| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-18页 |
| 1.1 课题的研究背景与意义 | 第9-10页 |
| 1.2 蛋白质序列的图形化表示及其应用的研究现状 | 第10-16页 |
| 1.2.1 序列比对 | 第10页 |
| 1.2.2 DNA和RNA序列的图形化表示 | 第10-13页 |
| 1.2.3 蛋白质序列的图形化表示 | 第13-16页 |
| 1.2.4 蛋白质序列的图形化表示的应用的相关研究 | 第16页 |
| 1.3 课题的主要工作及研究内容 | 第16-17页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第17-18页 |
| 第2章 蛋白质序列相关概念及将使用的工具的相关介绍 | 第18-25页 |
| 2.1 蛋白质序列 | 第18-21页 |
| 2.1.1 蛋白质的相关概念 | 第18-20页 |
| 2.1.2 氨基酸的常见的理化性质的介绍 | 第20-21页 |
| 2.1.3 蛋白质的功能 | 第21页 |
| 2.2 文中使用的相关工具的介绍 | 第21-22页 |
| 2.2.1 定量递归分析 | 第21页 |
| 2.2.2 系统进化树 | 第21-22页 |
| 2.2.3 主成分分析 | 第22页 |
| 2.3 文中相关的概念简介 | 第22-24页 |
| 2.3.1 特征矩阵 | 第22-23页 |
| 2.3.2 氨基酸的出现模式及其权重 | 第23-24页 |
| 2.3.3 相似性矩阵 | 第24页 |
| 2.4 小结 | 第24-25页 |
| 第3章 三种 2-D图形化表示蛋白质序列的方法 | 第25-41页 |
| 3.1 基于CM-CURVE的蛋白质序列的图形化表示 | 第26-29页 |
| 3.1.1 CM-Curve | 第26页 |
| 3.1.2 9 种动物的ND5蛋白的图形化表示 | 第26-29页 |
| 3.1.3 图形化结果与分析 | 第29页 |
| 3.2 基于递归图的蛋白质序列图形化表示 | 第29-33页 |
| 3.2.1 递归图分析的思想及步骤 | 第29-30页 |
| 3.2.2 9 种动物的ND5蛋白质序列的定量递归分析法图形化表示 | 第30-32页 |
| 3.2.3 图形化结果与分析 | 第32-33页 |
| 3.3 ADLD图表示蛋白质序列对 | 第33-40页 |
| 3.3.1 主成分分析 | 第33-34页 |
| 3.3.2 主成分分析法分析20种氨基酸的特征 | 第34-36页 |
| 3.3.3 绘制ASD和ADLD图 | 第36-40页 |
| 3.4 小结 | 第40-41页 |
| 第4章 图形化表示蛋白质序列的应用 | 第41-56页 |
| 4.1 蛋白质序列相似性分析 | 第41-52页 |
| 4.1.1 基于CM-Curve的蛋白质序列相似性分析 | 第41-45页 |
| 4.1.2 基于RQA的蛋白质序列相似性分析 | 第45-48页 |
| 4.1.3 基于ADLD图的蛋白质序列间相似性分析 | 第48-51页 |
| 4.1.4 序列相似性分析的不同方法的比较 | 第51-52页 |
| 4.2 系统进化树的构建 | 第52-55页 |
| 4.3 蛋白质序列图形化表示的其它方面的应用 | 第55页 |
| 4.4 小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第64页 |
