| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-29页 |
| 1 芭蕉属植物及我国蕉类种质资源概况 | 第10-11页 |
| ·芭蕉属植物分类概述 | 第10页 |
| ·我国蕉类种质资源概况 | 第10-11页 |
| 2 分子标记技术概述 | 第11-14页 |
| 3 SSR分子标记 | 第14-20页 |
| ·SSR的概念及分类 | 第14-15页 |
| ·SSR的功能 | 第15页 |
| ·SSR的变异与进化 | 第15页 |
| ·SSR分子标记的开发 | 第15-20页 |
| ·从基因组文库开发SSR引物 | 第16页 |
| ·从EST序列中开发SSR引物 | 第16-19页 |
| ·转移扩增法 | 第19-20页 |
| 4 种群遗传多样性分析 | 第20-24页 |
| ·遗传多样性的概念、来源及检测方法 | 第20页 |
| ·种群遗传多样性参数及估算方法 | 第20-24页 |
| ·种群遗传变异水平的度量 | 第20-22页 |
| ·种群遗传分化的度量 | 第22-24页 |
| ·居群间遗传关系的度量 | 第24页 |
| 5 DNA分子标记在蕉类研究中的应用 | 第24-28页 |
| 6 本研究的目的意义 | 第28页 |
| 7 本研究的技术路线 | 第28-29页 |
| 第二章 香蕉SSR分子标记的开发 | 第29-52页 |
| 1 材料与方法 | 第29-42页 |
| ·材料 | 第29-32页 |
| ·EST序列的获得 | 第29页 |
| ·植物材料 | 第29-31页 |
| ·常用酶和生化试剂 | 第31页 |
| ·主要仪器 | 第31-32页 |
| ·分析软件 | 第32页 |
| ·方法 | 第32-42页 |
| ·香蕉基因组DNA的提取及DNA样品浓度与纯度的测定 | 第32-33页 |
| ·利用EST序列开发香蕉SSR标记 | 第33-34页 |
| ·SAM法开发香蕉SSR标记 | 第34-38页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳分离SAM扩增产物 | 第38-39页 |
| ·从聚丙烯酰胺凝胶上回收SAM扩增产物 | 第39页 |
| ·二次SAM扩增及其产物的纯化 | 第39-40页 |
| ·SAM扩增产物的克隆 | 第40-41页 |
| ·克隆产物的测序、结果分析及引物设计 | 第41页 |
| ·统计分析 | 第41-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-49页 |
| ·香蕉EST-SSR分子标记的开发 | 第42-45页 |
| ·香蕉EST中SSR的分布和频率 | 第42-43页 |
| ·EST-SSR引物的应用 | 第43-45页 |
| ·香蕉基因组SSR分子标记的开发 | 第45-49页 |
| ·香蕉基因组DNA的提取 | 第45-46页 |
| ·DNA的酶切检测和抑制性PCR、预扩增产物的检测 | 第46页 |
| ·SAM扩增结果分析 | 第46-47页 |
| ·SAM扩增产物的回收、纯化与克隆 | 第47-49页 |
| 3 讨论 | 第49-52页 |
| ·香蕉EST-SSR的开发 | 第49-50页 |
| ·香蕉EST-SSR的分布频率、特点 | 第49页 |
| ·香蕉EST-SSR引物的应用 | 第49-50页 |
| ·香蕉基因组SSR分子标记的开发 | 第50-52页 |
| ·SAM分离SSR序列的效率 | 第50页 |
| ·SSR位点分析及引物设计 | 第50-52页 |
| 第三章 香蕉种质资源的SSR遗传分析 | 第52-81页 |
| 1 材料与方法 | 第53-60页 |
| ·材料 | 第53页 |
| ·植物材料 | 第53页 |
| ·主要试剂、仪器 | 第53页 |
| ·方法 | 第53-60页 |
| ·香蕉栽培品种形态性状调查 | 第53页 |
| ·海南岛阿宽蕉居群调查 | 第53-59页 |
| ·PCR扩增和电泳检测 | 第59页 |
| ·数据统计分析 | 第59-60页 |
| ·芭蕉科种属间SSR引物的通用性分析 | 第60页 |
| ·部分香蕉品种SSR指纹图谱的构建方法 | 第60页 |
| 2 结果与分析 | 第60-76页 |
| ·香蕉部分品种的形态性状调查分析 | 第60-61页 |
| ·SSR分子标记检测香蕉品种遗传多样性 | 第61-67页 |
| ·香蕉Genomic-SSR和EST-SSR多态性 | 第61-63页 |
| ·香蕉Genomic-SSR和EST-SSR聚类分析 | 第63-67页 |
| ·香蕉SSR引物在芭蕉科种属间的通用性分析 | 第67-71页 |
| ·香蕉Genomic-SSR和EST-SSR标记种属间可转移性分析 | 第67-68页 |
| ·位点变异检测 | 第68-71页 |
| ·香蕉部分品种的SSR分子指纹图谱构建 | 第71-73页 |
| ·SSR标准引物的筛选 | 第71页 |
| ·标准带谱的建立 | 第71-72页 |
| ·标准图谱的构建 | 第72页 |
| ·香蕉材料的SSR分析 | 第72-73页 |
| ·海南岛阿宽蕉(M. itinerans)居群研究 | 第73-76页 |
| ·样本量对遗传多样性测度指标的影响 | 第73-75页 |
| ·阿宽蕉总居群遗传多样性分析 | 第75-76页 |
| ·阿宽蕉居群的遗传分化 | 第76页 |
| ·居群间遗传关系 | 第76页 |
| 3 讨论 | 第76-81页 |
| ·香蕉种质资源遗传多样性分析 | 第76-78页 |
| ·香蕉SSR引物在芭蕉科种属间的通用性分析 | 第78-79页 |
| ·香蕉部分品种SSR分子指纹图谱构建 | 第79-80页 |
| ·海南岛阿宽蕉居群研究 | 第80-81页 |
| 第四章 总结 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 附Ⅰ:SAM方法开发香蕉基因组SSR引物表 | 第93-95页 |
| 附Ⅱ:56份香蕉品种(系)的分子指纹图谱 | 第95-102页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第102-103页 |
