小菜蛾不同发育时期RNA编辑位点的识别与验证
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-14页 |
| ·小菜蛾 | 第8-9页 |
| ·RNA编辑的研究进展 | 第9-14页 |
| ·RNA编辑 | 第9-10页 |
| ·基于第二代测序技术的RNA编辑研究 | 第10-14页 |
| 第二章 小菜蛾RNA编辑位点的识别 | 第14-24页 |
| 摘要 | 第14-15页 |
| ·数据与计算方法 | 第15-16页 |
| ·数据库及软件 | 第15页 |
| ·基因数据 | 第15页 |
| ·序列比对及软件参数设置 | 第15-16页 |
| ·结果 | 第16-22页 |
| ·小菜蛾RNA-Seq比对结果 | 第16页 |
| ·构建潜在的RNA编辑位点集 | 第16-17页 |
| ·对潜在的RNA编辑位点集筛选过滤 | 第17-22页 |
| 1) 滤除落在3’、5’端位点 | 第18-19页 |
| 2) 滤除来自同库的重复序列 | 第19页 |
| 3) 滤除编辑效率低及覆盖度过低的位点 | 第19页 |
| 4) 滤除替换类型不确定的编辑位点 | 第19-20页 |
| 5) 滤除剪接位点周围的RNA编辑位点 | 第20页 |
| 6) 滤除简单重复和旁系同源的位点 | 第20页 |
| 7) 滤除随机错误 | 第20-22页 |
| ·讨论 | 第22-24页 |
| 第三章 小菜蛾RNA编辑位点的特异表达分析 | 第24-32页 |
| 摘要 | 第24页 |
| ·数据与分析方法 | 第24-26页 |
| ·RNA编辑特异表达候选集 | 第24-26页 |
| ·Fisher检验 | 第26页 |
| ·结果 | 第26-30页 |
| ·不同发育时期特异性的RNA编辑位点 | 第26-28页 |
| ·不同发育时期特异性RNA编辑位点的基因统计分析 | 第28-30页 |
| ·讨论 | 第30-32页 |
| 第四章 RNA编辑位点的实验验证 | 第32-40页 |
| 摘要 | 第32页 |
| ·材料与方法 | 第32-36页 |
| ·结果与分析 | 第36-38页 |
| ·讨论 | 第38-40页 |
| 全文总结 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 攻读硕士学位期间论文发表情况 | 第46-48页 |
| 致谢 | 第48页 |
