摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
缩略词表 | 第9-11页 |
引言 | 第11-21页 |
1. 实验材料与方法 | 第21-35页 |
1.1 实验材料 | 第21-23页 |
1.1.1 样本 | 第21-22页 |
1.1.2 主要试剂 | 第22-23页 |
1.1.3 主要仪器设备 | 第23页 |
1.1.4 生物信息分析软件 | 第23页 |
1.2 实验方法 | 第23-35页 |
1.2.1 探针设计 | 第23-26页 |
1.2.2 捕获富集探针的样本制备 | 第26-28页 |
1.2.3 建库样本DNA制备 | 第28-30页 |
1.2.4 二代测序建库 | 第30-32页 |
1.2.5 杂交捕获建库 | 第32-34页 |
1.2.6 测序与数据前处理 | 第34页 |
1.2.7 统计分析 | 第34-35页 |
2. 结果 | 第35-67页 |
2.1 探针序列库的建立 | 第35-40页 |
2.1.1 小RNA病毒科肠道病毒属 | 第35-36页 |
2.1.2 冠状病毒 | 第36-37页 |
2.1.3 流感病毒 | 第37-38页 |
2.1.4 副流感病毒 | 第38页 |
2.1.5 呼吸道合胞病毒、偏肺病毒、博卡病毒和腺病毒 | 第38-40页 |
2.2 探针的设计 | 第40-48页 |
2.2.1 去冗余的序列相似度阈值分析 | 第40-46页 |
2.2.2 过滤去除与宿主基因组相似的探针序列 | 第46页 |
2.2.3 信息质控 | 第46-48页 |
2.3 探针库靶向富集效率分析 | 第48-65页 |
2.3.1 测试库制备 | 第48-49页 |
2.3.2 富集捕获效率分析 | 第49-65页 |
2.4 富集探针在临床样本中的捕获效率分析 | 第65-67页 |
讨论 | 第67-71页 |
小结 | 第71-72页 |
附录 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-81页 |
在学期间发表的学术论文 | 第81-82页 |
致谢 | 第82-83页 |