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细交链孢菌诱导下不同品种枣抗病基因的筛选

摘要第5-7页
abstract第7-8页
第一章 文献综述第11-18页
    1.1 枣缩果病病研究现状第11-14页
        1.1.1 枣缩果病病原种类第11-12页
        1.1.2 枣疯病的发病症状第12页
        1.1.3 枣缩果病的传播途径第12页
        1.1.4 枣缩果病的侵染时期第12-13页
        1.1.5 影响枣缩果病发生的主要因素第13页
        1.1.6 枣缩果病防治措施第13-14页
    1.2 枣缩果病的抗病性研究第14-15页
        1.2.1 枣果实结构与抗病性关系第14页
        1.2.2 枣缩果病发病在生理水平的研究第14-15页
    1.3 植物与病原真菌互作的分子基础第15-16页
        1.3.1 次生代谢产物与病原菌侵染第15-16页
        1.3.2 植物信号转导与病原菌侵染第16页
    1.4 转录组学在植物与病原菌互作研究中的应用第16-17页
        1.4.1 转录组的概念第16-17页
        1.4.2 转录组测序应用第17页
    1.5 本研究的目的意义第17-18页
第二章 细交链孢菌诱导下枣抗、感缩果病果实转录组测序分析第18-24页
    2.1 材料与方法第18-19页
        2.1.1 接种和取样第18页
        2.1.2 主要仪器、试剂(盒)及耗材的处理第18-19页
    2.2 总RNA的提取第19-20页
    2.3 总RNA质量检测第20页
    2.4 cDNA合成材料与方法第20-21页
        2.4.1 末端修复第20页
        2.4.2 cDNA3ˊ末端加‘A’第20页
        2.4.3 Adapter的连接第20页
        2.4.4 连接产物的胶回收纯化第20-21页
        2.4.5 PCR反应及产物纯化第21页
        2.4.6 上机测序第21页
        2.4.7 基因表达谱数据分析第21页
    2.5 实时荧光定量PCR验证第21-24页
        2.5.1 RNA提取及cDNA合成第21页
        2.5.2 荧光定量分析第21-23页
        2.5.3 数据处理与分析第23-24页
第三章 结果与分析第24-42页
    3.1 RNA质量检测第24-25页
    3.2 转录组测序数据分析第25-30页
        3.2.1 转录组测序质量评估第25页
        3.2.2 病原菌接种后差异表达基因数量分析第25-26页
        3.2.3 GO功能注释富集分析第26-27页
        3.2.4 差异表达基因的Pathway分析第27-30页
    3.3 ‘七月鲜’中抗性相关代谢途径及基因分析第30-34页
        3.3.1 植物激素信号转导通路第30-31页
        3.3.2 谷胱甘肽代谢途径相关基因第31-32页
        3.3.3 类黄酮生物合成及相关基因第32-33页
        3.3.4 脂肪酸合成途径及相关基因第33-34页
    3.4 ‘蜂蜜罐’枣果实基因组中抗病基因组织表达特异性分析第34-39页
        3.4.1 实时荧光定量的验证第35页
        3.4.2 枣抗缩果病相关基因的qRealTime-PCR分析结果第35-39页
    3.5 讨论第39-42页
第四章 结论第42-44页
    4.1 枣果实抗感缩果病转录组分析第42页
    4.2 通过转录组测序获得的差异基因第42-44页
参考文献第44-48页
致谢第48-49页
作者简介第49页

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