基于cpDNA单倍型和SSR分析的银杏群体遗传结构和谱系地理学研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 1 前言 | 第12-33页 |
| ·谱系地理学简介 | 第12-16页 |
| ·谱系地理学的提出及内容 | 第12-13页 |
| ·谱系地理学的相关理论 | 第13-16页 |
| ·银杏的生物学特性及研究现状 | 第16-30页 |
| ·银杏的生物学特性 | 第16-17页 |
| ·银杏的研究现状 | 第17-28页 |
| ·中国有无野生银杏群体的争论 | 第28-30页 |
| ·存在的问题 | 第30-31页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第31-33页 |
| 2 银杏野外调查及材料采集 | 第33-41页 |
| ·调查时间和采集方法 | 第33-34页 |
| ·银杏取样地生境 | 第34-41页 |
| ·甘肃徽县 | 第34-36页 |
| ·河南新县 | 第36页 |
| ·安徽金寨 | 第36-38页 |
| ·广东韶关 | 第38页 |
| ·湖南壶瓶山 | 第38-39页 |
| ·湖北神农架 | 第39页 |
| ·江苏宝华山 | 第39页 |
| ·日本 | 第39-41页 |
| 3 cpDNA单倍型分析 | 第41-64页 |
| ·材料 | 第41页 |
| ·实验方法 | 第41-46页 |
| ·DNA提取 | 第42-43页 |
| ·引物筛选 | 第43-44页 |
| ·PCR扩增及测序 | 第44-45页 |
| ·数据分析 | 第45-46页 |
| ·实验结果 | 第46-55页 |
| ·序列信息与单倍型分布特点 | 第46-48页 |
| ·遗传多样性和遗传结构分析 | 第48-50页 |
| ·群体遗传分化分析 | 第50页 |
| ·单倍型谱系分析 | 第50-53页 |
| ·群体历史分析 | 第53-55页 |
| ·讨论 | 第55-64页 |
| ·遗传多样性及遗传结构 | 第55-56页 |
| ·冰期避难所推测 | 第56-61页 |
| ·群体历史分析 | 第61-62页 |
| ·人类活动对银杏群体遗传结构的影响 | 第62-64页 |
| 4 微卫星标记的筛选 | 第64-88页 |
| ·实验方法 | 第66-74页 |
| ·检测已发表银杏微卫星引物的有效性 | 第66页 |
| ·对已发表的近缘物种的引物进行筛选 | 第66页 |
| ·用已有的EST序列进行微卫星引物筛选 | 第66-67页 |
| ·磁珠富集法获取银杏微卫星序列 | 第67-74页 |
| ·数据判读与分析 | 第74页 |
| ·实验结果 | 第74-84页 |
| ·已有引物的有效性 | 第74-76页 |
| ·松科引物扩增结果 | 第76页 |
| ·EST-SSR扩增结果 | 第76-77页 |
| ·磁珠富集法实验结果 | 第77-84页 |
| ·数据分析及相关讨论 | 第84-88页 |
| ·遗传多样性分析 | 第84-85页 |
| ·位点间连锁不平衡检测和哈温平衡检测 | 第85-86页 |
| ·微卫星引物筛选应注意的问题 | 第86-88页 |
| 5 基于SSR的银杏群体遗传结构分析 | 第88-117页 |
| ·材料 | 第89页 |
| ·实验方法 | 第89-94页 |
| ·DNA提取 | 第89页 |
| ·引物筛选 | 第89-91页 |
| ·数据判读及分析 | 第91-94页 |
| ·实验结果 | 第94-107页 |
| ·银杏群体遗传多样性 | 第94-99页 |
| ·群体遗传结构分析 | 第99-104页 |
| ·瓶颈效应检测 | 第104-106页 |
| ·空间遗传结构分析 | 第106-107页 |
| ·群体间遗传分化 | 第107页 |
| ·群体间基因流 | 第107页 |
| ·讨论 | 第107-117页 |
| ·遗传多样性和群体遗传结构 | 第107-111页 |
| ·冰期避难所 | 第111-112页 |
| ·冰期后扩张路线 | 第112-113页 |
| ·国内外栽培群体来源及人为活动干扰 | 第113-117页 |
| 6 避难所银杏群体的生存现状及保护策略 | 第117-127页 |
| ·贵州务川的银杏群体 | 第117-119页 |
| ·浙江西天目山的银杏群体 | 第119-121页 |
| ·cpDNA分析 | 第120页 |
| ·SSR分析 | 第120-121页 |
| ·避难所银杏群体的保护现状 | 第121-127页 |
| ·避难所之间银杏群体的遗传多样性比较 | 第121-122页 |
| ·银杏保护策略的制定 | 第122-124页 |
| ·天目山自然保护区的保护现状 | 第124-127页 |
| 7 总结与展望 | 第127-132页 |
| ·总结 | 第127-129页 |
| ·展望 | 第129-132页 |
| 参考文献 | 第132-154页 |
| 发表和拟发表的论文 | 第154-155页 |
| 致谢 | 第155-156页 |
