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丹参酮合成关键基因SmCPS1与SmKSL1转录调控的研究

摘要第5-8页
abstract第8-10页
第一章 绪论第16-27页
    1.1 研究背景第16页
    1.2 丹参酮生物合成的研究概况第16-18页
        1.2.1 丹参酮生物合成途径的研究进展第16-17页
        1.2.2 CPS、KSL基因的研究进展第17-18页
        1.2.3 SmCPS1与SmKSL1是丹参酮生物合成中的关键基因第18页
    1.3 植物代谢调控的方式及研究进展第18-20页
    1.4 植物中转录调控研究的技术与应用第20-22页
        1.4.1 酵母单杂交技术在植物转录调控研究中的应用第21页
        1.4.2 蛋白凝胶迁移率(EMSA)在植物转录调控研究中的应用第21页
        1.4.3 染色体免疫共沉淀技术(ChIP)及其相关技术在植物转录调控研究中的应用第21-22页
    1.5 转录因子在药用植物次生代谢中的研究现状第22-23页
    1.6 现代植物基因功能研究的方法与展望第23-25页
        1.6.1 植物基因超表达在转录因子功能中的研究与应用第23页
        1.6.2 人工microRNA干扰植物基因功能的研究与应用第23-24页
        1.6.3 植物功能研究技术的发展与展望第24-25页
    1.7 研究内容第25页
    1.8 研究的目的与意义第25-26页
    1.9 研究的技术路线第26-27页
第二章 SmCPS1与SmKSL1的亚细胞定位以及其基因与丹参酮合成的关系第27-41页
    2.1 引言第27页
    2.2 实验材料与试剂第27-28页
        2.2.1 实验材料第27页
        2.2.2 菌株与载体的构建第27页
        2.2.3 实验试剂与耗材第27-28页
    2.3 仪器第28页
    2.4 试验方法与步骤第28-36页
        2.4.1 HPLC检测丹参酮的含量第28页
        2.4.2 SmCPS1与SmKSL1的亚细胞定位第28-35页
        2.4.3 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析第35-36页
        2.4.4 数据统计与分析第36页
    2.5 结果与分析第36-40页
        2.5.1 不同产地丹参的丹参酮含量存在差异第36-37页
        2.5.2 SmCPS1与SmKSL1基因与丹参酮的含量之间有的相关性分析第37-38页
        2.5.3 SmCPS1与SmKSL1的亚细胞定位载体的构建第38-39页
        2.5.4 SmCPS1与SmKSL1的亚细胞定位结果分析第39-40页
    2.6 讨论第40页
        2.6.1 SmCPS1与SmKSL1是丹参酮生物合成的关键基因第40页
        2.6.2 SmCPS1与SmKSL1定位于细胞内的质体内第40页
    小结第40-41页
第三章 SmCPS1与SmKSL1基因启动子的扩增与分析第41-52页
    3.1 引言第41页
    3.2 实验材料与方法第41页
        3.2.1 实验材料第41页
        3.2.2 实验仪器与试剂第41页
    3.3 试验方法第41-46页
        3.3.1 丹参总DNA的提取第41-42页
        3.3.2 SmCPS1基因启动子的克隆第42页
        3.3.3 SmKSL1基因启动子的克隆第42-43页
        3.3.4 SmCPS1与SmKSL1启动子分析第43页
        3.3.5 SmCPS1与SmKSL1启动子活性的鉴定第43-45页
        3.3.6 SmCPS1与SmKSL1启动子对外源GA与ETH的响应的研究第45页
        3.3.7 GUS活性的定量检测第45-46页
        3.3.8 数据统计与分析第46页
    3.4 结果与分析第46-50页
        3.4.1 SmCPS1与SmKSL1启动子的克隆第46-47页
        3.4.2 SmCPS1与SmKSL1启动子结构与作用元件的分析第47-48页
        3.4.3 SmCPS1与SmKSL1启动子活性分析第48-49页
        3.4.4 SmCPS1与SmKSL1启动子特异性响应外源GA与Eth信号分析第49-50页
    3.5 讨论第50-51页
        3.5.1 SmCPS1与SmKSL1启动子获得与顺式作用元件的预测分析第50-51页
        3.5.2 SmCPS1与SmKSL1启动子活性以及对外源GA、ETH处理响应验证第51页
    小结第51-52页
第四章 Y1H筛选特异性识别SmCPS1与SmKSL1启动子区的转录因子及其与靶位序列的互作验证第52-76页
    4.1 引言第52-53页
    4.2 实验仪器第53页
    4.3 实验材料与方法第53-67页
        4.3.1 细菌与酵母株系第53页
        4.3.2 丹参总RNA的提取第53页
        4.3.3 丹参cDNA文库的构建第53-55页
        4.3.4 利用Y1H体系进行丹参cDNA文库的筛选第55-57页
        4.3.5 酵母单杂交的在丹参cDNA文库中筛选转录因子第57-59页
        4.3.6 酵母质粒的提取第59页
        4.3.7 转录因子全长的获得第59-60页
        4.3.8 获得转录因子的Y1H互作验证第60-61页
        4.3.9 β-X-gal显色反应第61页
        4.3.10 SmERF6与SmERF8蛋白的获得第61-66页
        4.3.11 凝胶迁移率(EMSA)验证SmERF6与SmERF8蛋白与靶位序列互作第66-67页
    4.4 实验结果与分析第67-73页
        4.4.1 诱饵载体的构建,酵母株系的鉴定以及AbA抑制浓度的确定第67-68页
        4.4.2 丹参cDNA文库的筛选第68-69页
        4.4.3 SmERF6与SmERF8转录因子的克隆与体内互作验证第69-70页
        4.4.4 Pmal-2X-SmERF6与Pmal-2X-SmERF8载体构建成功第70页
        4.4.5 SmERF6与SmERF8蛋白诱导表达以及WesternBlotting验证第70-72页
        4.4.6 SmERF6、SmERF8蛋白与SmCPS1、SmKSL1基因启动子上的GCC-box作用元件结合第72-73页
    4.5 讨论第73-74页
        4.5.1 利用SmCPS1与SmKSL1启动子作为诱饵在丹参cDNA文库内成功筛选出10条ERF家族转录因子第73页
        4.5.2 SmERF6与SmERF8是潜在的丹参酮生物合成调控的关键因子第73-74页
        4.5.3 标签蛋白MBP以及带有MBP标签的SmERF6与SmERF8蛋白在大肠杆菌Rossetta菌株内被成功诱导表达第74页
        4.5.4 SmERF6与SmERF8蛋白特异性的与SmCPS1与SmKSL1基因启动子上的GCC-box结合第74页
    小结第74-76页
第五章 SmERF6与SmERF8转录因子的结构分析,特异性表达以及亚细胞定位分析第76-86页
    5.1 引言第76-77页
    5.2 试剂与仪器第77页
    5.3 材料与方法第77-80页
        5.3.1 SmERF6与SmERF8生物信息学预测分析第77页
        5.3.2 SmERF6与SmERF8组织特异性表达分析第77页
        5.3.3 SmERF6与SmERF8对外源Eth与GA响应的处理第77-78页
        5.3.4 SmERF6与SmERF8亚细胞定位分析第78-80页
        5.3.5 数据统计与分析第80页
    5.4 结果与分析第80-85页
        5.4.1 SmERF6与SmERF8的结构特性分析第80-82页
        5.4.2 SmERF6与SmERF8在丹参中的组织特异性表达分析第82页
        5.4.3 SmERF6与SmERF8对外源GA与Eth处理的响应第82-83页
        5.4.4 SmERF6与SmERF8的亚细胞定位分析第83-85页
    5.5 讨论第85页
        5.5.1 SmERF6与SmERF8具有典型的ERF基因的结构并对外源GA与Eth信号敏感第85页
        5.5.2 SmERF6与SmERF8分别在丹参的根、芦头内高表达并且定位于细胞的核内第85页
    小结第85-86页
第六章 转录因子SmERF6与SmERF8的功能分析第86-101页
    6.1 引言第86页
    6.2 实验所用仪器第86页
    6.3 实验材料与方法第86-91页
        6.3.1 丹参无菌苗的培养与继代第86-87页
        6.3.2 PCAMBIA1304+-SmERF6与PCAMBIA1304+-SmERF8载体的构建第87-88页
        6.3.3 发根农杆菌ATCC15834感受态的制备及其PCAMBIA1304+-SmERF6与PCAMBIA1304+-SmERF8的转化第88页
        6.3.4 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根以及空载体PCAMBIA1304+毛状根的诱导第88-89页
        6.3.5 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根的获得以及阳性株系的鉴定第89-90页
        6.3.6 qRT-PCR测定第90页
        6.3.7 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根内丹参酮,总酚酸以及总黄酮含量变化的测定第90页
        6.3.8 过表达SmERF6与SmERF8丹参毛状根鲜重变化的测定第90-91页
        6.3.9 数据统计与分析第91页
    6.4 结果与分析第91-97页
        6.4.1 PCAMBIA1304+-SmERF6与PCAMBIA1304+-SmERF8的过表达载体构建成功第91-92页
        6.4.2 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根的成功诱导并获得阳性株系第92-93页
        6.4.3 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根内当SmERF6、SmERF8基因表达量上升时关键靶基因SmCPS1、SmKSL1被诱导表达第93-94页
        6.4.4 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根丹参酮含量明显升高第94-95页
        6.4.5 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根总酚酸与总黄酮含量显著下降第95页
        6.4.6 过表达SmERF6、SmERF8转基因毛状根生长受到抑制第95-97页
    6.5 讨论第97-100页
        6.5.1 过表达SmERF6可以诱发靶基因SmCPS1与SmKSL1的转录水平进而促进丹参酮的合成与积累第97-98页
        6.5.2 SmERF8通过提高靶基因SmKSL1的转录表达水平促进丹参酮生物合成第98页
        6.5.3 在过表达SmERF6、SmERF8的丹参毛状根株系中总酚酸、总黄酮与丹参酮代谢之间存在内稳态调节第98-99页
        6.5.4 在过表达SmERF6、SmERF8抑制了丹参毛状根的生长第99-100页
    小结第100-101页
第七章 人工microRNA的合成以及靶基因沉默分析第101-111页
    7.1 引言第101页
    7.2 实验所用仪器第101页
    7.3 实验材料与方法第101-104页
        7.3.1 丹参无菌苗的培养与继代培养第101页
        7.3.2 人工amiRSmERF6与amiRSmERF8的筛选与确定第101页
        7.3.3 PCAMBIA1304-amiRSmERF6与PCAMBIA1304-amiRSmERF8载体的构建第101-102页
        7.3.4 发根农杆菌ATCC15834感受态的制备及其PCAMBIA1304-amiRSmERF6与PCAMBIA1304-amiRSmERF8的转化第102页
        7.3.5 转基因毛状根的诱导第102页
        7.3.6 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8转基因毛状根的获得以及阳性株系的鉴定第102-103页
        7.3.7 miRNA的提取与分离第103页
        7.3.8 microRNA第一链cDNA合成第103页
        7.3.9 amiRSmERF6与amiRSmERF8的定量分析第103-104页
        7.3.10 SmERF6,SmERF8与靶基因SmCPS1、SmKSL1的实时荧光定量分析第104页
        7.3.11 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8转基因毛状根内丹参酮,总酚酸以及总黄酮含量变化的测定第104页
        7.3.12 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8丹参毛状根鲜重变化的测定第104页
        7.3.13 数据统计与分析第104页
    7.4 结果与分析第104-109页
        7.4.1 amiRSmERF6与amiRSmERF8的选取与分离第104-105页
        7.4.2 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8丹参转基因毛状根的鉴定第105-106页
        7.4.3 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8在丹参的毛状根中对SmERF6、SmERF8、SmCPS1与SmKSL1基因表达水平表达的影响第106-107页
        7.4.4 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8对丹参毛状根丹参酮含量的影响第107-108页
        7.4.5 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8对丹参毛状根总酚酸、总黄酮含量以及毛状根的生长均无显著影响第108-109页
    7.5 讨论第109-110页
        7.5.1 人工合成的amiRSmERF6与amiRSmERF8成功的干扰了SmERF6与SmERF8基因的表达并影响了丹参酮合成第109页
        7.5.2 过表达amiRSmERF6与amiRSmERF8导致丹参酮的含量下降,而对酚酸、黄酮类物质以及毛状根的生长无显著影响第109-110页
    小结第110-111页
第八章 SmGRAS1~5基因的克隆与特性分析第111-125页
    8.1 引言第111-112页
    8.2 材料与方法第112-114页
        8.2.1 植物材料和生长条件第112页
        8.2.2 SmGRAS基因的基因克隆和生物信息学分析第112-113页
        8.2.3 SmGRAS基因的RNA分离和定量RT-PCR分析第113页
        8.2.4 高效液相色谱分析第113页
        8.2.5 数据统计和分析第113-114页
    8.3 结果与分析第114-121页
        8.3.1 丹参SmGRASs的序列特征第114页
        8.3.2 丹参SmGRAS蛋白的系统进化分析和结构功能预测第114-116页
        8.3.3 SmGRAS1-5基因的组织特异性表达水平第116-117页
        8.3.4 SmGRAS1~5、SmCPS1和SmKSL1基因对外源GA处理的响应情况第117页
        8.3.5 SmGRAS1-5、SmCPS1和SmKSL1基因对外源Eth处理的响应情况第117-121页
        8.3.6 外源性GA与Eth处理丹参毛状根促进DT-I,T-I与T-IIA的积累,但CT对其不敏感第121页
    8.4 讨论第121-123页
        8.4.1 SmGRAS1-5基因是丹参中潜在参与植物激素合成调控的转录因子第121-122页
        8.4.2 SmGRAS1-5基因是潜在的参与GA与ET信号调控的转录因子第122页
        8.4.3 SmGRAS1-5基因是潜在的参与丹参酮生物合成调控的转录因子第122-123页
    小结第123-125页
结论第125-127页
创新点第127-128页
展望第128-129页
参考文献第129-142页
附录第142-149页
致谢第149-150页
作者简介第150-151页

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