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两个拟南芥microRNAs在转录水平上对基因表达的调控分析

符号说明第1-10页
中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 前言第14-35页
   ·MiRNA的概念及特点第14-16页
     ·MiRNA的概念第14页
     ·MiRNA的发现第14页
     ·MiRNA的特点和与siRNA的比较第14-16页
       ·MiRNA的特点第15页
       ·MiRNA与siRNA的比较第15-16页
   ·MiRNA在基因组上的分布第16-17页
   ·MiRNA的起源与进化第17-22页
     ·MiRNA的物种分布与保守性第17页
     ·MiRNA的起源与进化第17-19页
     ·MiRNA家族第19-22页
   ·MiRNA的生物合成与加工第22-26页
     ·MiRNA的生物合成与加工第22-23页
     ·动植物miRNA生物合成与加工成熟过程的比较第23页
     ·MiRNA 加工与成熟过程中需要的酶及功能蛋白质第23-26页
       ·Drosha酶第23-25页
       ·Dicer酶第25页
       ·其他辅助蛋白质第25-26页
       ·Agonaute蛋白家族第26页
   ·MiRNA的作用方式第26-28页
     ·MiRNA参与转录后水平的基因调控第26-27页
     ·MiRNA参与转录水平的基因调控第27-28页
     ·MiRNA的其他作用方式第28页
   ·MiRNA的生物学功能第28-31页
     ·MiRNA在植物生长发育中的作用第28-30页
     ·MiRNA在植物响应胁迫过程中的作用第30-31页
   ·MiRNA的研究方法第31-34页
     ·MiRNA的分离与克隆第31-32页
     ·常用的分析miRNA的数据库和软件第32页
     ·MiRNA靶基因的预测第32-33页
     ·MiRNA表达量的检测方法第33-34页
   ·本项研究的目的意义第34-35页
2 材料与方法第35-52页
   ·实验材料第35-36页
     ·植物材料第35页
     ·菌株与质粒第35页
     ·酶与各种生化试剂第35页
     ·引物第35-36页
   ·实验方法第36-52页
     ·植物基因组的提取与纯化第36-37页
       ·植物基因组的提取第36-37页
       ·植物基因组的纯化第37页
     ·载体构建第37-38页
       ·PCR扩增第37页
       ·连接反应第37-38页
       ·酶切和回收第38页
       ·超表达miR171b,mi396b和miR400 表达载体的构建第38页
       ·瞬时表达载体的构建第38页
     ·PCR鉴定突变体纯合植株第38-39页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第39-40页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第39页
       ·大肠杆菌细胞的转化第39-40页
     ·大肠杆菌中质粒的提取第40-41页
       ·大量法提质粒第40页
       ·小量碱法提质粒第40-41页
     ·农杆菌感受态细胞的制备和转化第41页
       ·根癌农杆菌GV3101 感受态细胞的制备第41页
       ·冻融法转化农杆菌细胞第41页
     ·拟南芥的转化及转基因拟南芥的鉴定第41-42页
       ·拟南芥的转化第41-42页
       ·转基因拟南芥的鉴定第42页
     ·RNA的提取纯化与反转录第42-43页
       ·TRIZOL法提取RNA第42页
       ·RNA的纯化第42页
       ·RNA中基因组DNA的去除第42-43页
       ·RNA的反转录第43页
     ·实时定量PCR第43-44页
     ·GUS活性测定第44-45页
     ·报告基因LUC的表达量测定第45页
     ·植物miRNA的提取第45-47页
     ·用qRT-PCR检测成熟体miRNA的表达量第47-48页
       ·MiRNA 3′端进行加Poly(A)处理及反转录第47-48页
       ·MiRNA的荧光定量检测第48页
     ·瞬时转化拟南芥原生质体的方法第48-50页
     ·RNAhybrid的使用方法第50-52页
3 结果与分析第52-61页
   ·生物信息学方法预测可能靶向基因启动子区域的miRNA第52页
   ·瞬时转化拟南芥原生质体验证miRNA对靶基因的调控作用第52-54页
     ·瞬时表达载体的构建第52-53页
     ·超表达miRNA后对靶基因表达量的检测第53-54页
   ·转基因植株中靶基因表达水平的检测第54-57页
     ·植物表达载体构建第54-55页
     ·转基因植株表达量的检测第55页
     ·靶基因表达水平的检测第55-57页
   ·MiRNA对靶基因的调控方式分析第57-59页
     ·靶基因启动子区域表观遗传学修饰的预测第57-58页
     ·几种RdDM途径关键基因突变体中靶基因表达量的检测第58-59页
   ·MiRNA171b和miRNA396b响应多种非生物胁迫第59-61页
4 讨论第61-63页
5 结论第63-64页
参考文献第64-72页
致谢第72-73页
攻读学位期间发表论文情况第73页

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