基于极大团的近天然蛋白质结构选取方法
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
第一章 绪论 | 第7-10页 |
1.1 生物信息学 | 第7页 |
1.2 生物信息学的挑战 | 第7-8页 |
1.3 论文的组织结构 | 第8-10页 |
第二章 蛋白质相关背景知识 | 第10-14页 |
2.1 研究蛋白质的意义 | 第10页 |
2.2 蛋白质结构 | 第10-13页 |
2.2.1 蛋白质一级结构 | 第11页 |
2.2.2 蛋白质二级结构 | 第11-12页 |
2.2.3 蛋白质三级结构 | 第12页 |
2.2.4 蛋白质四级结构 | 第12-13页 |
2.3 蛋白质结构测定 | 第13-14页 |
第三章 蛋白质结构预测 | 第14-22页 |
3.1 蛋白质结构预测的重要性 | 第14-15页 |
3.2 蛋白质结构预测的主要方法 | 第15-21页 |
3.2.1 同源性(Homology)方法 | 第15-17页 |
3.2.2 串线(Threading)方法 | 第17页 |
3.2.3 从头计算(Ab initio)方法 | 第17-21页 |
3.3 本章总述 | 第21-22页 |
第四章 近天然蛋白质结构选取方法 | 第22-33页 |
4.1 蛋白质结构聚类的方法 | 第22-25页 |
4.1.1 蛋白质结构聚类方法SPICKER | 第23-25页 |
4.2 蛋白质结构比对相似性度量 | 第25-28页 |
4.2.1 根均方差RMSD | 第25-26页 |
4.2.2 全局距离计算法(GDT) | 第26-27页 |
4.2.3 TM-score算法 | 第27-28页 |
4.3 基于极大团的近天然蛋白质结构选取方法 | 第28-33页 |
4.3.1 方法步骤 | 第29-32页 |
4.3.2 参数选择 | 第32-33页 |
第五章 实验结果与分析 | 第33-37页 |
5.1 实验结果与分析 | 第33-36页 |
5.2 结论 | 第36-37页 |
在学期间的研究成果 | 第37-38页 |
参考文献 | 第38-41页 |
致谢 | 第41页 |