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苏云金芽胞杆菌代谢网络的模拟重构及比较分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
缩略语第8-9页
1. 前言第9-24页
    1.1 苏云金芽胞杆菌简介第9-11页
    1.2 苏云金芽胞杆菌基因组学概述第11-13页
    1.3 苏云金芽胞杆菌蛋白质组学概述第13-16页
    1.4 苏云金芽胞杆菌代谢组学概述第16-22页
        1.4.1 代谢网络模拟分析第20-22页
    1.5 苏云金芽胞杆菌YBT-1520、BMB 171、CT-43的特性第22-23页
    1.6 本研究的目的和意义第23-24页
2. 材料与方法第24-29页
    2.1 实验材料第24-25页
        2.1.1 菌株第24页
        2.1.2 培养基第24页
        2.1.3 试剂第24页
        2.1.4 仪器及软件第24-25页
    2.2 实验方法第25-29页
        2.2.1 细菌总RNA抽提第25页
        2.2.2 总RNA反转录成cDNA第25-26页
        2.2.3 PCR扩增第26-27页
        2.2.4 代谢网络模拟重构第27-29页
3. 结果和讨论第29-58页
    3.1 代谢网络的模拟重构第29-33页
        3.1.1 利用AnEnPi软件构建的代谢网络图第29-31页
        3.1.2 利用SEED软件构建的代谢网络图第31-33页
    3.2 模拟代谢网络的比较分析第33-53页
        3.2.1 利用AnEnPi软件构建的代谢途径比较分析第33-43页
            3.2.1.1 碳水化合物代谢途径比较分析第33-39页
            3.2.1.2 氨基酸代谢途径比较分析第39-42页
            3.2.1.3 能量代谢途径比较分析第42-43页
        3.2.2 利用SEED软件构建的代谢网络的比较分析第43-53页
            3.2.2.1 碳水化合物代谢途径的比较分析第43-48页
            3.2.2.2 氨基酸代谢比较分析第48-52页
            3.2.2.3 能量代谢比较分析第52-53页
    3.3 苏云金芽胞杆菌菌株CT-43代谢途径中同功酶的验证第53-57页
    3.4 总结第57-58页
参考文献第58-65页
致谢第65-66页
附录第66页

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