| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-7页 |
| 缩略词及英汉对照表 | 第8-14页 |
| 1 前言 | 第14-25页 |
| 1.1 研究背景 | 第14-23页 |
| 1.1.1 亚洲柑橘木虱与柑橘黄龙病 | 第14-16页 |
| 1.1.2 马铃薯木虱与马铃薯斑马病 | 第16-18页 |
| 1.1.3 基因组学的概况 | 第18-19页 |
| 1.1.4 木虱共生菌的研究进展 | 第19-21页 |
| 1.1.5 木虱携带的韧皮部杆菌研究进展 | 第21-22页 |
| 1.1.6 线粒体基因组概况及应用 | 第22-23页 |
| 1.2 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 1.3 研究技术路线 | 第24-25页 |
| 2 亚洲柑橘木虱和马铃薯木虱的饲养 | 第25-35页 |
| 2.1 引言 | 第25-26页 |
| 2.2 材料与方法 | 第26-28页 |
| 2.2.1 供试寄主 | 第26页 |
| 2.2.2 供试虫源 | 第26页 |
| 2.2.3 仪器设备 | 第26页 |
| 2.2.4 亚洲柑橘木虱的室内饲养方法 | 第26-27页 |
| 2.2.5 不同寄主梢对亚洲柑橘木虱若虫存活的影响 | 第27页 |
| 2.2.6 不同寄主梢对亚洲柑橘木虱成虫存活的影响 | 第27-28页 |
| 2.2.7 两种番茄寄主对马铃薯木虱若虫的影响 | 第28页 |
| 2.2.8 两种番茄寄主对马铃薯木虱成虫存活的影响 | 第28页 |
| 2.2.9 数据统计 | 第28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-33页 |
| 2.3.1 不同寄主梢对亚洲柑橘木虱若虫存活的影响 | 第28-29页 |
| 2.3.2 不同寄主梢对亚洲柑橘木虱成虫存活的影响 | 第29-31页 |
| 2.3.3 两种番茄寄主对马铃薯木虱若虫的影响 | 第31-32页 |
| 2.3.4 两种番茄寄主对马铃薯木虱成虫存活的影响 | 第32-33页 |
| 2.4 小结 | 第33-35页 |
| 3 亚洲柑橘木虱和马铃薯木虱的饲菌方法及获菌规律研究 | 第35-52页 |
| 3.1 引言 | 第35-36页 |
| 3.2 材料与方法 | 第36-44页 |
| 3.2.1 昆虫来源 | 第36页 |
| 3.2.2 植物材料 | 第36页 |
| 3.2.3 主要试剂与耗材 | 第36页 |
| 3.2.4 仪器设备 | 第36-37页 |
| 3.2.5 主要试剂配制 | 第37-38页 |
| 3.2.6 昆虫DNA的试剂盒提取方法 | 第38页 |
| 3.2.7 植物DNA的提取方法 | 第38-39页 |
| 3.2.8 琼脂糖凝胶制作方法 | 第39页 |
| 3.2.9 DNA浓度的测定 | 第39-40页 |
| 3.2.10 韧皮部杆菌的常规PCR扩增 | 第40-41页 |
| 3.2.11 韧皮部杆菌的Nested-PCR扩增 | 第41页 |
| 3.2.12 PCR扩增产物的电泳检测 | 第41页 |
| 3.2.13 实时荧光质粒的制备 | 第41-43页 |
| 3.2.14 韧皮部杆菌的绝对定量实时荧光PCR | 第43页 |
| 3.2.15 两种木虱带菌分界线的确定 | 第43-44页 |
| 3.2.16 获菌虫期对亚洲柑橘木虱获菌率和带菌量的影响 | 第44页 |
| 3.2.17 获菌虫期对马铃薯木虱带菌率和带菌量的影响 | 第44页 |
| 3.2.18 数据统计 | 第44页 |
| 3.3 结果与分析 | 第44-51页 |
| 3.3.1 质粒质量验证 | 第44-47页 |
| 3.3.2 两种木虱带菌分界线的确定 | 第47页 |
| 3.3.3 饲菌虫期对亚洲柑橘木虱带菌率和带菌量的影响 | 第47页 |
| 3.3.4 饲菌虫期对马铃薯木虱带菌率和带菌量的影响 | 第47-51页 |
| 3.4 小结 | 第51-52页 |
| 4 亚洲柑橘木虱和马铃薯木虱内生原核生物的研究 | 第52-80页 |
| 4.1 引言 | 第52页 |
| 4.2 材料与方法 | 第52-61页 |
| 4.2.1 主要试剂和耗材 | 第52-53页 |
| 4.2.2 仪器设备 | 第53页 |
| 4.2.3 木虱DNA的准备和NGS测序 | 第53-55页 |
| 4.2.4 木虱测序文库的组装、初步鉴定和分类 | 第55-57页 |
| 4.2.5 基因组的再次验证和拼接 | 第57-61页 |
| 4.3 结果与分析 | 第61-77页 |
| 4.3.1 木虱DNA质量验证 | 第61-64页 |
| 4.3.2 木虱测序de novo组装结果分析 | 第64-66页 |
| 4.3.3 亚洲柑橘木虱内生原核生物基因组 | 第66-74页 |
| 4.3.4 马铃薯木虱内生原核生物基因组 | 第74-77页 |
| 4.4 小结 | 第77-80页 |
| 5 比较马铃薯木虱与三种已知木虱的线粒体基因组 | 第80-98页 |
| 5.1 引言 | 第80页 |
| 5.2 材料与方法 | 第80-83页 |
| 5.2.1 马铃薯木虱线粒体基因组的获得和装配 | 第80-81页 |
| 5.2.2 马铃薯木虱线粒体基因注释和序列分析 | 第81页 |
| 5.2.3 系统发育树的构建 | 第81-83页 |
| 5.3 结果与分析 | 第83-96页 |
| 5.3.1 马铃薯木虱线粒体基因组结构分析 | 第83-84页 |
| 5.3.2 线粒体核苷酸成分比较分析 | 第84-85页 |
| 5.3.3 蛋白质编码基因（PCGs）的密码子选择 | 第85-87页 |
| 5.3.4 PCGs的密码子选择 | 第87-89页 |
| 5.3.5 r RNA基因 | 第89页 |
| 5.3.6 PCGs和r RNA基因的多样性分析 | 第89-93页 |
| 5.3.7 转移RNA基因 | 第93-95页 |
| 5.3.8 控制区 | 第95页 |
| 5.3.9 系统发育关系 | 第95-96页 |
| 5.4 小结 | 第96-98页 |
| 6 不同地区亚洲柑橘木虱线粒体基因组的比较分析 | 第98-113页 |
| 6.1 引言 | 第98页 |
| 6.2 材料与方法 | 第98-102页 |
| 6.2.1 材料收集 | 第98-99页 |
| 6.2.2 线粒体基因组的获得和注释 | 第99页 |
| 6.2.3 引物设计及序列扩增 | 第99-100页 |
| 6.2.4 线粒体cox1分析及系统发育树的构建 | 第100-102页 |
| 6.3 结果与分析 | 第102-111页 |
| 6.3.1 不同地区线粒体基因组的差异分析 | 第102-103页 |
| 6.3.2 线粒体核苷酸多样性比较 | 第103-106页 |
| 6.3.3 线粒体cox1分析及系统发育树的构建 | 第106-107页 |
| 6.3.4 不同地区t RNA差异比较 | 第107-108页 |
| 6.3.5 通过常规PCR区分木虱来源 | 第108-109页 |
| 6.3.6 亚洲柑橘木虱线粒体全基因组扩增通用引物 | 第109-111页 |
| 6.4 小结 | 第111-113页 |
| 7 结论与讨论 | 第113-116页 |
| 7.1 结论 | 第113页 |
| 7.2 讨论 | 第113-114页 |
| 7.3 主要创新点 | 第114-115页 |
| 7.4 后续工作计划 | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 参考文献 | 第117-128页 |
| 附录A 本文使用到的附图 | 第128-130页 |
| 附录B 本文使用到的附表 | 第130-132页 |
| 附录C 基因COG分析中字母代表信息 | 第132-133页 |
| 附录D 本文所编写的编程脚本 | 第133-135页 |
| 附录E 博士期间发表论文情况 | 第135-136页 |
