| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 引言 | 第11-23页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第11-12页 |
| 1.1.1 课题来源 | 第11页 |
| 1.1.2 研究背景和意义 | 第11-12页 |
| 1.1.3 紫花苜蓿 | 第12页 |
| 1.2 植物耐盐分子机制研究进展 | 第12-16页 |
| 1.2.1 离子平衡机制 | 第12-13页 |
| 1.2.2 渗透调节机制 | 第13-14页 |
| 1.2.3 活性氧清除机制 | 第14-15页 |
| 1.2.4 盐胁迫信号转导与调控 | 第15-16页 |
| 1.3 紫花苜蓿耐盐性研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3.1 紫花苜蓿耐盐品种选育进展 | 第16-17页 |
| 1.3.2 紫花苜蓿耐盐调控机理研究进展 | 第17-18页 |
| 1.4 转录组和蛋白质组关联分析在植物抗逆性方面的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.4.1 转录组学 | 第18页 |
| 1.4.2 Illumina转录组测序(RNA–seq)技术应用 | 第18页 |
| 1.4.3 蛋白质组学 | 第18-19页 |
| 1.4.4 蛋白质组(iTRAQ)技术应用 | 第19-20页 |
| 1.5 研究内容和技术路线 | 第20-23页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第20-22页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第22-23页 |
| 2 南方型紫花苜蓿耐盐突变体根部盐胁迫应答差异基因鉴定与分析 | 第23-37页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-24页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.1.1.1 材料与处理 | 第23页 |
| 2.1.1.2 试剂和仪器 | 第23页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第23-24页 |
| 2.1.2.1 RNA的提取与纯化 | 第23-24页 |
| 2.1.2.2 提取RNA的质量检测 | 第24页 |
| 2.1.2.3 构建RNA文库和测序 | 第24页 |
| 2.1.2.4 测序数据过滤 | 第24页 |
| 2.1.2.5 对比参考序列 | 第24页 |
| 2.1.2.6 差异表达基因(DEGs)的筛选 | 第24页 |
| 2.1.2.7 DEGs表达模式聚类分析 | 第24页 |
| 2.1.2.8 DEGEs的GO功能显著性富集分析 | 第24页 |
| 2.1.2.9 DEGs的KEGGPathway显著性富集分析 | 第24页 |
| 2.2 结果与分析 | 第24-36页 |
| 2.2.1 提取RNA的质量检测分析 | 第24-25页 |
| 2.2.2 测序质量分析 | 第25-31页 |
| 2.2.2.1 原始数据过滤结果分析 | 第25页 |
| 2.2.2.2 Clean数据碱基组成和质量分布图 | 第25-27页 |
| 2.2.2.3 对比参考序列分析 | 第27-29页 |
| 2.2.2.4 Reads在参考基因上的随机性 | 第29-31页 |
| 2.2.3 紫花苜蓿耐盐突变体根部盐胁迫响应DEGs筛选结果分析 | 第31-32页 |
| 2.2.4 DEGs表达模式聚类结果分析 | 第32页 |
| 2.2.5 DEGs的GO功能显著性富集分析 | 第32-33页 |
| 2.2.6 DEGs的KEGGPathway显著性富集分析 | 第33-35页 |
| 2.2.7 紫花苜蓿耐盐突变体根部盐胁迫响应差异转录因子分析 | 第35-36页 |
| 2.3 小结 | 第36-37页 |
| 3 南方型紫花苜蓿耐盐突变体根部盐胁迫差异蛋白分析 | 第37-48页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-39页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第37页 |
| 3.1.1.1 材料与处理 | 第37页 |
| 3.1.1.2 试剂和仪器 | 第37页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第37-39页 |
| 3.1.2.1 根部总蛋白的制备 | 第37页 |
| 3.1.2.2 根部总蛋白浓度测定 | 第37页 |
| 3.1.2.3 蛋白质酶解 | 第37页 |
| 3.1.2.4 蛋白样品iTRAQ标记 | 第37页 |
| 3.1.2.5 强阳离子交换分馏(SCX) | 第37-38页 |
| 3.1.2.6 质谱分析以及数据库的选择 | 第38页 |
| 3.1.2.7 差异蛋白的选择 | 第38页 |
| 3.1.2.8 差异蛋白的表达模式聚类分析 | 第38页 |
| 3.1.2.9 差异蛋白的GO功能显著性富集分析 | 第38页 |
| 3.1.2.10 差异蛋白的KEGGPathway显著性富集分析 | 第38-39页 |
| 3.2 结果与分析 | 第39-47页 |
| 3.2.1 肽段匹配误差分布 | 第39页 |
| 3.2.2 蛋白质鉴定结果与分析 | 第39-42页 |
| 3.2.2.1 蛋白质鉴定数据基本信息 | 第39-40页 |
| 3.2.2.2 蛋白质相对分子质量分布 | 第40-41页 |
| 3.2.2.3 肽段长度分布 | 第41页 |
| 3.2.2.4 肽段序列覆盖度 | 第41-42页 |
| 3.2.2.5 特有肽段数量分布 | 第42页 |
| 3.2.3 差异蛋白筛选结果分析 | 第42页 |
| 3.2.4 差异蛋白的GO功能显著性富集分析 | 第42-44页 |
| 3.2.5 差异蛋白的COG功能分类结果分析 | 第44-45页 |
| 3.2.6 差异蛋白的Pathway显著性富集分析 | 第45-46页 |
| 3.2.7 受盐胁迫处理后差异表达的蛋白质 | 第46-47页 |
| 3.3 小结 | 第47-48页 |
| 4 南方型紫花苜蓿耐盐突变体根部响应盐胁迫蛋白质组和转录组关联分析 | 第48-53页 |
| 4.1 材料与方法 | 第48页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第48页 |
| 4.1.1.1 材料与处理 | 第48页 |
| 4.1.1.2 试剂和仪器 | 第48页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第48页 |
| 4.2 结果与分析 | 第48-52页 |
| 4.2.1 蛋白质组与转录组关联数量关系 | 第48-49页 |
| 4.2.2 蛋白质组与转录组相关性分析 | 第49-50页 |
| 4.2.3 与基因表达变化趋势相同的差异蛋白功能分析 | 第50-51页 |
| 4.2.4 与差异基因表达变化趋势相同的差异蛋白 | 第51-52页 |
| 4.3 小结 | 第52-53页 |
| 5 结论与讨论 | 第53-58页 |
| 5.1 结论 | 第53页 |
| 5.2 讨论 | 第53-58页 |
| 参考文献 | 第58-69页 |
| 附录 | 第69-104页 |
| 个人简介 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
