摘要 | 第3-6页 |
abstract | 第6-8页 |
中英文缩略词表 | 第13-14页 |
第1章 引言 | 第14-17页 |
第2章 材料与方法 | 第17-30页 |
2.1 材料 | 第17-19页 |
2.1.1 实验动物 | 第17页 |
2.1.2 主要试剂 | 第17-18页 |
2.1.3 主要仪器 | 第18-19页 |
2.2 方法 | 第19-30页 |
2.2.1 原始卵泡体外培养体系的建立 | 第19-20页 |
2.2.2 原始卵泡启动的检测 | 第20页 |
2.2.3 石蜡切片制作 | 第20页 |
2.2.4 HE染色 | 第20-21页 |
2.2.5 卵巢RNA提取 | 第21页 |
2.2.6 RNA质量检测 | 第21-22页 |
2.2.7 RNA反转录 | 第22-23页 |
2.2.8 PCR扩增反应 | 第23页 |
2.2.9 琼脂糖凝胶电泳 | 第23页 |
2.2.10 实时荧光定量PCR | 第23-24页 |
2.2.11 文库制备与深度测序 | 第24页 |
2.2.12 生物信息学分析 | 第24-27页 |
2.2.13 所用引物信息 | 第27-29页 |
2.2.14 统计学分析 | 第29-30页 |
第3章 结果 | 第30-51页 |
3.1 原始卵泡启动的检测和卵巢RNA提取完整性的鉴定 | 第30-32页 |
3.1.1 3 日龄小鼠卵巢体外培养8天后的形态学变化 | 第30页 |
3.1.2 3 日龄小鼠卵巢体外培养8天后原始卵泡启动相关基因的表达变化 | 第30-31页 |
3.1.3 卵巢RNA提取的完整性检测 | 第31-32页 |
3.2 原始卵泡启动前后lncRNA的测序数据可靠性分析 | 第32页 |
3.3 小鼠卵巢原始卵泡启动前后lncRNA的表达谱 | 第32-35页 |
3.3.1 转录本编码能力预测、转录本测序数量以及平均表达量检测 | 第32-33页 |
3.3.2 转录本的外显子数目以及长度分析 | 第33-34页 |
3.3.3 样品间相关性检测 | 第34-35页 |
3.4 原始卵泡启动前后差异表达lncRNAs和mRNAs的筛选 | 第35-37页 |
3.4.1 原始卵泡启动前后差异表达的lncRNAs及mRNAs的过滤 | 第35-36页 |
3.4.2 小鼠原始卵泡启动前后lncRNAs及mRNAs的差异表达分析 | 第36-37页 |
3.5 lncRNA及其靶基因预测结果 | 第37-38页 |
3.6 GO-KEGG等生物信息学分析 | 第38-43页 |
3.6.1 组间差异基因的GO富集分析 | 第38-39页 |
3.6.2 组间差异靶基因的GO富集分析 | 第39-41页 |
3.6.3 组间差异基因的KEGG富集分析 | 第41-42页 |
3.6.4 组间差异靶基因的KEGG富集分析 | 第42-43页 |
3.7 原始卵泡启动前后差异表达lncRNAs的实时荧光定量PCR验证 | 第43-44页 |
3.8 原始卵泡启动相关信号通路中具有差异表达以及卵巢特异性lncRNAs的筛选及验证 | 第44-51页 |
3.8.1 原始卵泡启动相关信号通路的筛选 | 第45-46页 |
3.8.2 卵巢特异性lncRNA的筛选 | 第46-47页 |
3.8.3 原始卵泡启动相关信号通路中lncRNA-mRNA共表达网络的构建 | 第47-48页 |
3.8.4 原始卵泡启动相关信号通路中的具有差异表达及卵巢特异性lncRNA——卵巢特异性的验证 | 第48-49页 |
3.8.5 原始卵泡启动相关信号通路中的具有差异表达以及卵巢特异性lncRNA——差异表达的验证 | 第49页 |
3.8.6 原始卵泡启动前后具有差异表达及卵巢特异性的lncRNA及其所在的信号通路的位点分析 | 第49-51页 |
第4章 讨论 | 第51-56页 |
第5章 结论与展望 | 第56-57页 |
5.1 结论 | 第56页 |
5.2 展望 | 第56-57页 |
致谢 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-64页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第64-65页 |
综述 | 第65-73页 |
参考文献 | 第71-73页 |