| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 1.1 大豆品种资源 | 第11-12页 |
| 1.1.1 大豆品种资源的保存现状 | 第11页 |
| 1.1.2 我国现阶段大豆生态区的划分 | 第11-12页 |
| 1.2 大豆—根瘤菌共生体系 | 第12-14页 |
| 1.2.1 大豆与根瘤菌间的相互作用关系 | 第12-13页 |
| 1.2.2 大豆根瘤菌的多样性 | 第13-14页 |
| 1.2.3 大豆根瘤菌在农业上的应用 | 第14页 |
| 1.3 土壤微生物群落研究 | 第14-17页 |
| 1.3.1 中性理论和生态位理论 | 第14-15页 |
| 1.3.2 植物对土壤属性的影响 | 第15-16页 |
| 1.3.3 根际微生物在农业系统和自然系统中的驱动过程 | 第16-17页 |
| 1.4 土壤微生物多样性研究方法 | 第17-19页 |
| 1.4.1 传统及现代分子生物学技术 | 第17-18页 |
| 1.4.2 高通量测序分析技术 | 第18-19页 |
| 1.5 本实验的研究目的意义和技术路线 | 第19-21页 |
| 1.5.1 实验研究目的 | 第19页 |
| 1.5.2 实验技术路线 | 第19-21页 |
| 第二章 不同品种大豆与其种植土壤中根瘤菌匹配性研究 | 第21-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第21-23页 |
| 2.1.2 主要试剂、仪器 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-25页 |
| 2.2.1 大豆根瘤的采集 | 第23页 |
| 2.2.2 根瘤菌的筛选、纯化和保藏 | 第23-24页 |
| 2.2.3 提取菌株总DNA以及 16S rRNA基因扩增 | 第24-25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-35页 |
| 2.3.1 26 个不同品种大豆各生物性状分析 | 第25-28页 |
| 2.3.2 16S rRNA序列及系统发育分析结果 | 第28-35页 |
| 2.4 讨论 | 第35-37页 |
| 第三章 大豆根际、根区土壤根瘤菌多样性及其功能研究 | 第37-57页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-38页 |
| 3.1.1 样品来源 | 第37页 |
| 3.1.2 Illumina HiSeq高通量测序 | 第37-38页 |
| 3.2 试验方法 | 第38-41页 |
| 3.2.1 大豆植株根际土壤的收集 | 第38页 |
| 3.2.2 土壤总DNA的提取 | 第38页 |
| 3.2.3 高通量测序分析 | 第38页 |
| 3.2.4 根瘤菌共生结瘤基因的扩增 | 第38-40页 |
| 3.2.5 根瘤菌持家基因rpoB和atpD的扩增 | 第40-41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-54页 |
| 3.3.1 测序数据信息 | 第41页 |
| 3.3.2 不同土壤样品的微生物多样性 | 第41-47页 |
| 3.3.3 大豆根瘤菌共生固氮基因系统发育分析 | 第47-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-57页 |
| 3.4.1 不同大豆品种根际对根瘤菌类群富集的影响 | 第54-55页 |
| 3.4.2 不同大豆品种根际对共生基因富集及对根瘤菌选择的影响 | 第55-57页 |
| 第四章 讨论和结论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 附录 | 第64-71页 |
| S1 材料与方法 | 第64-66页 |
| S1-1 CTAB法提取细菌总DNA的步骤 | 第64页 |
| S1-2 利用MP Fast DNA SPIN Kit for soil试剂盒提取土壤总DNA的方案 | 第64-65页 |
| S1-3 试验中空白土壤理化特征 | 第65-66页 |
| S2 各样品宏基因组测序信息 | 第66页 |
| S3 本试验分离到的菌株信息 | 第66-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 作者简介 | 第72页 |
