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利用染色体不同整合位点构建具有木糖代谢能力的重组酿酒酵母菌株

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
引言第12-13页
1 酿酒酵母木糖代谢研究进展第13-26页
    1.1 传统乙醇发酵技术第13页
    1.2 我国发展木质纤维素乙醇的优势第13-15页
    1.3 木质纤维素乙醇关键技术—混合糖发酵菌株第15-24页
        1.3.1 木质纤维素乙醇发酵菌株构建的宿主第15页
        1.3.2 酿酒酵母发酵木质纤维素乙醇的技术难点第15页
        1.3.3 重组酿酒酵母的XR-XDH木糖代谢途径第15-17页
        1.3.4 XR、XDH的辅酶不平衡导致木糖醇积累及解决措施第17-18页
        1.3.5 重组酿酒酵母的XI木糖代谢途径第18-19页
        1.3.6 增强酿酒酵母非氧化磷酸戊糖途径基因的表达第19页
        1.3.7 酿酒酵母木糖转运蛋白的研究第19-20页
        1.3.8 酿酒酵母呼吸作用对木糖代谢的影响第20页
        1.3.9 利用启动子调节木糖代谢途径基因的表达第20-21页
        1.3.10 调节酿酒酵母木糖代谢的其他基因工程手段第21-22页
        1.3.11 半纤维素水解液中乙酸对重组菌株发酵的影响第22-23页
        1.3.12 絮凝与菌株耐受性第23页
        1.3.13 位置效应第23-24页
    1.4 论文内容和研究意义第24-26页
        1.4.1 论文研究内容和研究目的第24页
        1.4.2 课题整体策略第24页
        1.4.3 研究目的和需要解决的问题第24-26页
2 构建不同整合方式的木糖代谢途径表达载体第26-43页
    2.1 引言第26页
    2.2 材料和方法第26-38页
        2.2.1 菌株和培养基第26-27页
        2.2.2 分子克隆所用载体、酶、试剂及试剂盒第27页
        2.2.3 菌株S.stipitis和S.cerevisiae的氨基酸密码子偏好性分析第27页
        2.2.4 分子生物学方法第27-35页
        2.2.5 基因克隆和载体构建第35-38页
    2.3 结果和讨论第38-42页
        2.3.1 组成基因盒片段的PCR扩增结果第38页
        2.3.2 基因盒pAUR-PsXR、pAUR-PsXDH、pAUR-ScXK和pAUR-PsXR-PsXDH-ScXK载体的构建第38-39页
        2.3.3 阳性转化子的筛选第39-40页
        2.3.4 重组酿酒酵母的传代实验第40-42页
    2.4 本章小结第42-43页
3 木糖还原酶辅因子偏好性突变体的获得及重组菌株的比较第43-62页
    3.1 引言第43页
    3.2 材料和方法第43-48页
        3.2.1 菌株和培养基第43页
        3.2.2 分子克隆所用酶、试剂及试剂盒第43页
        3.2.3 木糖还原酶基因的定点突变第43-46页
        3.2.4 载体连接、大肠杆菌转化及质粒提取第46页
        3.2.5 PsmXR突变型基因盒的构建第46页
        3.2.6 酵母电转化实验第46页
        3.2.7 重组菌株的基因型第46页
        3.2.8 提取总RNA和半定量PCR的测定第46-47页
        3.2.9 粗酶活测定第47页
        3.2.10 摇瓶发酵实验第47-48页
        3.2.11 菊芋秸秆水解液发酵实验第48页
        3.2.12 发酵液成分分析第48页
        3.2.13 利用基因组改组策略提高菌株的木糖代谢能力第48页
        3.2.14 菌株S.stipitis基因组DNA的提取第48页
    3.3 结果与讨论第48-61页
        3.3.1 野生型PsXR基因的定点突变第48-49页
        3.3.2 PsmXR基因盒片段的扩增第49页
        3.3.3 含有PsmXR基因的质粒构建第49-50页
        3.3.4 载体线性化实验第50-51页
        3.3.6 比较ZQ1、ZQ3木糖代谢途径基因的转录水平和酶活水平第51页
        3.3.7 比较ZQ2、ZQ4木糖代谢途径基因的转录水平和酶活水平第51-53页
        3.3.8 ZQ1-ZQ4的混合糖限氧发酵能力比较第53-57页
        3.3.9 ZQ2、ZQ4在菊芋秸秆水解液中的限氧发酵实验第57-59页
        3.3.10 基因组改组后的杂合菌株形态特点第59页
        3.3.11 第二轮基因组改组后阳性克隆子的发酵实验第59-60页
        3.3.12 第三轮基因组改组后阳性克隆子的发酵实验第60-61页
    3.4 本章小结第61-62页
4 不同宿主遗传背景对重组菌株发酵的影响第62-70页
    4.1 引言第62页
    4.2 材料与方法第62-64页
        4.2.1 菌株和质粒第62页
        4.2.2 生长培养基、筛选培养基和发酵培养基第62页
        4.2.3 木糖代谢途径基因整合载体的构建第62页
        4.2.4 酵母转化实验第62页
        4.2.5 重组菌株的基因型第62-63页
        4.2.6 总RNA的制备和半定量RT-PCR的测定第63页
        4.2.7 粗酶液的制备和相应酶活性的检测第63页
        4.2.8 野生型菌株的乙醇耐性和乙酸耐性比较第63-64页
        4.2.9 摇瓶发酵实验第64页
        4.2.10 菊芋秸秆水解液发酵实验第64页
        4.2.11 发酵液成分分析第64页
    4.3 结果与讨论第64-69页
        4.3.1 野生型工业酿酒酵母的耐受性比较第64页
        4.3.2 木糖代谢途径基因在不同宿主菌株的转录水平比较第64页
        4.3.3 木糖代谢途径基因在重组酿酒酵母中的酶活水平比较第64-66页
        4.3.4 重组菌株混合糖中的限氧发酵第66-67页
        4.3.5 重组菌株ZQ5在菊芋秸秆水解液中的发酵第67-69页
    4.4 本章小结第69-70页
5 构建具有絮凝能力的重组菌株第70-79页
    5.1 引言第70页
    5.2 材料和方法第70-72页
        5.2.1 菌株和培养基第70-71页
        5.2.2 基因盒片段扩增和FLO1-PHO13载体的构建第71页
        5.2.3 载体线性化和酵母电转化实验第71页
        5.2.4 耐受性实验第71-72页
    5.3 结果与讨论第72-78页
        5.3.1 基因盒片段PCR扩增结果第72页
        5.3.2 载体线性化第72页
        5.3.3 重组菌株的基因型第72-74页
        5.3.4 酵母电转及验证结果第74-75页
        5.3.5 ZQ8的乙酸和乙醇耐受性实验第75页
        5.3.6 ZQ8、ZQ9的耐受能力比较第75-76页
        5.3.7 ZQ9与野生型工业菌株的耐受性比较第76-77页
        5.3.8 ZQ8与ZQ9的絮凝能力比较第77-78页
    5.4 本章小结第78-79页
结论第79-80页
创新点摘要第80-81页
展望第81-82页
参考文献第82-93页
附录A 基因序列第93-105页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第105-106页
作者简介第106-107页
致谢第107-109页

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