| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略表 | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-30页 |
| ·引言 | 第11页 |
| ·肉牛重要经济性状研究进展 | 第11-17页 |
| ·肉牛重要经济性状的分类 | 第11页 |
| ·肉牛重要经济性状候选基因研究进展 | 第11-17页 |
| ·肉牛生长性状候选基因研究进展 | 第12-13页 |
| ·肉牛胴体性状候选基因研究进展 | 第13-14页 |
| ·肉牛肉质性状候选基因研究进展 | 第14-16页 |
| ·肉牛繁殖性状候选基因研究进展 | 第16-17页 |
| ·动物育种技术的发展历程 | 第17-19页 |
| ·常规动物育种 | 第17-18页 |
| ·动物分子育种 | 第18-19页 |
| ·以分子数量遗传学为基础的动物育种 | 第19页 |
| ·全基因组选择在畜禽育种中的应用 | 第19-28页 |
| ·全基因组选择概念及原理 | 第19-20页 |
| ·全基因组选择实施步骤和方法 | 第20-25页 |
| ·影响基因组估计育种值可靠性因素 | 第25-26页 |
| ·全基因组选择的研究进展及在畜禽育种中的应用 | 第26-28页 |
| ·研究目的和意义 | 第28-30页 |
| 第二章 材料与方法 | 第30-46页 |
| ·试验材料 | 第30-32页 |
| ·试验动物-群体构建 | 第30页 |
| ·血样采集 | 第30页 |
| ·SNP 芯片 | 第30-31页 |
| ·性状表型记录 | 第31-32页 |
| ·主要仪器设备、试剂及配制方法 | 第32-33页 |
| ·主要试剂及来源 | 第32页 |
| ·其他试剂的配制 | 第32-33页 |
| ·主要试验设备及来源 | 第33页 |
| ·实验方法与步骤 | 第33-40页 |
| ·牛基因组 DNA 的提取及质量检测 | 第33-35页 |
| ·牛全血基因组DNA 的提取步骤 | 第34页 |
| ·牛冻精基因组DNA 的提取步骤 | 第34页 |
| ·DNA 质量控制及检测 | 第34-35页 |
| ·性状表型记录的测定方法 | 第35页 |
| ·SNP 芯片试验流程 | 第35-37页 |
| ·数据的预处理 | 第37-40页 |
| ·性状表型记录数据预处理 | 第37页 |
| ·表型数据的校正 | 第37-38页 |
| ·SNP 芯片数据的预处理 | 第38-40页 |
| ·统计分析方法 | 第40-46页 |
| ·基于marker 构建kinship | 第40-41页 |
| ·方差组分及育种值的估计 | 第41-42页 |
| ·基于标记信息估计育种值准确性验证 | 第42-43页 |
| ·估计 SNP 效应值 | 第43-44页 |
| ·GibbsGBLUP | 第43-44页 |
| ·BayesA | 第44页 |
| ·BayesB | 第44页 |
| ·预测群体 GEBV 可靠性验证 | 第44-46页 |
| ·2 倍交叉验证 | 第45页 |
| ·种公牛作为预测群体 | 第45-46页 |
| 第三章 结果与分析 | 第46-58页 |
| ·牛基因组DNA 的提取和检测 | 第46页 |
| ·SNP 筛选及质量控制结果 | 第46-48页 |
| ·参考群体遗传分布图 | 第48页 |
| ·基于marker 构建kinship 估计育种值准确性 | 第48-49页 |
| ·估计SNP 效应值 | 第49-50页 |
| ·基因组估计育种值的准确性及可靠性 | 第50-55页 |
| ·基因组估计育种值的准确性 | 第50-53页 |
| ·基因组估计育种值的可靠性 | 第53-55页 |
| ·基因组估计育种值的准确性验证 | 第55-58页 |
| 第四章 讨论 | 第58-61页 |
| ·关于基于marker 构建kinship 估计育种值 | 第58-59页 |
| ·关于影响基因组估计育种值准确性因素 | 第59-61页 |
| ·标记密度和标记类型 | 第59页 |
| ·用于估计 SNP 效应值的个体数目 | 第59页 |
| ·性状遗传力 | 第59-60页 |
| ·不同的统计方法 | 第60-61页 |
| 第五章 全文结论 | 第61-62页 |
| ·结论 | 第61页 |
| ·本研究的创新点 | 第61页 |
| ·下一步要进行的工作 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 作者简历 | 第71页 |