTRACT | 第13-16页 |
| 缩略词表 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-35页 |
| 1 标记辅助选择研究进展 | 第17-21页 |
| ·标记辅助选择概述 | 第17页 |
| ·标记辅助选择的基本策略 | 第17-18页 |
| ·影响标记辅助选择效率的因素 | 第18-19页 |
| ·遗传标记的种类 | 第19-20页 |
| ·标记辅助选择在动物育种中的应用 | 第20-21页 |
| ·猪育种 | 第20页 |
| ·牛育种 | 第20页 |
| ·鸡育种 | 第20-21页 |
| 2 多基因聚合选择 | 第21-23页 |
| ·基因聚合概念 | 第21页 |
| ·基因聚合在植物中的应用 | 第21-22页 |
| ·水稻育种 | 第21-22页 |
| ·小麦育种 | 第22页 |
| ·基因聚合在动物中的应用 | 第22-23页 |
| 3 拟研究的主要候选基因 | 第23-27页 |
| ·黑素皮质素受体 | 第23页 |
| ·脂肪酸结合蛋白 | 第23-25页 |
| ·瘦素 | 第25页 |
| ·钙蛋白酶抑制蛋白 | 第25-26页 |
| ·肌细胞生成素 | 第26页 |
| ·氟烷基因 | 第26-27页 |
| 4 Lbx基因家族 | 第27-29页 |
| ·Lbx基因概述 | 第27页 |
| ·Lbx1基因 | 第27-29页 |
| ·Lbx1基因与骨骼肌发育 | 第27-28页 |
| ·Lbx1基因与心脏发育 | 第28页 |
| ·Lbx1基因与神经发育 | 第28-29页 |
| ·Lbx1基因与癌症 | 第29页 |
| ·Lbx2基因 | 第29页 |
| 5 DNA甲基化 | 第29-35页 |
| ·表观遗传学 | 第29-30页 |
| ·DNA甲基化概述 | 第30-31页 |
| ·DNA甲基转移酶 | 第31页 |
| ·DNA甲基化与CpG岛 | 第31-32页 |
| ·DNA甲基化的生物学功能 | 第32-33页 |
| ·DNA甲基化与基因表达 | 第32页 |
| ·DNA甲基化与肿瘤 | 第32页 |
| ·DNA甲基化与衰老 | 第32页 |
| ·DNA甲基化的其它功能 | 第32-33页 |
| ·DNA甲基化的检测方法 | 第33-35页 |
| ·基因组整体甲基化分析 | 第33页 |
| ·特定区域及位点甲基化分析 | 第33-35页 |
| 第二章 目的与意义 | 第35-36页 |
| 第三章 多基因标记辅助选择 | 第36-60页 |
| 1 试验材料 | 第36-38页 |
| ·试验样品与性状测定 | 第36页 |
| ·主要仪器设备 | 第36-37页 |
| ·工具酶及主要试剂 | 第37页 |
| ·主要溶液的配制 | 第37-38页 |
| 2 试验方法 | 第38-42页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·猪血液基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·基因组DNA浓度测定和质量检测 | 第39页 |
| ·候选基因引物设计与合成 | 第39-40页 |
| ·六个候选基因的PCR扩增 | 第40页 |
| ·六个候选基因的PCR-RFLP分析 | 第40-41页 |
| ·数据处理分析 | 第41-42页 |
| ·基因频率及基因型频率 | 第41页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第41-42页 |
| ·基因效应分析 | 第42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-54页 |
| ·猪血液基因组DNA的提取 | 第42页 |
| ·六个候选基因的PCR扩增 | 第42-44页 |
| ·六个候选基因的PCR-RFLP分析 | 第44-46页 |
| ·六个候选基因在猪D_(IV2)系中的基因型分布 | 第46-47页 |
| ·六个候选基因在猪D_(IV2)系中的遗传效应分析 | 第47-50页 |
| ·MC4R,LEP,H-FABP基因在不同猪种中的分布及连锁不平衡分析 | 第50-54页 |
| ·MC4R,LEP,H-FABP基因在不同猪种中的分布 | 第50-51页 |
| ·MC4R,LEP,H-FABP基因间连锁不平衡分析 | 第51-54页 |
| 4 讨论 | 第54-58页 |
| ·D_(IV2)系的来源 | 第54页 |
| ·MC4R基因的遗传效应 | 第54-55页 |
| ·LEP基因的遗传效应 | 第55-56页 |
| ·H-FABP基因的遗传效应 | 第56页 |
| ·CAST和MyoG基因的遗传效应 | 第56-57页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第57页 |
| ·多基因标记辅助选择的基因聚合 | 第57-58页 |
| 5 本章小结 | 第58-60页 |
| 第四章 Lbx基因家族的分子生物学研究 | 第60-99页 |
| 1 试验材料 | 第60-63页 |
| ·试验样品与性状测定 | 第60页 |
| ·血液DNA样品 | 第60页 |
| ·组织样品 | 第60页 |
| ·细胞 | 第60页 |
| ·主要仪器设备 | 第60-61页 |
| ·工具酶及主要试剂 | 第61-62页 |
| ·主要溶液的配制 | 第62-63页 |
| 2 试验方法 | 第63-72页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第63页 |
| ·猪血液基因组DNA的提取 | 第63页 |
| ·猪组织基因组DNA的提取 | 第63页 |
| ·猪总RNA的提取及cDNA的合成 | 第63-64页 |
| ·总RNA的提取 | 第63-64页 |
| ·总RNA质量检测 | 第64页 |
| ·cDNA的合成 | 第64页 |
| ·细胞培养 | 第64-65页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因DNA和cDNA序列的克隆及分析 | 第65-67页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因扩增引物设计 | 第65-66页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因的PCR扩增 | 第66页 |
| ·PCR产物的回收和克隆测序 | 第66-67页 |
| ·生物信息学分析 | 第67页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因组织表达分析 | 第67-68页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因组织表达谱分析 | 第67-68页 |
| ·猪Lbx1基因在背最长肌中的时空表达分析 | 第68页 |
| ·猪Lbx1基因在不同类型肌肉组织中的表达分析 | 第68页 |
| ·Lbx1基因多态性检测 | 第68-69页 |
| ·猪Lbx1基因SNP扫描 | 第68-69页 |
| ·猪Lbx1基因在中外猪种中的多态性分析 | 第69页 |
| ·Lbx1基因遗传效应分析 | 第69页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因甲基化密度检测 | 第69-71页 |
| ·亚硫酸氢钠处理基因组DNA | 第69-70页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因甲基化分析引物 | 第70-71页 |
| ·PCR扩增、产物回收和克隆测序 | 第71页 |
| ·Lbx1、Pax7和MRF基因家族在C2C12细胞分化过程中的表达分析 | 第71页 |
| ·Lbx1、Pax7和MRF基因家族在C2C12细胞分化过程中的甲基化分析 | 第71-72页 |
| 3 结果与分析 | 第72-92页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第72-73页 |
| ·猪组织总RNA的提取 | 第73页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因DNA和cDNA序列的克隆及分析 | 第73-78页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因分子特征 | 第73-74页 |
| ·猪Lbx1基因生物信息学分析 | 第74-76页 |
| ·猪Lbx2基因生物信息学分析 | 第76-78页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因组织表达分析 | 第78-81页 |
| ·猪Lbx1和Lbx2基因组织表达谱分析 | 第78-79页 |
| ·猪Lbx1基因在背最长肌中的时空表达分析 | 第79-80页 |
| ·猪Lbx1基因在不同类型肌肉组织中的表达分析 | 第80-81页 |
| ·Lbx1和Lbx2基因甲基化密度检测 | 第81-84页 |
| ·猪Lbx1基因甲基化分析 | 第81-83页 |
| ·猪Lbx2基因甲基化分析 | 第83-84页 |
| ·Lbx1基因多态性检测 | 第84-86页 |
| ·猪Lbx1基因内含子TaqⅠ酶切位点多态性检测结果 | 第85页 |
| ·猪Lbx1基因启动子区AccⅡ酶切位点多态性检测结果 | 第85-86页 |
| ·Lbx1基因遗传效应分析 | 第86-88页 |
| ·Lbx1、Pax7和MRF基因家族在C2C12细胞分化过程中的表达分析 | 第88页 |
| ·Lbx1、Pax7和MRF基因家族在C2C12细胞分化过程中的甲基化分析 | 第88-92页 |
| ·Lbxl基因甲基化分析 | 第88-89页 |
| ·MyoD基因甲基化分析 | 第89-90页 |
| ·Myf5基因甲基化分析 | 第90-91页 |
| ·Pax7基因甲基化分析 | 第91-92页 |
| 4 讨论 | 第92-97页 |
| ·猪Lbx1与Lbx2基因组织表达分析 | 第92-93页 |
| ·猪Lbx1基因在肌肉组织中的时空表达 | 第93-94页 |
| ·猪Lbx1基因在不同类型肌纤维中的表达 | 第94页 |
| ·猪Lbx1与Lbx2基因的甲基化模式 | 第94-95页 |
| ·猪Lbx1基因与胴体、肉质性状 | 第95-96页 |
| ·Lbx1、Pax7和MRFs在C2C12中的表达与甲基化分析 | 第96-97页 |
| 5 本章小结 | 第97-99页 |
| 参考文献 | 第99-115页 |
| 博士在读期间发表论文 | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116页 |
