基因表达数据的双聚类分析与研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第15-34页 |
| 1.1 论文研究背景及意义 | 第15-17页 |
| 1.2 国内外相关研究进展 | 第17-30页 |
| 1.2.1 早期阶段 | 第17-19页 |
| 1.2.2 壮大阶段 | 第19-24页 |
| 1.2.3 当前阶段 | 第24-30页 |
| 1.3 论文的主要工作与贡献 | 第30-32页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第32-34页 |
| 第二章 基因表达数据的双聚类分析相关基础 | 第34-53页 |
| 2.1 基因表达数据 | 第34页 |
| 2.2 双聚类的相关概念 | 第34-38页 |
| 2.2.1 双聚类的定义 | 第34-35页 |
| 2.2.2 双聚类的类型 | 第35-36页 |
| 2.2.3 双聚类的结构 | 第36-38页 |
| 2.3 双聚类的质量评价指标 | 第38-42页 |
| 2.4 双聚类分析方法的分类 | 第42-45页 |
| 2.4.1 基于质量评价指标的双聚类分析方法 | 第42-44页 |
| 2.4.2 基于模型的双聚类分析方法 | 第44-45页 |
| 2.5 双聚类的验证指标 | 第45-49页 |
| 2.5.1 质量验证指标 | 第45-47页 |
| 2.5.2 生物验证指标 | 第47-49页 |
| 2.6 元启发式算法 | 第49-52页 |
| 2.6.1 遗传算法 | 第49-50页 |
| 2.6.2 布谷鸟搜索算法 | 第50-52页 |
| 2.7 本章小结 | 第52-53页 |
| 第三章 基于布谷鸟搜索的双聚类分析 | 第53-66页 |
| 3.1 布谷鸟搜索双聚类分析 | 第53-57页 |
| 3.1.1 双聚类的编码表示 | 第54页 |
| 3.1.2 适应度函数设计 | 第54页 |
| 3.1.3 种群初始化 | 第54页 |
| 3.1.4 巢搜索 | 第54-56页 |
| 3.1.5 宿主弃巢 | 第56页 |
| 3.1.6 停止条件 | 第56-57页 |
| 3.2 实验环境及基因表达数据 | 第57-58页 |
| 3.2.1 实验环境 | 第57页 |
| 3.2.2 基因表达数据 | 第57-58页 |
| 3.3 实验结果比较分析 | 第58-65页 |
| 3.3.1 宿主弃巢比例分析 | 第58页 |
| 3.3.2 比较算法介绍 | 第58-59页 |
| 3.3.3 CSB算法的质量验证指标比较分析 | 第59-62页 |
| 3.3.4 CSB算法的生物验证指标比较分析 | 第62-65页 |
| 3.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 第四章 基于遗传算法和布谷鸟搜索的混合双聚类分析 | 第66-82页 |
| 4.1 混合双聚类分析算法 | 第66-69页 |
| 4.1.1 编码设计 | 第66页 |
| 4.1.2 适应度函数设计 | 第66-67页 |
| 4.1.3 种群初始化 | 第67页 |
| 4.1.4 混合方案设计 | 第67-69页 |
| 4.1.5 停止条件 | 第69页 |
| 4.2 实验结果比较分析 | 第69-81页 |
| 4.2.1 混合策略比较 | 第70页 |
| 4.2.2 GACSB算法的质量验证指标比较分析 | 第70-73页 |
| 4.2.3 GACSB算法的生物验证指标比较分析 | 第73-78页 |
| 4.2.4 GACSB算法的扩展性分析 | 第78-81页 |
| 4.3 本章小结 | 第81-82页 |
| 第五章 基于多目标布谷鸟搜索的双聚类分析 | 第82-96页 |
| 5.1 多目标优化问题的基本概念 | 第82-84页 |
| 5.2 多目标布谷鸟搜索算法 | 第84-85页 |
| 5.3 基于多目标布谷鸟搜索双聚类分析算法 | 第85-88页 |
| 5.3.1 编码设计 | 第85页 |
| 5.3.2 适应度函数设计 | 第85-86页 |
| 5.3.3 初始化种群 | 第86页 |
| 5.3.4 巢搜索 | 第86-87页 |
| 5.3.5 宿主弃巢 | 第87页 |
| 5.3.6 停止条件 | 第87-88页 |
| 5.4 实验结果比较分析 | 第88-94页 |
| 5.4.1 MOCSB算法的质量验证指标比较分析 | 第89-92页 |
| 5.4.2 MOCSB算法的生物验证指标比较分析 | 第92-94页 |
| 5.5 本章小结 | 第94-96页 |
| 第六章 基于谱聚类集成的双聚类分析 | 第96-111页 |
| 6.1 集成双聚类分析 | 第96-98页 |
| 6.1.1 集成聚类分析 | 第96-97页 |
| 6.1.2 集成双聚类分析 | 第97-98页 |
| 6.2 基于谱聚类集成的双聚类分析 | 第98-104页 |
| 6.2.1 基于不同评价指标的基双聚类构造方法 | 第98-99页 |
| 6.2.2 基于谱技术的一致函数 | 第99-104页 |
| 6.2.3 重构一致双聚类 | 第104页 |
| 6.3 实验结果分析 | 第104-110页 |
| 6.3.1 SEB算法的多样性比较分析 | 第104-106页 |
| 6.3.2 SEB算法的一致函数比较分析 | 第106-110页 |
| 6.4 本章小结 | 第110-111页 |
| 第七章 总结与展望 | 第111-114页 |
| 7.1 本文工作总结 | 第111-112页 |
| 7.2 后续工作展望 | 第112-114页 |
| 致谢 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-135页 |
| 攻读博士学位期间所取得的成果 | 第135-136页 |
