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甘蓝型油菜开花QTL-qFT10-4-的图位克隆及候选基因BnFLC.A10的表达调控研究

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
缩略词表第12-13页
第一章 前言第13-32页
   ·植物春化及重要基因FLC第13-16页
     ·植物开花调控网络第13-14页
     ·春化现象及春化途径的关键基因第14-16页
       ·春化现象的发现第14页
       ·甘蓝型油菜的春化特性第14-15页
       ·植物春化相关位点及基因研究第15-16页
       ·FLC同源基因在芸薹属植物中对开花的作用第16页
   ·QTL的克隆及甘蓝型油菜开花QTL研究第16-18页
     ·QTL克隆的方法第16-18页
       ·图位克隆法克隆QTL第17页
       ·关联分析法克隆QTL第17页
       ·候选基因法进行QTL的克隆第17-18页
     ·甘蓝型油菜中开花QTL研究第18页
   ·拟南芥中FLC表达调控的分子机理第18-24页
     ·促进FLC表达的因子及分子机理第18-20页
     ·自主开花途径对FLC的抑制子及分子机理第20-21页
     ·春化过程中染色质修饰及相关基因对FLC表达的调控第21-24页
     ·非编码RNA对FLC的表达调控第24页
   ·MITE转座子第24-29页
     ·转座子及MITEs简介第24-27页
     ·MITE的来源第27-28页
     ·MITE对基因组进化和基因调控的意义第28-29页
   ·研究基础、目的和意义第29-32页
     ·研究基础第29页
     ·研究的目的和意义第29-30页
     ·研究内容第30-31页
     ·技术路线第31-32页
第二章 材料与方法第32-39页
   ·qFT10-4的克隆和功能验证第32-36页
     ·实验材料第32页
     ·标记的开发和定位第32页
     ·分离群体的构建及花期调查第32-33页
     ·基因型分析及重组单株的确定第33-34页
     ·目标区段染色体序列的注释和候选基因的确定第34页
     ·等位基因的序列分离和序列比对分析第34-35页
     ·等位基因的表达分析第35页
     ·BnFLC.A10各个多态性位点同甘蓝型油菜冬春性的相关分析第35-36页
     ·BnFLC.A10的单倍型分析第36页
   ·MITE转座子分析第36-39页
     ·实验材料第36-37页
     ·白菜和甘蓝中MITE同源序列的提取和分析第37页
     ·MITE的功能分析第37-39页
       ·DNA甲基化检测第37-38页
       ·MITE核蛋白结合特性检测第38-39页
第三章 结果与分析第39-58页
   ·QTL的克隆及基因功能验证第39-46页
     ·近等基因系的筛选和构建第39页
     ·目标区段的比对和标记开发第39页
     ·分离群体的表型调查第39-40页
     ·分离群体中未开花单株的基因型筛选和重组单株的确定第40页
     ·QTL的精细定位及候选基因的确定第40-42页
     ·等位基因序列的分离及多态性位点的分析第42-43页
     ·等位基因的表达第43-44页
     ·等位基因各多态性位点和甘蓝型油菜冬春性的相关性第44-45页
     ·单倍型分析及多态性位点重要性的确定第45-46页
   ·MITE的分析第46-58页
     ·MITE的结构确定及motif预测第47-50页
     ·BnTrst-1的核蛋白结合能力第50-51页
     ·BnTrst-1在白菜和甘蓝基因组中的分布第51-52页
     ·白菜和甘蓝基因组中各拷贝BnTrst-1的分布同基因的相对位置第52页
     ·白菜和甘蓝基因组中BnTrst-1的TIR及TSD序列特征及变异第52-53页
     ·白菜和甘蓝基因组中BnTrst-1的进化第53-54页
     ·BnTrst-I在进化中的活动及其造成的物种间及品种间多态性第54-56页
     ·BnFLC.A10-T上游的BnTrst-1在进化中的来源及甘蓝型油菜强春化特性的获得第56-57页
     ·BnTrst-1的DNA甲基化分析第57-58页
第四章 讨论第58-69页
   ·研究结论第58-67页
     ·甘蓝型油菜春化途径调控开花期的复杂性及BnFLC.A10的重要性第58-60页
     ·MITE在基因表达调控中的作用第60-62页
     ·BnFLC.A10可能的调控机制及复杂性第62-66页
     ·MITE在基因组进化及增强适应性的作用第66-67页
   ·本研究的主要创新点第67页
   ·本研究的不足之处第67-68页
   ·下一步工作展望第68-69页
     ·分析MITE介导的BnFLC.A10的调控第68页
     ·在芸薹属中进行BnTrst-1的功能普遍性研究第68-69页
参考文献第69-81页
附录第81-107页
致谢第107-108页
个人简历第108-109页
研究论文第109页
提交会议摘要第109页

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