摘要 | 第5-7页 |
abstract | 第7-8页 |
第一章 文献综述 | 第11-18页 |
1.1 枣缩果病病研究现状 | 第11-14页 |
1.1.1 枣缩果病病原种类 | 第11-12页 |
1.1.2 枣疯病的发病症状 | 第12页 |
1.1.3 枣缩果病的传播途径 | 第12页 |
1.1.4 枣缩果病的侵染时期 | 第12-13页 |
1.1.5 影响枣缩果病发生的主要因素 | 第13页 |
1.1.6 枣缩果病防治措施 | 第13-14页 |
1.2 枣缩果病的抗病性研究 | 第14-15页 |
1.2.1 枣果实结构与抗病性关系 | 第14页 |
1.2.2 枣缩果病发病在生理水平的研究 | 第14-15页 |
1.3 植物与病原真菌互作的分子基础 | 第15-16页 |
1.3.1 次生代谢产物与病原菌侵染 | 第15-16页 |
1.3.2 植物信号转导与病原菌侵染 | 第16页 |
1.4 转录组学在植物与病原菌互作研究中的应用 | 第16-17页 |
1.4.1 转录组的概念 | 第16-17页 |
1.4.2 转录组测序应用 | 第17页 |
1.5 本研究的目的意义 | 第17-18页 |
第二章 细交链孢菌诱导下枣抗、感缩果病果实转录组测序分析 | 第18-24页 |
2.1 材料与方法 | 第18-19页 |
2.1.1 接种和取样 | 第18页 |
2.1.2 主要仪器、试剂(盒)及耗材的处理 | 第18-19页 |
2.2 总RNA的提取 | 第19-20页 |
2.3 总RNA质量检测 | 第20页 |
2.4 cDNA合成材料与方法 | 第20-21页 |
2.4.1 末端修复 | 第20页 |
2.4.2 cDNA3ˊ末端加‘A’ | 第20页 |
2.4.3 Adapter的连接 | 第20页 |
2.4.4 连接产物的胶回收纯化 | 第20-21页 |
2.4.5 PCR反应及产物纯化 | 第21页 |
2.4.6 上机测序 | 第21页 |
2.4.7 基因表达谱数据分析 | 第21页 |
2.5 实时荧光定量PCR验证 | 第21-24页 |
2.5.1 RNA提取及cDNA合成 | 第21页 |
2.5.2 荧光定量分析 | 第21-23页 |
2.5.3 数据处理与分析 | 第23-24页 |
第三章 结果与分析 | 第24-42页 |
3.1 RNA质量检测 | 第24-25页 |
3.2 转录组测序数据分析 | 第25-30页 |
3.2.1 转录组测序质量评估 | 第25页 |
3.2.2 病原菌接种后差异表达基因数量分析 | 第25-26页 |
3.2.3 GO功能注释富集分析 | 第26-27页 |
3.2.4 差异表达基因的Pathway分析 | 第27-30页 |
3.3 ‘七月鲜’中抗性相关代谢途径及基因分析 | 第30-34页 |
3.3.1 植物激素信号转导通路 | 第30-31页 |
3.3.2 谷胱甘肽代谢途径相关基因 | 第31-32页 |
3.3.3 类黄酮生物合成及相关基因 | 第32-33页 |
3.3.4 脂肪酸合成途径及相关基因 | 第33-34页 |
3.4 ‘蜂蜜罐’枣果实基因组中抗病基因组织表达特异性分析 | 第34-39页 |
3.4.1 实时荧光定量的验证 | 第35页 |
3.4.2 枣抗缩果病相关基因的qRealTime-PCR分析结果 | 第35-39页 |
3.5 讨论 | 第39-42页 |
第四章 结论 | 第42-44页 |
4.1 枣果实抗感缩果病转录组分析 | 第42页 |
4.2 通过转录组测序获得的差异基因 | 第42-44页 |
参考文献 | 第44-48页 |
致谢 | 第48-49页 |
作者简介 | 第49页 |