计算机辅助神经氨酸酶和LIM激酶抑制剂的设计及合成
摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5页 |
第一章 绪论 | 第8-13页 |
1.1 引言 | 第8-12页 |
1.1.1 计算机辅助设计方法概述 | 第8-9页 |
1.1.2 定量构效关系 | 第9页 |
1.1.3 分子对接 | 第9-10页 |
1.1.4 分子动力学模拟 | 第10页 |
1.1.5 结合自由能计算和能量分解 | 第10-12页 |
1.2 计算机辅助设计软件 SYBYL | 第12-13页 |
第二章 神经氨酸酶抑制剂的设计、合成及测试 | 第13-24页 |
2.1 神经氨酸酶 | 第13页 |
2.2 神经氨酸酶抑制剂 | 第13-14页 |
2.3 结果与讨论 | 第14-23页 |
2.3.1 3D-QSAR结果分析 | 第14-17页 |
2.3.2 模型的等势图 | 第17-19页 |
2.3.3 分子对接 | 第19页 |
2.3.4 分子动力学模拟 | 第19-20页 |
2.3.5 设计新神经氨酸酶抑制剂 | 第20-23页 |
2.4 本章小结 | 第23-24页 |
第三章 limk1 抑制剂的设计、合成及生物测试 | 第24-35页 |
3.1 limk1概述 | 第24页 |
3.2 Limk1抑制剂 | 第24-25页 |
3.3 结果与讨论 | 第25-34页 |
3.3.1 分子对接 | 第25-29页 |
3.3.2 分子动力学模拟结果 | 第29-32页 |
3.3.3 MM/GBSA自由能计算及自由能分解 | 第32-33页 |
3.3.4 设计新分子 | 第33-34页 |
3.4 本章小结 | 第34-35页 |
第四章 实验方法 | 第35-41页 |
4.1 3D-QSAR | 第35-36页 |
4.1.1 建立数据集模型 | 第35页 |
4.1.2 CoMFA和CoMSIA模型计算 | 第35-36页 |
4.2 分子对接 | 第36页 |
4.3 分子动力学模拟 | 第36页 |
4.4 结合自由能计算 | 第36-37页 |
4.5 合成实验 | 第37-40页 |
4.6 生物活性测试 | 第40-41页 |
4.6.1 NA抑制剂活性测试 | 第40页 |
4.6.2 limk1抑制剂活性测试 | 第40-41页 |
第五章 全文总结 | 第41-42页 |
参考文献 | 第42-50页 |
致谢 | 第50-51页 |
攻读学位期间所发表的学术论文 | 第51-52页 |
附录 | 第52-61页 |