含假结的RNA二级结构预测算法研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外发展现状 | 第11-12页 |
| 1.3 论文组织结构 | 第12-14页 |
| 第2章 RNA二级结构背景知识 | 第14-22页 |
| 2.1 RNA | 第14-15页 |
| 2.2 RNA二级结构及假结 | 第15-20页 |
| 2.2.1 RNA二级结构 | 第15-17页 |
| 2.2.2 假结 | 第17-19页 |
| 2.2.3 表示方法 | 第19-20页 |
| 2.3 最近邻数据库 | 第20-21页 |
| 2.4 假结能量模型 | 第21页 |
| 2.5 本章小结 | 第21-22页 |
| 第3章 带假结RNA二级结构预测算法 | 第22-32页 |
| 3.1 比较序列分析法 | 第22-23页 |
| 3.2 基于最小自由能的动态规划方法 | 第23-24页 |
| 3.3 启发式方法 | 第24-31页 |
| 3.3.1 ILM算法 | 第25-27页 |
| 3.3.2 HotKnots算法 | 第27-28页 |
| 3.3.3 FlexStem算法 | 第28-31页 |
| 3.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第4章 包含假结的二级结构预测算法 | 第32-46页 |
| 4.1 算法概述 | 第32页 |
| 4.2 相关定义 | 第32-33页 |
| 4.3 不含假结的RNA二级结构预测 | 第33-38页 |
| 4.3.1 RNA折叠阶段划分 | 第34-36页 |
| 4.3.2 阶段内搜索最佳结构 | 第36-38页 |
| 4.4 带假结的RNA二级结构预测 | 第38-42页 |
| 4.5 Med Fold与其他算法比较 | 第42-46页 |
| 4.5.1 评价标准 | 第43页 |
| 4.5.2 MedFold与不含假结的软件比较 | 第43-45页 |
| 4.5.3 MedFold与含假结的软件比较 | 第45-46页 |
| 第5章 总结与展望 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
