| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第10页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第10-12页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第12页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第12-14页 |
| 第2章 基因共表达网络与基因功能模块概述 | 第14-22页 |
| 2.1 基因共表达网络 | 第14-17页 |
| 2.1.1 基因共表达网络的构建 | 第14-16页 |
| 2.1.2 基因共表达网络的特性 | 第16页 |
| 2.1.3 差异共表达网络 | 第16-17页 |
| 2.2 传统基因功能模块识别算法 | 第17-19页 |
| 2.3 实验算法流程图 | 第19-21页 |
| 2.4 本章小结 | 第21-22页 |
| 第3章 基因差异共表达网络的构建 | 第22-35页 |
| 3.1 经典差异共表达网络 | 第22-23页 |
| 3.2 FDvDe算法 | 第23-25页 |
| 3.2.1 点差异标度 | 第23页 |
| 3.2.2 边差异标度 | 第23-24页 |
| 3.2.3 点差异与边差异的融合 | 第24-25页 |
| 3.3 算法实验及结果 | 第25-31页 |
| 3.3.1 数据集 | 第25-26页 |
| 3.3.2 数据预处理 | 第26-27页 |
| 3.3.3 构建共表达网络 | 第27页 |
| 3.3.4 差异点差异边融合算法过程结果 | 第27-31页 |
| 3.4 差异共表达网络的拓扑特性 | 第31-33页 |
| 3.4.1 差异共表达网络的四个拓扑特性 | 第31-32页 |
| 3.4.2 差异共表达网络拓扑性质分析结果 | 第32-33页 |
| 3.5 本章小结 | 第33-35页 |
| 第4章 基于GO术语的基因功能性模块识别算法 | 第35-47页 |
| 4.1 基因本体论 | 第35-36页 |
| 4.2 GTHC算法思想及实现细节 | 第36-38页 |
| 4.3 算法实验数据集 | 第38-40页 |
| 4.4 算法实验结果与分析 | 第40-46页 |
| 4.4.1 基于GO术语层次聚类算法聚类结果富集分析 | 第40-44页 |
| 4.4.2 GO术语层次聚类所得模块间的连接关系分析 | 第44-45页 |
| 4.4.3 基于GO术语与拓扑性质的中枢基因的识别 | 第45-46页 |
| 4.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 第5章 总结与展望 | 第47-49页 |
| 5.1 总结 | 第47页 |
| 5.2 展望 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 作者简介 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
