| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| ·植原体致病机制 | 第12-14页 |
| ·植物 microRNAs 研究进展 | 第14-17页 |
| ·植物代谢组学研究进展 | 第17-21页 |
| ·本研究的目的意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-31页 |
| ·材料 | 第22-23页 |
| ·植物材料 | 第22页 |
| ·菌株与质粒 | 第22页 |
| ·生化试剂 | 第22页 |
| ·引物 | 第22-23页 |
| ·主要仪器 | 第23页 |
| ·方法 | 第23-31页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第23页 |
| ·小分子 RNA 文库的构建 | 第23页 |
| ·Solexa 测序分析 | 第23-24页 |
| ·高通量测序的生物信息学分析 | 第24-25页 |
| ·序列分析 | 第24页 |
| ·新 miRNAs 的鉴定 | 第24页 |
| ·miRNA 靶基因的预测 | 第24-25页 |
| ·miRNAs 表达的差异性验证 | 第25页 |
| ·miRNA 前体基因的扩增 | 第25-28页 |
| ·PCR 扩增 | 第25-26页 |
| ·目的片段回收 | 第26页 |
| ·大肠杆菌感受态的制备 | 第26页 |
| ·目的片段与克隆载体的连接和转化 | 第26-27页 |
| ·序列测定 | 第27页 |
| ·质粒提取 | 第27-28页 |
| ·酶切和回收 | 第28页 |
| ·差异表达 miRNAs 的植物表达载体的构建 | 第28-29页 |
| ·桑树 miR393 前体基因的克隆及其植物表达载体的构建 | 第28-29页 |
| ·桑树 miR482 前体基因的克隆及其植物表达载体的构建 | 第29页 |
| ·植原体侵染对桑树叶片和汁液代谢组影响的气质联用分析 | 第29-31页 |
| ·桑树叶片代谢物的提取 | 第29页 |
| ·桑树汁液代谢物的提取 | 第29-30页 |
| ·代谢物的衍生化 | 第30页 |
| ·GC-MS 分析 | 第30页 |
| ·数据预处理与主成分分析 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-60页 |
| ·植原体侵染对桑树叶片 miRNAs 表达谱的影响 | 第31-49页 |
| ·桑树叶片小分子 RNA 测序文库构建和高通量测序 | 第31-32页 |
| ·测序所得序列的分类注释 | 第32-33页 |
| ·桑树叶片保守 miRNAs 的鉴定与表达分析 | 第33-38页 |
| ·新 miRNAs 的预测及其表达分析 | 第38-42页 |
| ·miRNAs 差异性验证 | 第42-43页 |
| ·差异表达的 miRNAs 的靶基因预测 | 第43-49页 |
| ·保守 miRNAs 的靶基因预测 | 第43-47页 |
| ·新 miRNAs 靶基因预测 | 第47-49页 |
| ·桑树响应植原体侵染的 miRNAs 前体基因的克隆与表达载体的构建 | 第49-51页 |
| ·桑树 miR393 基因的克隆与植物表达载体构建 | 第49-50页 |
| ·桑树 miR393a 和 miR393b 基因的克隆 | 第49页 |
| ·桑树 miR393 基因植物表达载体的构建 | 第49-50页 |
| ·桑树 miR482 基因的克隆与植物表达载体构建 | 第50-51页 |
| ·桑树 miR482 基因的克隆 | 第50-51页 |
| ·桑树 miR482 基因植物表达载体的构建 | 第51页 |
| ·植原体侵染对桑树代谢组的影响 | 第51-60页 |
| ·植原体侵染对桑树叶片代谢组的响应 | 第51-53页 |
| ·植原体侵染对桑树韧皮部汁液代谢组的影响 | 第53-59页 |
| ·健康和感病桑树叶片及韧皮部汁液代谢物的主成分分析 | 第59-60页 |
| 4 讨论 | 第60-67页 |
| ·miRNAs 调控的桑树响应植原体侵染的分子机制 | 第60-63页 |
| ·桑树韧皮部汁液代谢物的复杂性 | 第63-64页 |
| ·桑树对植原体侵染的代谢响应机制 | 第64-67页 |
| 5 结论 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第77页 |
