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呼吸道病毒核酸捕获与富集技术研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩略词表第9-11页
引言第11-21页
1. 实验材料与方法第21-35页
    1.1 实验材料第21-23页
        1.1.1 样本第21-22页
        1.1.2 主要试剂第22-23页
        1.1.3 主要仪器设备第23页
        1.1.4 生物信息分析软件第23页
    1.2 实验方法第23-35页
        1.2.1 探针设计第23-26页
        1.2.2 捕获富集探针的样本制备第26-28页
        1.2.3 建库样本DNA制备第28-30页
        1.2.4 二代测序建库第30-32页
        1.2.5 杂交捕获建库第32-34页
        1.2.6 测序与数据前处理第34页
        1.2.7 统计分析第34-35页
2. 结果第35-67页
    2.1 探针序列库的建立第35-40页
        2.1.1 小RNA病毒科肠道病毒属第35-36页
        2.1.2 冠状病毒第36-37页
        2.1.3 流感病毒第37-38页
        2.1.4 副流感病毒第38页
        2.1.5 呼吸道合胞病毒、偏肺病毒、博卡病毒和腺病毒第38-40页
    2.2 探针的设计第40-48页
        2.2.1 去冗余的序列相似度阈值分析第40-46页
        2.2.2 过滤去除与宿主基因组相似的探针序列第46页
        2.2.3 信息质控第46-48页
    2.3 探针库靶向富集效率分析第48-65页
        2.3.1 测试库制备第48-49页
        2.3.2 富集捕获效率分析第49-65页
    2.4 富集探针在临床样本中的捕获效率分析第65-67页
讨论第67-71页
小结第71-72页
附录第72-74页
参考文献第74-81页
在学期间发表的学术论文第81-82页
致谢第82-83页

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