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棉铃虫多食性基因组学的初步研究

摘要第5-7页
abstract第7-8页
第一章 引言第12-30页
    1.1 昆虫学研究进入基因组学时代第12-13页
    1.2 昆虫基因组学研究的技术基础第13-17页
        1.2.1 DNA测序技术第13-16页
        1.2.2 基因组的组装与注释技术第16-17页
    1.3 昆虫基因组学研究进展第17-26页
        1.3.1 模式昆虫基因组学第19-21页
        1.3.2 卫生害虫基因组学第21-22页
        1.3.3 社会性昆虫基因组学第22-24页
        1.3.4 农业昆虫基因组学第24-26页
    1.4 植食性昆虫食性的影响因素第26-29页
        1.4.1 昆虫与植物的互作第26-27页
        1.4.2 植食性昆虫食性相关的功能基因家族第27-29页
    1.5 本研究的目的与意义第29-30页
第二章 棉铃虫与烟青虫的基因组大小及其演化趋势第30-46页
    2.1 材料与方法第31-33页
        2.1.1 供试昆虫第31-32页
        2.1.2 试剂准备第32页
        2.1.3 虫体解剖与样品制备第32-33页
        2.1.4 流式细胞术与数据分析第33页
    2.2 结果第33-42页
        2.2.1 裂解和染色效果的检查第33页
        2.2.2 棉铃虫六种组织细胞核的核内多倍性第33-34页
        2.2.3 棉铃虫六种组织细胞核的C值测定第34-40页
        2.2.4 两种细胞系的C值测定第40页
        2.2.5 棉铃虫和烟青虫基因组大小的估算第40-42页
    2.3 讨论第42-46页
第三章 棉铃虫融合转录组的构建第46-60页
    3.1 材料与方法第46-52页
        3.1.1 供试昆虫第46-47页
        3.1.2 试剂准备第47页
        3.1.3 组织解剖第47-48页
        3.1.4 RNA提取第48页
        3.1.5 转录组的测序、组装与注释第48-50页
        3.1.6 融合转录组的组装第50-52页
    3.2 结果第52-56页
        3.2.1 棉铃虫四种组织转录组的测序与质量控制第52页
        3.2.2 棉铃虫四种组织转录组的组装第52页
        3.2.3 棉铃虫四种组织转录组的注释第52-53页
        3.2.4 融合转录组的构建第53-56页
    3.3 讨论第56-60页
第四章 棉铃虫基因组的测序、组装与注释第60-74页
    4.1 材料与方法第60-65页
        4.1.1 供试昆虫第60页
        4.1.2 基因组DNA样品的制备第60-61页
        4.1.3 基因组DNA测序及数据的质量控制第61页
        4.1.4 基因组的组装及其质量评估第61-62页
        4.1.5 基因组的注释第62-65页
    4.2 结果第65-71页
        4.2.1 棉铃虫基因组DNA样品的质量检验第65-66页
        4.2.2 棉铃虫基因组DNA测序结果及其质量控制第66-67页
        4.2.3 棉铃虫基因组的组装及其质量评估第67-68页
        4.2.4 棉铃虫基因组的注释第68-71页
    4.3 讨论第71-74页
第五章 棉铃虫多食性相关基因家族的比较基因组学研究第74-92页
    5.1 材料与方法第74-75页
        5.1.1 数据来源第74页
        5.1.2 基因家族的鉴定第74-75页
        5.1.3 系统进化分析第75页
    5.2 结果第75-90页
        5.2.1 棉铃虫化学感受类基因的鉴定第75页
        5.2.2 棉铃虫解毒代谢类基因的鉴定第75-77页
        5.2.3 棉铃虫味觉受体的比较基因组学分析第77-78页
        5.2.4 棉铃虫细胞色素P450的比较基因组学分析第78页
        5.2.5 棉铃虫酯酶的比较基因组学分析第78页
        5.2.6 棉铃虫谷胱甘肽转移酶的比较基因组学分析第78-79页
        5.2.7 棉铃虫ABC转运蛋白的比较基因组学分析第79-90页
    5.3 讨论第90-92页
第六章 全文结论第92-93页
参考文献第93-105页
附录第105-109页
致谢第109-110页
作者简历第110页

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