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山羊瘤胃发育相关miRNAs的鉴定及miR-148a-3p生物学功能分析

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
符号说明第10-15页
1 文献综述第15-27页
    1.1 反刍动物瘤胃的发育第15-17页
        1.1.1 瘤胃结构和功能第15-16页
        1.1.2 山羊胚胎期瘤胃发育的时间点第16-17页
        1.1.3 瘤胃发育过程的调控第17页
    1.2 miRNA研究进展第17-22页
        1.2.1 miRNA概述第17-18页
        1.2.2 miRNA调控动物基因表达的机制第18-20页
        1.2.3 miRNA的检测方法第20-21页
        1.2.4 miRNA靶基因预测及鉴定第21-22页
        1.2.5 miRNA参与动物生长发育的机制第22页
    1.3 miR-148a-3p的研究进展第22-24页
        1.3.1 miR-148a-3p的表达及调控第22-23页
        1.3.2 miR-148a-3p的功能第23-24页
    1.4 QKI基因的研究进展第24-25页
        1.4.1 QKI的结构特点第24页
        1.4.2 QKI的功能第24-25页
    1.5 本研究的目的和意义第25-27页
        1.5.1 研究目的第25页
        1.5.2 研究意义第25-27页
2 材料与方法第27-37页
    2.1 试验材料第27页
        2.1.1 山羊组织的采集第27页
        2.1.2 菌株、细胞系和载体第27页
    2.2 瘤胃总RNA的抽提和分析第27-28页
        2.2.1 瘤胃总RNA的抽提第27-28页
        2.2.2 瘤胃总RNA的质量分析第28页
    2.3 小RNA测序及生物信息学分析第28-31页
        2.3.1 小RNA文库构建及测序第28-29页
        2.3.2 测序数据处理第29-30页
        2.3.3 靶基因预测及功能分析第30-31页
    2.4 荧光定量及双荧光素酶报告基因系统验证第31-34页
        2.4.1 高通量测序数据的qRT-PCR定量验证第31-32页
        2.4.2 miR-148a-3p与QKI基因3'-UTR结合的验证第32-34页
    2.5 miR-148a-3p和QKI在胃肠道的共定位分析第34-35页
        2.5.1 探针设计第34-35页
        2.5.2 双色荧光原位杂交第35页
    2.6 miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响第35-37页
        2.6.1 细胞转染和细胞增殖的测定第35-36页
        2.6.2 miR-148a-3p和QKI的定量检测第36-37页
3 结果与分析第37-52页
    3.1 测序数据概述第37-39页
        3.1.1 测序数据质量评估第37-38页
        3.1.2 miRNA鉴定第38页
        3.1.3 miRNA碱基偏好性分析第38-39页
    3.2 两个时期山羊瘤胃中高表达的miRNAs第39-41页
        3.2.1 两个时期山羊瘤胃中高表达miRNAs的鉴定及分析第39-40页
        3.2.2 两个时期山羊瘤胃中高表达miRNAs的靶基因预测及分析第40-41页
    3.3 两个时期山羊瘤胃中差异表达的miRNAs第41-43页
        3.3.1 两个时期山羊瘤胃中差异表达miRNAs的鉴定及分析第41-42页
        3.3.2 两个时期山羊瘤胃中差异表达miRNAs的靶基因预测及分析第42-43页
    3.4 测序数据的可靠性验证第43-44页
    3.5 miR-148a-3p作用于QKI基因的验证第44-46页
        3.5.1 3'-UTR结合位点保守性分析第44页
        3.5.2 重组质粒的鉴定第44-45页
        3.5.3 miR-148a-3p与结合位点的识别第45-46页
    3.6 miR-148a-3p和QKI在胃肠道的共定位第46-49页
        3.6.1 miR-148a-3p和QKI在各个胃室的上皮层高表达第46-47页
        3.6.2 miR-148a-3p和QKI在肠道定位不一致第47-49页
    3.7 miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响第49-52页
        3.7.1 过表达miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响第49-51页
        3.7.2 抑制miR-148a-3p对GES-1细胞增殖的影响第51-52页
4. 讨论第52-56页
    4.1 高表达miRNAs的功能研究第52页
    4.2 差异表达miRNAs的功能研究第52-53页
    4.3 高表达和差异表达的miRNAs可能参与的信号通路第53-54页
    4.4 miR-148a-3p对细胞增殖的影响第54页
    4.5 QKI亚型的研究第54-55页
    4.6 miR-148a-3p作用于QKI基因中可能存在的甲基化修饰第55-56页
5 结论第56-57页
参考文献第57-70页
致谢第70-71页
攻读学位期间发表的学术论文和授权专利第71页

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