| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-34页 |
| ·引言 | 第12-13页 |
| ·虚拟ADMET预测方法 | 第13-24页 |
| ·化学问题的转化 | 第14-16页 |
| ·数学模型的构建 | 第16-22页 |
| ·一些常用的优化算法 | 第22-24页 |
| ·分子动力学模拟 | 第24-28页 |
| ·分子动力学理论基础 | 第25-26页 |
| ·分子动力学的发展历史和展望 | 第26-27页 |
| ·分子动力学模拟应用实例 | 第27-28页 |
| ·虚拟筛选方法 | 第28-32页 |
| ·基于受体结构的虚拟筛选 | 第29-31页 |
| ·基于配体相似性的虚拟筛选 | 第31-32页 |
| ·我国药物设计研究现状 | 第32-33页 |
| ·论文目标和总体安排 | 第33-34页 |
| 第2章 基于遗传算法的变量选择方法及其在血脑分布预测中的应用 | 第34-48页 |
| ·引言 | 第34-35页 |
| ·材料和方法 | 第35-38页 |
| ·数据集 | 第35-36页 |
| ·分子描述符 | 第36页 |
| ·GAVS方法实现 | 第36-38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-46页 |
| ·通过GAVS方法得到的QSAR方程及其描述符组成 | 第38-40页 |
| ·测试集的验证结果 | 第40-41页 |
| ·GAVS与GFA方法的比较 | 第41-43页 |
| ·GAVS模型与其他模型的比较 | 第43-45页 |
| ·GAVS方法所具有的优势 | 第45-46页 |
| ·小结 | 第46-48页 |
| 第3章 基于子结构识别的化学分类方法及其在ADMET预测中的应用 | 第48-62页 |
| ·引言 | 第48-49页 |
| ·数据与方法 | 第49-53页 |
| ·分子描述 | 第49-50页 |
| ·子结构评估 | 第50-51页 |
| ·模型的构建 | 第51-52页 |
| ·模型质量的评估 | 第52-53页 |
| ·数据集 | 第53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-60页 |
| ·子结构的信息增益分析 | 第53-54页 |
| ·模型的构建 | 第54-56页 |
| ·模型的进一步确证 | 第56-57页 |
| ·模型推广能力评价 | 第57-58页 |
| ·从子结构信息增益分析中得到的启示 | 第58-59页 |
| ·AMES致突变性基准测试数据集的结果 | 第59-60页 |
| ·小结 | 第60-62页 |
| 第4章 雌激素受体配体亚型选择性机理的计算研究 | 第62-78页 |
| ·引言 | 第62-64页 |
| ·方法和模型 | 第64-67页 |
| ·模型的准备 | 第64-65页 |
| ·分子动力学模拟 | 第65页 |
| ·拉伸分子动力学模拟 | 第65-66页 |
| ·平均力势的构建 | 第66-67页 |
| ·实验结果 | 第67-73页 |
| ·配体沿不同解离通道解离 | 第67-71页 |
| ·配体解离过程中PMF的构建 | 第71-73页 |
| ·讨论 | 第73-76页 |
| ·配体解离通道的确定 | 第73页 |
| ·ERα中His 524和ERβ中His 475在配体解离过程中的关键作用 | 第73页 |
| ·L7-8对于配体解离过程的影响 | 第73-75页 |
| ·提高ERβ选择性的可能途径 | 第75-76页 |
| ·小结 | 第76-78页 |
| 第5章 利用虚拟筛选方法发现ERβ选择性配体 | 第78-92页 |
| ·引言 | 第78-79页 |
| ·材料与方法 | 第79-81页 |
| ·受体的准备 | 第79-80页 |
| ·小分子数据库的准备 | 第80页 |
| ·虚拟筛选 | 第80页 |
| ·虚拟筛选富集率测试 | 第80页 |
| ·体外激动和拮抗活性测试 | 第80-81页 |
| ·细胞转染和报告基因评估 | 第81页 |
| ·MTT测试 | 第81页 |
| ·结果和讨论 | 第81-90页 |
| ·富集率测试结果 | 第81-82页 |
| ·虚拟筛选结果 | 第82-86页 |
| ·活性化合物的对接构象分析 | 第86-88页 |
| ·活性化合物的构效关系分析 | 第88页 |
| ·细胞转染活性评价 | 第88-89页 |
| ·抗细胞增殖活性评价 | 第89-90页 |
| ·小结 | 第90-92页 |
| 第6章 全文总结 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-112页 |
| 攻读博士期间撰写的论文和专利 | 第112-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
