| 摘要 | 第11-15页 |
| ABSTRACT | 第15-20页 |
| 缩写符号(ABBREVIATION) | 第21-23页 |
| 第一部分 文献综述 | 第23-67页 |
| 第一章 公牛精液品质性状选育研究进展 | 第23-31页 |
| 1 公牛精液品质的主要指标 | 第23页 |
| 2 影响公牛精液品质性状的主要因素 | 第23页 |
| 3 我国公牛繁殖产业现状 | 第23-24页 |
| 3.1 种公牛优质冻精的产能低 | 第23-24页 |
| 3.2 种公牛冻精在奶业发展上的作用有待提高 | 第24页 |
| 3.3 种公牛“自主培育”能力差 | 第24页 |
| 4 公牛精液品质性状分子选育研究策略 | 第24-27页 |
| 4.1 公牛精液品质性状基因的克隆与功能验证 | 第24-26页 |
| 4.2 测序和芯片技术的应用 | 第26-27页 |
| 参考文献 | 第27-31页 |
| 第二章 公牛精液品质性状选育的分子基础 | 第31-59页 |
| 1 单核苷酸多态性 | 第31-35页 |
| 1.1 SNP概念及分类 | 第31页 |
| 1.2 SNPs特点 | 第31页 |
| 1.3 SNPs检测方法 | 第31-32页 |
| 1.4 SNP应用 | 第32页 |
| 1.5 SNP与生精障碍 | 第32-35页 |
| 2 可变剪切 | 第35-42页 |
| 2.1 可变剪切的定义 | 第35页 |
| 2.2 可变剪切的分类 | 第35页 |
| 2.3 可变剪切的作用 | 第35-37页 |
| 2.4 可变剪切的调控 | 第37-38页 |
| 2.5 睾丸中发生的可变剪切事件 | 第38-42页 |
| 2.6 可变剪切与SNP | 第42页 |
| 3 启动子 | 第42-44页 |
| 3.1 概念 | 第42页 |
| 3.2 真核启动子类型 | 第42-43页 |
| 3.3 启动子研究方法 | 第43页 |
| 3.4 牛基因启动子与SNP | 第43-44页 |
| 4 MIRNA | 第44-48页 |
| 4.1 miRNA定义及特征 | 第44页 |
| 4.2 miRNA的生物合成 | 第44-45页 |
| 4.3 miRNA靶基因的预测 | 第45-46页 |
| 4.4 miRNA的功能 | 第46页 |
| 4.5 miRNA与睾丸 | 第46-47页 |
| 4.6 miRNA相关单核苷酸多态性 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-59页 |
| 第三章 KATNAL1和GSK3α/β基因研究进展 | 第59-67页 |
| 1 类剑蛋白P60亚基A1 | 第59-60页 |
| 2 糖原合成酶激酶3(GSK3)的研究进展 | 第60-62页 |
| 2.1 GSK3发现与分类 | 第60页 |
| 2.2 GSK3亚细胞定位 | 第60-61页 |
| 2.3 GSK3作用底物 | 第61页 |
| 2.4 参与的信号通路 | 第61页 |
| 2.5 GSK3与抑制剂 | 第61页 |
| 2.6 GSK3与精子 | 第61-62页 |
| 3 研究目的及意义 | 第62-63页 |
| 3.1 研究问题和假设的提出 | 第62页 |
| 3.2 研究目的和意义 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-67页 |
| 第二部分 试验研究 | 第67-177页 |
| 第四章 中国荷斯坦公牛KATNAL1基因可变剪切体鉴定与表达分析 | 第67-87页 |
| 1 材料与方法 | 第67-72页 |
| 1.1 材料 | 第67-68页 |
| 1.2 试验方法 | 第68-71页 |
| 1.3 数据统计 | 第71-72页 |
| 2 试验结果 | 第72-82页 |
| 2.1 RNA检测结果 | 第72-73页 |
| 2.2 可变剪切体的鉴定 | 第73页 |
| 2.3 两种剪切体基因结构的比对 | 第73-75页 |
| 2.4 牛KATNAL1基因及不同转录本相对定量 | 第75-76页 |
| 2.5 生物信息学分析 | 第76-82页 |
| 3 讨论 | 第82-84页 |
| 4 小结 | 第84页 |
| 参考文献 | 第84-87页 |
| 第五章 中国荷斯坦公牛KATNAL1基因启动子活性分析与功能SNPS鉴定 | 第87-109页 |
| 1 材料与方法 | 第87-97页 |
| 1.1 材料 | 第87-88页 |
| 1.2 试验方法 | 第88-96页 |
| 1.3 数据统计 | 第96-97页 |
| 2 结果 | 第97-104页 |
| 2.1 牛KATNAL1基因启动子生物信息学分析 | 第97页 |
| 2.2 牛KATNAL1基因第二启动子和保留的内含子附近区域SNP鉴定 | 第97-98页 |
| 2.3 两个SNPs功能性预测 | 第98页 |
| 2.4 两个SNPs基因分型(Bi-PASA和RFLP) | 第98-99页 |
| 2.5 牛KATNAL1基因遗传参数统计分析 | 第99-100页 |
| 2.6 三个种公牛站精液品质数据统计 | 第100页 |
| 2.7 牛KATNAL1基因不同基因型与公牛精液性状的相关性分析 | 第100-101页 |
| 2.8 牛KATNAL1基因不同单倍型组合与公牛精液品质性状的相关性分析 | 第101-102页 |
| 2.9 细胞转染与荧光检测的结果 | 第102-103页 |
| 2.10 牛KATNAL1基因缺失启动子活性分析 | 第103-104页 |
| 3 讨论 | 第104-105页 |
| 4 小结 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-109页 |
| 第六章 牛KATNAL1基因3’UTR靶位点SNP对BTA-MIR-22-5P调控靶基因表达的影响 | 第109-121页 |
| 1 材料与方法 | 第109-113页 |
| 1.1 材料 | 第109页 |
| 1.2 方法 | 第109-113页 |
| 1.3 统计分析 | 第113页 |
| 2 结果 | 第113-118页 |
| 2.1 SNP的发现及生物信息学分析 | 第113-114页 |
| 2.2 突变位点生物信息学分析 | 第114-115页 |
| 2.3 睾丸miRNA芯片关于bta-miR-3600/22-5p簇表达量分析 | 第115页 |
| 2.4 双荧光素酶活性分析 | 第115-116页 |
| 2.5 不同基因型KATNAL1 mRNA表达量分析 | 第116-117页 |
| 2.6 SNP分型 | 第117页 |
| 2.7 牛KATNAL1基因不同基因型与公牛精液性状的相关性分析 | 第117-118页 |
| 3 讨论 | 第118-119页 |
| 4 小结 | 第119页 |
| 参考文献 | 第119-121页 |
| 第七章 中国荷斯坦公牛GSK3β基因可变剪切体鉴定与基因表达分析 | 第121-135页 |
| 1 材料与方法 | 第121-124页 |
| 1.1 材料 | 第121-122页 |
| 1.2 方法 | 第122-124页 |
| 1.3 数据统计 | 第124页 |
| 2 试验结果 | 第124-131页 |
| 2.1 可变剪切体的鉴定 | 第124-125页 |
| 2.2 牛GSK3β基因及不同转录本的组织表达分析 | 第125-126页 |
| 2.3 生物信息学分析 | 第126-131页 |
| 3 讨论 | 第131-133页 |
| 4 小结 | 第133页 |
| 参考文献 | 第133-135页 |
| 第八章 PRE-MIR-320B序列中SNP G12A通过靶向调控GSK3β与中国荷斯坦公牛的鲜精密度存在关联 | 第135-155页 |
| 1 材料与方法 | 第135-141页 |
| 1.1 材料 | 第135-136页 |
| 1.2 方法 | 第136-141页 |
| 1.3 统计分析 | 第141页 |
| 2 结果 | 第141-149页 |
| 2.1 SNP鉴定与分型 | 第141-142页 |
| 2.2 不同基因型与公牛精液性状的相关性分析 | 第142页 |
| 2.3 bta-miR-320b及其靶基因生物信息学预测 | 第142-143页 |
| 2.4 双荧光素酶活性检测 | 第143-145页 |
| 2.5 颈环法定量miRNA | 第145-148页 |
| 2.6 两种基因型成年公牛和小公牛的GSK3βmRNA表达比较 | 第148-149页 |
| 3 讨论 | 第149-151页 |
| 4 小结 | 第151页 |
| 参考文献 | 第151-155页 |
| 第九章 GSK3α基因核心启动子的克隆和功能性SNPS的鉴定 | 第155-177页 |
| 1 材料与方法 | 第155-162页 |
| 1.1 材料 | 第155-156页 |
| 1.2 方法 | 第156-162页 |
| 1.3 统计分析 | 第162页 |
| 2 结果 | 第162-171页 |
| 2.1 牛基因cDNA序列、编码氨基酸和蛋白结构域分析 | 第162-163页 |
| 2.2 牛GSK3α基因缺失启动子活性分析 | 第163-165页 |
| 2.3 牛GSK3α基因启动子区域CpG岛预测 | 第165页 |
| 2.4 高、低精子活力牛GSK3α基因核心启动子区甲基化差异分析 | 第165-167页 |
| 2.5 牛GSK3α基因SNP鉴定与分型 | 第167-168页 |
| 2.6 关联性分析 | 第168-171页 |
| 3 讨论 | 第171-173页 |
| 4 小结 | 第173-174页 |
| 参考文献 | 第174-177页 |
| 全文结论 | 第177-179页 |
| 创新点及下一步研究工作 | 第179-181页 |
| 附录 | 第181-185页 |
| 致谢 | 第185-187页 |
| 攻读博士期间发表论文 | 第187页 |
