| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩写词表 | 第9-13页 |
| 第一部分 文献综述 | 第13-23页 |
| 1 抗菌肽的研究进展 | 第13-18页 |
| 1.1 抗菌肽简介及分类 | 第13-14页 |
| 1.2 抗菌肽的抗微生物作用及机制 | 第14-17页 |
| 1.2.1 抗细菌作用 | 第14-15页 |
| 1.2.2 抗其他微生物作用 | 第15-16页 |
| 1.2.3 抗菌肽的抗微生物作用机制 | 第16-17页 |
| 1.3 抗菌肽的其他作用与机制 | 第17-18页 |
| 1.4 抗菌肽在反刍动物中的应用 | 第18页 |
| 2 反刍动物瘤胃细菌的研究进展 | 第18-22页 |
| 2.1 反刍动物瘤胃内细菌多样性研究 | 第18-19页 |
| 2.2 饲料添加剂对瘤胃细菌多样性的影响 | 第19-20页 |
| 2.3 瘤胃内主要功能菌 | 第20页 |
| 2.4 分子生物学技术在瘤胃细菌研究的应用 | 第20-22页 |
| 2.4.1 实时定量PCR在瘤胃细菌研究中的应用 | 第20-21页 |
| 2.4.2 高通量测序技术在瘤胃细菌研究中的应用 | 第21-22页 |
| 3 研究目的意义 | 第22-23页 |
| 第二章 复合抗菌肽对山羊瘤胃细菌多样性的影响 | 第23-38页 |
| 1 试验材料与方法 | 第23-27页 |
| 1.1 试验材料 | 第23-24页 |
| 1.1.1 试验药品 | 第23页 |
| 1.1.2 试验动物 | 第23页 |
| 1.1.3 试验仪器与试剂 | 第23-24页 |
| 1.2 试验方法 | 第24-26页 |
| 1.2.1 试验动物的饲养管理 | 第24页 |
| 1.2.2 试验动物的分组及处理 | 第24-25页 |
| 1.2.3 瘤胃液的采集和细菌基因组DNA的提取 | 第25页 |
| 1.2.4 样品PCR扩增及Miseq测序 | 第25-26页 |
| 1.3 数据分析 | 第26-27页 |
| 2 结果与分析 | 第27-34页 |
| 2.1 瘤胃细菌总DNA提取结果 | 第27页 |
| 2.2 PCR电泳检测结果 | 第27-28页 |
| 2.3 测序长度及测序深度 | 第28-29页 |
| 2.4 α多样性分析 | 第29页 |
| 2.5 β多样性分析 | 第29-30页 |
| 2.6 瘤胃细菌的物种组成分析 | 第30-33页 |
| 2.7 门水平和属水平的热图分析 | 第33-34页 |
| 3 讨论 | 第34-37页 |
| 3.1 稀释曲线和多样性分析 | 第34-35页 |
| 3.2 复合抗菌肽对瘤胃细菌菌群结构的影响 | 第35-37页 |
| 4 小结 | 第37-38页 |
| 第三章 不同剂量复合抗菌肽抗菌肽对山羊瘤胃功能细菌数量的影响 | 第38-54页 |
| 1 试验材料与方法 | 第38-42页 |
| 1.1 试验材料 | 第38-39页 |
| 1.1.1 试验药品 | 第38页 |
| 1.1.2 试验动物 | 第38页 |
| 1.1.3 试验仪器与试剂 | 第38-39页 |
| 1.2 试验方法 | 第39-42页 |
| 1.2.1 试验动物的饲养管理 | 第39页 |
| 1.2.2 试验动物的分组及处理 | 第39页 |
| 1.2.3 瘤胃液的采集和细菌基因组DNA的提取 | 第39页 |
| 1.2.4 测定指标 | 第39页 |
| 1.2.5 引物设计 | 第39-40页 |
| 1.2.6 标准品的制备 | 第40-41页 |
| 1.2.7 标准曲线的建立 | 第41页 |
| 1.2.8 Real-time PCR扩增 | 第41-42页 |
| 1.3 统计分析 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-52页 |
| 2.1 阳性克隆鉴定结果 | 第42-45页 |
| 2.1.1 阳性克隆质粒的PCR鉴定 | 第42-43页 |
| 2.1.2 阳性克隆测序结果及相似性分析 | 第43-45页 |
| 2.2 标准曲线的建立 | 第45-47页 |
| 2.3 荧光定量PCR扩增与溶解曲线 | 第47-49页 |
| 2.4 瘤胃液中7种主要功能菌的数量 | 第49-52页 |
| 3 讨论 | 第52-53页 |
| 4 小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 附录 | 第66-69页 |
| 附录Ⅰ 细菌基因组DNA的提取 | 第66-67页 |
| 附录Ⅱ PCR产物与载体的连接转化 | 第67-68页 |
| 附录Ⅲ 溶液的配制 | 第68-69页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第69页 |