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吕氏泰勒虫与尤氏泰勒虫蛋白组学初探

摘要第5-6页
Abstract第6页
英文缩略表第11-12页
第一章 引言第12-20页
    1.1 病原特征第12-13页
    1.2 临床及病理变化第13页
    1.3 泰勒虫裂殖子的检测第13-14页
    1.4 泰勒虫裂殖子的纯化第14页
    1.5 蛋白质鉴定第14-15页
    1.6 蛋白全谱分析第15-16页
    1.7 差异蛋白分析第16-18页
    1.8 蛋白质组学在寄生虫方面的应用第18-20页
第二章 吕氏泰勒虫和尤氏泰勒虫的鉴定、增殖与纯化第20-29页
    2.1 材料第20页
        2.1.1 主要仪器第20页
        2.1.2 主要试剂第20页
        2.1.3 虫种资源第20页
        2.1.4 实验动物第20页
    2.2 方法第20-23页
        2.2.1 泰勒虫的增殖第21页
        2.2.2 多重PCR鉴定方法的建立第21-22页
            2.2.2.1 引物设计第21页
            2.2.2.2 多重PCR特异性及灵敏性检测第21-22页
            2.2.2.3 多重PCR反应条件优化第22页
            2.2.2.4 PCR产物检测第22页
        2.2.3 免疫亲和层析纯化泰勒虫裂殖子方法的建立第22-23页
            2.2.3.1 抗体的纯化第22页
            2.2.3.2 抗体的上样前处理第22页
            2.2.3.3 抗体的偶联第22页
            2.2.3.4 样品预处理第22-23页
            2.2.3.5 裂殖子的纯化第23页
            2.2.3.6 纯化效果检测第23页
    2.3 结果第23-27页
        2.3.1 虫体的增殖第23-24页
        2.3.2 多重PCR特异性检测第24-25页
        2.3.3 多重PCR灵敏性检测第25页
        2.3.4 反应条件的优化第25-26页
        2.3.5 野外样品检测第26页
        2.3.6 抗体纯化效果第26页
        2.3.7 虫体纯化效果第26-27页
    2.4 讨论第27-29页
第三章 吕氏泰勒虫与尤氏泰勒虫裂殖子的差异蛋白组学鉴定与功能分析第29-51页
    3.1 材料第29页
        3.1.1 主要仪器第29页
        3.1.2 主要试剂第29页
    3.2 方法第29-31页
        3.2.1 虫体蛋白质提取第29页
        3.2.2 Bradford定量第29-30页
        3.2.3 蛋白电泳第30页
        3.2.4 样品的酶解第30页
        3.2.5 iTRAQ标记第30页
        3.2.6 SCX分离第30页
        3.2.7 基于Triple TOF 5600的LC-ESI-MSMS分析第30页
        3.2.8 Mascot搜索第30-31页
        3.2.9 GO注释第31页
        3.2.10 COG注释第31页
        3.2.11 Pathway代谢通路注释第31页
    3.3 结果第31-49页
        3.3.1 泰勒虫蛋白提取第31-32页
        3.3.2 Bradford标准曲线制作第32-33页
        3.3.3 泰勒虫蛋白质鉴定第33-35页
            3.3.3.1 数据库选择第33页
            3.3.3.2 Mascot搜索第33-34页
            3.3.3.3 蛋白鉴定基本信息第34-35页
        3.3.4 氏泰勒虫种内差异蛋白分析第35-39页
            3.3.4.1 氏泰勒虫种内差异蛋白分布第35-37页
            3.3.4.2 吕氏泰勒虫种内差异蛋白的功能聚类第37-39页
        3.3.5 尤氏氏泰勒虫种内差异蛋白分析第39-42页
            3.3.5.1 尤氏泰勒虫种内差异蛋白分布第39-41页
            3.3.5.2 尤氏泰勒虫种内差异蛋白的功能聚类第41-42页
        3.3.6 两种泰勒虫种间蛋白差异性分析第42-45页
        3.3.7 差异蛋白的功能聚类第45-47页
        3.3.8 细胞通路分析第47-48页
        3.3.9 在转录水平对重点差异蛋白表达量验证第48-49页
    3.4 讨论第49-51页
第四章 吕氏泰勒虫与尤氏泰勒虫裂殖子的蛋白全谱分析第51-63页
    4.1 材料第51页
        4.1.1 主要仪器第51页
        4.1.2 主要试剂第51页
    4.2 方法第51-53页
        4.2.1 虫体蛋白质提取第51页
        4.2.2 Bradford定量第51页
        4.2.3 SDS电泳第51页
        4.2.4 蛋白质胶内酶解第51-52页
        4.2.5 肽段提取第52页
        4.2.6 基于LTQ-Orbitrap CID的LC-ESI-MS/MS分析第52页
        4.2.7 Mascot搜索第52-53页
    4.3 结果第53-60页
        4.3.1 泰勒虫蛋白提取第53-54页
        4.3.2 Bradford标准曲线制作第54页
        4.3.3 蛋白鉴定结果第54-56页
            4.3.3.1 肽段匹配误差分析第55页
            4.3.3.2 蛋白鉴定覆盖度分布第55-56页
            4.3.3.3 鉴定肽段序列长度分布第56页
        4.3.4 GO分析第56-59页
            4.3.4.1 吕氏泰勒虫GO分析第56-58页
            4.3.4.2 尤氏泰勒虫GO分析第58-59页
        4.3.5 GOG分析第59-60页
            4.3.5.1 吕氏泰勒虫GOG分析第59-60页
            4.3.5.2 尤氏泰勒虫GOG分析第60页
    4.4 讨论第60-63页
全文结论第63-64页
参考文献第64-71页
致谢第71-72页
作者简介第72页

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