摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
符号说明 | 第10-15页 |
1 文献综述 | 第15-27页 |
1.1 反刍动物瘤胃的发育 | 第15-17页 |
1.1.1 瘤胃结构和功能 | 第15-16页 |
1.1.2 山羊胚胎期瘤胃发育的时间点 | 第16-17页 |
1.1.3 瘤胃发育过程的调控 | 第17页 |
1.2 miRNA研究进展 | 第17-22页 |
1.2.1 miRNA概述 | 第17-18页 |
1.2.2 miRNA调控动物基因表达的机制 | 第18-20页 |
1.2.3 miRNA的检测方法 | 第20-21页 |
1.2.4 miRNA靶基因预测及鉴定 | 第21-22页 |
1.2.5 miRNA参与动物生长发育的机制 | 第22页 |
1.3 miR-148a-3p的研究进展 | 第22-24页 |
1.3.1 miR-148a-3p的表达及调控 | 第22-23页 |
1.3.2 miR-148a-3p的功能 | 第23-24页 |
1.4 QKI基因的研究进展 | 第24-25页 |
1.4.1 QKI的结构特点 | 第24页 |
1.4.2 QKI的功能 | 第24-25页 |
1.5 本研究的目的和意义 | 第25-27页 |
1.5.1 研究目的 | 第25页 |
1.5.2 研究意义 | 第25-27页 |
2 材料与方法 | 第27-37页 |
2.1 试验材料 | 第27页 |
2.1.1 山羊组织的采集 | 第27页 |
2.1.2 菌株、细胞系和载体 | 第27页 |
2.2 瘤胃总RNA的抽提和分析 | 第27-28页 |
2.2.1 瘤胃总RNA的抽提 | 第27-28页 |
2.2.2 瘤胃总RNA的质量分析 | 第28页 |
2.3 小RNA测序及生物信息学分析 | 第28-31页 |
2.3.1 小RNA文库构建及测序 | 第28-29页 |
2.3.2 测序数据处理 | 第29-30页 |
2.3.3 靶基因预测及功能分析 | 第30-31页 |
2.4 荧光定量及双荧光素酶报告基因系统验证 | 第31-34页 |
2.4.1 高通量测序数据的qRT-PCR定量验证 | 第31-32页 |
2.4.2 miR-148a-3p与QKI基因3'-UTR结合的验证 | 第32-34页 |
2.5 miR-148a-3p和QKI在胃肠道的共定位分析 | 第34-35页 |
2.5.1 探针设计 | 第34-35页 |
2.5.2 双色荧光原位杂交 | 第35页 |
2.6 miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响 | 第35-37页 |
2.6.1 细胞转染和细胞增殖的测定 | 第35-36页 |
2.6.2 miR-148a-3p和QKI的定量检测 | 第36-37页 |
3 结果与分析 | 第37-52页 |
3.1 测序数据概述 | 第37-39页 |
3.1.1 测序数据质量评估 | 第37-38页 |
3.1.2 miRNA鉴定 | 第38页 |
3.1.3 miRNA碱基偏好性分析 | 第38-39页 |
3.2 两个时期山羊瘤胃中高表达的miRNAs | 第39-41页 |
3.2.1 两个时期山羊瘤胃中高表达miRNAs的鉴定及分析 | 第39-40页 |
3.2.2 两个时期山羊瘤胃中高表达miRNAs的靶基因预测及分析 | 第40-41页 |
3.3 两个时期山羊瘤胃中差异表达的miRNAs | 第41-43页 |
3.3.1 两个时期山羊瘤胃中差异表达miRNAs的鉴定及分析 | 第41-42页 |
3.3.2 两个时期山羊瘤胃中差异表达miRNAs的靶基因预测及分析 | 第42-43页 |
3.4 测序数据的可靠性验证 | 第43-44页 |
3.5 miR-148a-3p作用于QKI基因的验证 | 第44-46页 |
3.5.1 3'-UTR结合位点保守性分析 | 第44页 |
3.5.2 重组质粒的鉴定 | 第44-45页 |
3.5.3 miR-148a-3p与结合位点的识别 | 第45-46页 |
3.6 miR-148a-3p和QKI在胃肠道的共定位 | 第46-49页 |
3.6.1 miR-148a-3p和QKI在各个胃室的上皮层高表达 | 第46-47页 |
3.6.2 miR-148a-3p和QKI在肠道定位不一致 | 第47-49页 |
3.7 miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响 | 第49-52页 |
3.7.1 过表达miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响 | 第49-51页 |
3.7.2 抑制miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响 | 第51-52页 |
4. 讨论 | 第52-56页 |
4.1 高表达miRNAs的功能研究 | 第52页 |
4.2 差异表达miRNAs的功能研究 | 第52-53页 |
4.3 高表达和差异表达的miRNAs可能参与的信号通路 | 第53-54页 |
4.4 miR-148a-3p对细胞增殖的影响 | 第54页 |
4.5 QKI亚型的研究 | 第54-55页 |
4.6 miR-148a-3p作用于QKI基因中可能存在的甲基化修饰 | 第55-56页 |
5 结论 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-70页 |
致谢 | 第70-71页 |
攻读学位期间发表的学术论文和授权专利 | 第71页 |