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基于多种类型功能基因高通量筛选嗜盐放线菌及潜力菌株的异源表达初探

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 文献综述第9-25页
    引言第9-10页
    1 放线菌是药物开发的重要来源第10页
    2 嗜盐放线菌具有产生新天然产物的巨大潜力第10-16页
        2.1 嗜盐放线菌概述第10-11页
        2.2 嗜盐放线菌多样的物种资源第11-13页
        2.3 嗜盐放线菌丰富的代谢产物第13-15页
        2.4 嗜盐放线菌基因筛选前期探索第15-16页
    3 利用探针进行高通量筛选加速资源开发第16-17页
    4 本研究探索的四类化合物研究现状第17-22页
        4.1 聚酮类Ⅰ和Ⅱ型第17-19页
        4.2 非核糖体多肽类第19-21页
        4.3 二萜类第21-22页
    5 研究内容与意义第22-25页
        5.1 研究内容第22-23页
        5.2 研究意义第23-25页
第二章 菌种分离、菌种库的建立第25-27页
    1 前言第25页
    2 材料方法第25页
        2.1 嗜盐放线菌的分离、纯化和保藏第25页
        2.2 菌种库的建立第25页
    3 结果分析与讨论第25-26页
    4 本章小结第26-27页
第三章 基于多种类型功能基因特异性探针的高通量筛选第27-49页
    1 前言第27页
    2 材料和方法第27-35页
        2.1 嗜盐放线菌基因组DNA的提取第27-28页
        2.2 基于混合模板的多类型基因巢式PCR扩增第28-31页
            2.2.1 引物合成第28页
            2.2.2 DNA样品处理与编号第28-29页
            2.2.3 混合DNA模板首轮扩增第29-30页
            2.2.4 首轮扩增产物的回收第30页
            2.2.5 混合DNA模板第二轮扩增第30-31页
            2.2.6 第二轮扩增产物的回收第31页
        2.3 克隆测序第31-33页
        2.4 设计特异性探针的高通量筛选第33-35页
            2.4.1 标记扩增得到的DNA第33页
            2.4.2 确定标记效率第33-35页
            2.4.3 模板DNA的固定第35页
            2.4.4 DNA杂交第35页
            2.4.5 免疫检测第35页
    3 结果分析与讨论第35-46页
        3.1 基因组DNA的提取第35-36页
        3.2 巢式PCR扩增效果第36-37页
        3.3 克隆测序及分析第37-41页
        3.4 高通量筛选结果第41-46页
    4 本章小结第46-49页
第四章 2株嗜盐放线菌全基因组测序研究第49-63页
    1 前言第49页
    2 材料和方法第49-50页
        2.1 菌株来源第49页
        2.2 基因组DNA提取第49-50页
        2.3 全基因组送样测序第50页
    3 结果分析与讨论第50-61页
        3.1 菌落形态第50-51页
        3.2 基因组DNA提取结果第51页
        3.3 全基因组测序分析结果第51-61页
            3.3.1 YIM96935全基因组信息第51-53页
            3.3.2 YIM96935基因簇信息第53页
            3.3.3 YIM96935主要基因簇分析第53-54页
            3.3.4 YIM96633全基因组信息第54-55页
            3.3.5 YIM96633基因簇信息第55-57页
            3.3.6 YIM96633主要基因簇分析第57-61页
    4 本章小结第61-63页
第五章 2株潜力菌株异源表达的研究第63-69页
    1 前言第63页
    2 材料和方法第63-66页
        2.1 菌株来源第63页
        2.2 大肠杆菌DH5α质粒DNA的提取第63页
        2.3 质粒DNA的酶切第63-65页
            2.3.1 Xba-1酶切质粒DNA第64页
            2.3.2 质粒DNA的去磷酸化第64页
            2.3.3 BamH1酶切去磷酸化的DNA第64-65页
        2.4 2 株嗜盐放线菌菌基因组DNA的提取第65页
        2.5 基因组DNA的部分酶切第65-66页
            2.5.1 酶切时间的确定第65-66页
            2.5.2 酶切浓度的确定第66页
            2.5.3 基因组DNA的部分酶切第66页
    3 结果分析与讨论第66-68页
        3.1 质粒DNA提取结果第66-67页
        3.2 质粒DNA的酶切结果第67-68页
        3.3 2 株潜力菌基因组DNA提取及酶切结果第68页
    4 本章小结第68-69页
总结与展望第69-70页
附录第70-73页
参考文献第73-84页
硕士期间成果第84-85页
致谢第85页

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