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罗布泊嗜(耐)盐放线菌的物种多样性、抗生素合成基因以及盐胁迫响应机理初探

中文摘要第8-11页
ABSTRACT第11-13页
第一章 文献综述第14-36页
    1.1 嗜盐放线菌概述第14-15页
    1.2 嗜(耐)盐放线菌概述第15-18页
        1.2.1 嗜(耐)盐放线菌定义第15-16页
        1.2.2 嗜盐放线菌的生理学研究第16页
        1.2.3 嗜盐放线菌的应用价值第16-18页
    1.3 嗜(耐)盐放线菌物种多样性的研究第18-22页
        1.3.1 嗜(耐)盐放线菌生物多样性的研究方法第18-20页
        1.3.2 嗜(耐)盐放线菌的多相分类研究进展第20-21页
        1.3.3 嗜(耐)盐放线菌生物多样性的研究现状第21-22页
    1.4 嗜(耐)盐放线菌生物活性多样性第22-26页
        1.4.1 嗜(耐)盐放线菌生物活性研究现状第22-24页
        1.4.2 嗜(耐)盐放线菌生物活性物质研究现状第24-26页
    1.5 嗜(耐)盐放线菌抗生素功能基因研究概况第26-29页
    1.6 嗜(耐)盐放线菌嗜盐机制的研究现状第29-31页
    1.7 新疆罗布泊嗜(耐)盐放线菌资源概况第31-33页
        1.7.1 罗布泊地区简介第31-32页
        1.7.2 罗布泊地区嗜盐放线菌研究现状第32-33页
    1.8 研究目的和研究意义第33-35页
    1.9 技术路线第35-36页
第二章 罗布泊及其周边盐碱土可培养嗜(耐)盐放线菌物种多样性分析第36-58页
    2.1 实验材料第36-38页
        2.1.1 供试土样第36-38页
        2.1.2 分离培养基第38页
        2.1.3 主要实验仪器及试剂第38页
    2.2 实验方法第38-40页
        2.2.1 菌株的分离与纯化第39页
        2.2.2 16S r RNA基因PCR扩增和系统进化分析第39-40页
    2.3 结果与分析第40-56页
        2.3.1 罗布泊可培养嗜(耐)盐放线菌物种多样性第40-47页
        2.3.2 罗布泊周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌物种多样性第47-53页
        2.3.3 罗布泊与周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌物种多样性的比较第53-56页
    2.4 讨论第56-58页
第三章 潜在新物种的多相分类研究第58-93页
    3.1 实验材料第58-59页
        3.1.1 供试菌株第58-59页
        3.1.2 主要实验仪器及试剂第59页
    3.2 实验方法第59-66页
        3.2.1 放线菌基因组DNA的提取第59页
        3.2.2 放线菌 16S r DNA基因的PCR扩增第59-60页
        3.2.3 生理生化特征第60-63页
        3.2.4 形态特征描述第63页
        3.2.5 细胞化学组分分析第63-65页
        3.2.6 系统发育分析第65-66页
    3.3 结果与分析第66-91页
        3.3.1 糖多孢菌属(Saccharopolyspora)新物种TRM 45123 多相分类鉴定第66-73页
        3.3.2 糖霉菌属(Glycomyces)新物种TRM 45387、TRM 45198 和TRM 45127 多相分类第73-82页
        3.3.3 盐多孢菌属(Halopolyspora)新物种TRM 45668 和TRM 45658 多相分类第82-91页
    3.4 讨论第91-93页
第四章 罗布泊及周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌抗生素合成基因多样性分析第93-109页
    4.1 实验材料第93-95页
        4.1.1 供试菌株第93-94页
        4.1.2 主要实验仪器及试剂第94-95页
    4.2 实验方法第95-97页
        4.2.1 基因组DNA的提取第95页
        4.2.2 抗生素基因的PCR扩增第95-97页
        4.2.3 PCR产物回收第97页
        4.2.4 放线菌中抗生素合成基因的克隆第97页
    4.3 结果与分析第97-107页
        4.3.1 罗布泊及其周边盐碱环境土壤嗜(耐)盐放线菌抗生素合成基因分布第97-100页
        4.3.2 罗布泊及其周边盐碱环境嗜(耐)盐放线菌抗生素合成基因多样性第100-107页
    4.4 讨论第107-109页
第五章 罗布泊及其周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌活性菌株的筛选及评价第109-120页
    5.1 实验材料第109-110页
        5.1.1 供试菌株第109页
        5.1.2 培养基第109-110页
        5.1.3 抗菌筛选指示菌第110页
        5.1.4 主要实验仪器及试剂第110页
    5.2 实验方法第110-112页
        5.2.1 抗菌活性菌株初筛第110-111页
        5.2.2 抗菌活性菌株复筛第111-112页
    5.3 结果与分析第112-119页
        5.3.1 抗菌活性菌株初筛第112-116页
        5.3.2 抗菌活性菌株的复筛第116-119页
    5.4 讨论第119-120页
第六章 6株活性放线菌次级代谢产物的分离与鉴定第120-140页
    6.1 实验材料第121-122页
        6.1.1 菌株信息第121页
        6.1.2 培养基第121-122页
        6.1.3 主要实验仪器及试剂第122页
    6.2 实验方法第122-128页
        6.2.1 接种及发酵第122-123页
        6.2.2 发酵产物初步分离第123页
        6.2.3 发酵产物的柱层析分离第123-124页
        6.2.4 发酵液提取物中化合物的进一步分离纯化第124-125页
        6.2.5 各菌株次级代谢产物分离流程图第125-128页
        6.2.6 单体化合物的结构鉴定第128页
    6.3 结果与分析第128-138页
        6.3.1 次级代谢产物的分离第128-129页
        6.3.2 化合物结构鉴定第129-138页
    6.4 讨论第138-140页
第七章 嗜盐放线菌TRM 45611 嗜盐机制的研究第140-169页
    7.1 实验材料第140-141页
        7.1.1 实验菌株第140-141页
        7.1.2 主要实验仪器第141页
    7.2 实验方法第141-142页
        7.1.1 菌株TRM 45611 培养及样品的制备第141-142页
        7.1.2 菌株TRM 45611 转录组测序及分析第142页
    7.3 结果与分析第142-167页
        7.3.1 菌株TRM 45611 生长曲线及耐盐性测定结果第142-144页
        7.3.2 菌株TRM 45611 转录组测序概况第144-167页
    7.4 讨论第167-169页
总结与展望第169-172页
    本研究工作总结第169-170页
    展望第170-172页
参考文献第172-183页
附录第183-244页
攻读博士学位期间发表的论文第244-245页
致谢第245-246页

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