| 摘要 | 第2-5页 |
| Summary | 第5-8页 |
| 缩略词表 | 第8-12页 |
| 第一章 研究背景与文献综述 | 第12-37页 |
| 1.1 维管组织发生活动样式 | 第12-21页 |
| 1.1.1 原形成层的起始和分化 | 第14-15页 |
| 1.1.2 形成层分化中表现出细胞分化的阶段性 | 第15-18页 |
| 1.1.3 韧皮部的发育和演化过程 | 第18-19页 |
| 1.1.4 木质部的发育和演化过程 | 第19-21页 |
| 1.2 维管形成层细胞的分裂及结果 | 第21-22页 |
| 1.3 果胶及果胶甲基脂酶研究概况 | 第22-27页 |
| 1.3.1 植物细胞壁中果胶结构和功能 | 第22-23页 |
| 1.3.2 植物细胞壁中果胶甲脂酶结构和功能 | 第23-24页 |
| 1.3.3 果胶及果胶甲酯酶在植物中的研究进展 | 第24-25页 |
| 1.3.4 果胶免疫标记与维管发育 | 第25-27页 |
| 1.4 杨树PMES家族进化树分析 | 第27-29页 |
| 1.5 高通量测序技术 | 第29-34页 |
| 1.5.1 RNA-seq | 第30页 |
| 1.5.2 RNA-seq测序文库制备 | 第30-31页 |
| 1.5.3 测序平台数据输出 | 第31-32页 |
| 1.5.4 RNA-seq数据基本处理 | 第32-33页 |
| 1.5.5 基因差异表达水平评估 | 第33页 |
| 1.5.6 RNA-seq技术在植物研究领域的应用 | 第33-34页 |
| 1.6 PCR扩增反应 | 第34-37页 |
| 第二章 实验方法 | 第37-51页 |
| 2.1 实验的目的及意义 | 第37页 |
| 2.2 杨树取材 | 第37页 |
| 2.3 冰冻切片 | 第37-38页 |
| 2.4 组织切片 | 第38-39页 |
| 2.4.1 半薄切片 | 第38-39页 |
| 2.4.2 徒手切片 | 第39页 |
| 2.5 免疫标记反应 | 第39-40页 |
| 2.6 植物总RNA提取和反转录成第一链CDNA的反应 | 第40-41页 |
| 2.6.1 总RNA提取反应 | 第40页 |
| 2.6.2 RNA通过反转录反应获得第一链c DNA | 第40-41页 |
| 2.7 RNA测序 | 第41-47页 |
| 2.7.1 测序材料的选取 | 第41-42页 |
| 2.7.2 RNA样品纯度检验 | 第42-43页 |
| 2.7.3 文库的构建 | 第43-44页 |
| 2.7.4 测序及数据统计 | 第44-46页 |
| 2.7.5 测序质量评估 | 第46页 |
| 2.7.6 基因表达水平估计 | 第46页 |
| 2.7.7 基因差异表达水平分析 | 第46-47页 |
| 2.8 引物设计和内参基因选择 | 第47-48页 |
| 2.9 Real-time qRT-PCR检测 | 第48页 |
| 2.10 杨树PMES家族生物信息学分析 | 第48-51页 |
| 2.10.1 杨树PMEs基因家族成员基因收集与鉴定 | 第48-49页 |
| 2.10.2 序列分析与进化树的构建 | 第49页 |
| 2.10.3 杨树PMEs基因家族成员蛋白序列等电点与分子量分析 | 第49-50页 |
| 2.10.4 染色体定位分析 | 第50页 |
| 2.10.5 功能富集分析与通路分析 | 第50-51页 |
| 第三章 实验结果 | 第51-77页 |
| 3.1 杨树PMES家族生物信息学分析 | 第51-60页 |
| 3.1.1 杨树PMEs基因家族成员的鉴定与染色体分布 | 第51-53页 |
| 3.1.2 多序列比对与结构分析 | 第53-57页 |
| 3.1.3 基因功能富集分析与通路分析 | 第57-60页 |
| 3.2 维管组织的解剖学观察 | 第60-62页 |
| 3.3 毛白杨维管组织不同发育阶段果胶成分的免疫标记 | 第62-68页 |
| 3.3.1 免疫反应不加一抗标记结果 | 第62-64页 |
| 3.3.2 识别低甲酯化HGA的单克隆抗体JIM5 的标记结果 | 第64-65页 |
| 3.3.3 识别高甲酯化HGA的单克隆抗体JIM7 的标记结果 | 第65-66页 |
| 3.3.4 识别RG-Ⅰ半乳聚糖侧链的单克隆抗体LM5 标记结果 | 第66-67页 |
| 3.3.5 识别RG-Ⅰ阿拉伯聚糖侧链的单克隆抗体LM6 标记结果 | 第67-68页 |
| 3.4 PMES基因家族序列进化树分析 | 第68-71页 |
| 3.5 杨树差异表达基因的获得 | 第71-74页 |
| 3.5.1 样品总RNA提取检测和质量评估 | 第71页 |
| 3.5.2 测序后毛白杨差异表达基因的获得 | 第71-72页 |
| 3.5.3 PMEs家族成员聚类分析及发育阶段表达差异分析 | 第72-74页 |
| 3.6 杨树维管束不同发育阶段PMEs基因RNA-Seq定量分析与差异表达研究… | 第74-75页 |
| 3.7 qRT-PCR对 RNA-seq数据的结果验证 | 第75-77页 |
| 第四章 讨论 | 第77-82页 |
| 4.1 杨树PMES家族生物信息学分析 | 第77页 |
| 4.2 维管组织发生的连续性和阶段性 | 第77-78页 |
| 4.3 杨树基因调控对细胞组织生长影响和PMES家族成员聚类分析 | 第78-79页 |
| 4.4 细胞壁果胶成分的分布与维管组织发育阶段的关系 | 第79-81页 |
| 4.5 筛选PMES基因家族的某些基因在维管分化中的表达变化 | 第81-82页 |
| 第五章 结论与展望 | 第82-84页 |
| 5.1 结论 | 第82-83页 |
| 5.2 展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-98页 |
| 附录 | 第98-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 作者简介 | 第101-102页 |
| 导师简介 | 第102-103页 |
