| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-36页 |
| 第一章 棉花耐盐性研究动态 | 第12-20页 |
| 1 盐胁迫对棉花生长的影响 | 第12-14页 |
| 1.1 盐胁迫对棉花萌发的影响 | 第12-13页 |
| 1.2 盐胁迫对棉花根系的影响 | 第13页 |
| 1.3 盐胁迫对棉花光合的影响 | 第13-14页 |
| 2 棉花的耐盐机制 | 第14-16页 |
| 2.1 离子渗透调节和分区隔离 | 第14-15页 |
| 2.2 抗氧化系统调节 | 第15页 |
| 2.3 小分子渗透物质调节 | 第15-16页 |
| 3 棉花耐盐性的分子机制 | 第16-17页 |
| 3.1 耐盐基因的克隆 | 第16-17页 |
| 3.2 棉花耐盐性的转基因研究 | 第17页 |
| 4 棉花耐盐性鉴定方法 | 第17-20页 |
| 4.1 棉花耐盐性直接鉴定方法 | 第17-18页 |
| 4.2 棉花耐盐性间接鉴定方法 | 第18-20页 |
| 第二章 我国棉花耐盐种质资源研究现状 | 第20-22页 |
| 第三章 转录组测序技术及其应用 | 第22-32页 |
| 1 转录组项目流程 | 第22-23页 |
| 2 转录组测序样品 | 第23-25页 |
| 2.1 RNA样品要求 | 第23-24页 |
| 2.2 Total RNA样品检测 | 第24-25页 |
| 3 Illumina测序平台 | 第25-26页 |
| 4 转录组分析方法 | 第26-28页 |
| 4.1 有参考基因组转录组分析内容 | 第26-27页 |
| 4.2 无参考基因组转录组分析内容 | 第27-28页 |
| 5 表达量统计 | 第28页 |
| 6 转录组注释数据库 | 第28-29页 |
| 7 棉花盐胁迫转录组研究进展 | 第29-32页 |
| 第四章 功能标记研究进展 | 第32-36页 |
| 1 分子标记类型 | 第32-33页 |
| 2 功能标记介绍 | 第33-35页 |
| 2.1 功能标记的开发 | 第33-35页 |
| 3 功能标记的检测 | 第35-36页 |
| 3.1 等位基因特异性PCR | 第35页 |
| 3.2 酶切扩增多态性序列 | 第35页 |
| 3.3 TP-M13自动荧光检测系统 | 第35-36页 |
| 本研究目的和意义 | 第36-38页 |
| 研究内容与技术路线 | 第38-40页 |
| 第二部分 研究报告 | 第40-78页 |
| 第五章 棉属野生种克劳茨基棉与陆地棉杂交后代耐盐性筛选 | 第40-50页 |
| 1 材料与方法 | 第40-43页 |
| 1.1 供试材料 | 第40-41页 |
| 1.2 实验设计 | 第41页 |
| 1.3 测定指标标准与计算方法 | 第41-42页 |
| 1.4 数据处理 | 第42-43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-47页 |
| 2.1 克劳茨基棉渐渗系的耐盐性鉴定 | 第43-44页 |
| 2.2 生长指标与耐盐性的关系 | 第44-46页 |
| 2.3 综合分析及评价 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-50页 |
| 3.1 棉花萌发期与苗期耐盐性的筛选 | 第47页 |
| 3.2 数据处理的评价 | 第47-50页 |
| 第六章 盐胁迫下两个陆地棉品种的转录组测序 | 第50-68页 |
| 1 材料与方法 | 第50-55页 |
| 1.1 供试材料 | 第50页 |
| 1.2 材料处理 | 第50页 |
| 1.3 试剂配制 | 第50-51页 |
| 1.4 提取样品总RNA步骤 | 第51-52页 |
| 1.5 去除总RNA中的DNA | 第52页 |
| 1.6 Total RNA样品检测 | 第52页 |
| 1.7 文库构建及库检 | 第52-53页 |
| 1.8 unigene的注释 | 第53-54页 |
| 1.9 生物信息学分析软件 | 第54-55页 |
| 1.10 差异表达基因的筛选 | 第55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-64页 |
| 2.1 初始产出数据 | 第55页 |
| 2.2 拼接转录本及unigene | 第55-56页 |
| 2.3 基因功能注释 | 第56-58页 |
| 2.4 数字基因表达谱(DGE)分析 | 第58-64页 |
| 3 讨论 | 第64-68页 |
| 3.1 转录组测序 | 第64-65页 |
| 3.2 转录组拼接及分析 | 第65-66页 |
| 3.3 陆地棉耐盐分子机制 | 第66-68页 |
| 第七章 陆地棉耐盐功能标记的开发 | 第68-78页 |
| 1. 材料与方法 | 第68-71页 |
| 1.1 实验材料 | 第68页 |
| 1.2 功能性EST-InDel分子标记的开发 | 第68页 |
| 1.3 功能性EST-SSR分子标记的开发 | 第68-69页 |
| 1.4 萌发期发芽势、发芽率 | 第69页 |
| 1.5 棉花叶片DNA的提取 | 第69-70页 |
| 1.6 SSR和Indel扩增及PAGE银染检测 | 第70页 |
| 1.7 标记常用试剂的配方 | 第70-71页 |
| 2 结果与分析 | 第71-75页 |
| 2.1 功能标记的开发 | 第71页 |
| 2.2 陆地棉中多态性标记的筛选 | 第71-73页 |
| 2.3 与耐盐性连锁的功能标记的筛选 | 第73-74页 |
| 2.4 相关性分析 | 第74-75页 |
| 3 讨论 | 第75-78页 |
| 全文结论 | 第78-80页 |
| 附录 | 第80-88页 |
| 参考文献 | 第88-100页 |
| 致谢 | 第100-102页 |
| 攻读硕士学位期间所发表论文 | 第102页 |