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单细胞技术在正链RNA病毒研究中的应用

中文摘要第1-8页
英文摘要第8-15页
第一章 前言第15-48页
   ·单细胞PCR技术研究进展第15-26页
     ·概述第15-18页
     ·单细胞识别与分离技术第18-22页
     ·模板的制备及实时荧光定量PCR反应第22-26页
       ·模板的制备第22-24页
       ·荧光定量PCR反应第24-26页
   ·正链RNA病毒简介第26-41页
     ·牛病毒性腹泻-粘膜病病毒简介第27-28页
     ·脊髓灰质炎病毒和口蹄疫病毒简介第28-40页
       ·FMDV基因组RNA的结构和功能第30-40页
         ·5'末端的特征第30-34页
         ·RNA翻译起始位点的选择第34页
         ·蛋白与FMDV IRES相互作用第34-35页
         ·病毒编码的多聚蛋白第35-39页
         ·3'-UTR的结构和功能第39-40页
     ·RNA依赖的RNA合成的起始第40-41页
   ·病毒持续性感染的研究进展第41-46页
     ·病毒持感的普遍性第41-42页
     ·病毒持续感染的机制第42-43页
     ·病毒决定簇在持感过程中扮演重要角色第43-44页
     ·口蹄疫病毒持续感染的研究进展第44-46页
   ·本研究的目的和意义第46-48页
第二章 单细胞荧光定量RT-PCR技术的建立第48-69页
   ·引言第48-49页
   ·材料和方法第49-58页
     ·材料第49-51页
     ·方法第51-58页
       ·细胞培养及病毒感染、滴度测定第51-52页
       ·FMDV RNA的提取第52页
       ·单细胞分离和预处理第52-53页
       ·单细胞内病毒感染性实验(共培养)第53页
       ·单细胞RT-PCR第53-54页
       ·单细胞实时荧光定量RT-PCR第54-58页
   ·结果与分析第58-65页
     ·蚀斑法测定FMDV滴度第59页
     ·荧光定量RT-PCR反应的特异性和灵敏度第59-61页
     ·荧光定量RT-PCR的重复性第61页
     ·分离和裂解单细胞第61-63页
       ·常规单细胞RT-PCR测定GAPDH第61-62页
       ·单细胞裂解过程第62-63页
     ·单细胞共培养实验第63-64页
     ·单细胞实时荧光定量RT-PCR第64-65页
   ·讨论第65-69页
第三章 单细胞技术在口蹄疫病毒持感研究中的应用第69-92页
   ·引言第69页
   ·材料和方法第69-75页
     ·材料第69-70页
     ·方法第70-75页
       ·细胞培养、冻存及复苏、病毒感染及氯化铵处理第71页
       ·RNA提取第71-72页
       ·病毒感染单细胞的分离第72页
       ·一步法单细胞实时荧光定量RT-PCR第72页
       ·FMDV颗粒的电镜观察第72页
       ·免疫印迹实验第72-73页
       ·双通道实时荧光定量RT-PCR同时检测FMDV正链与负链RNA第73-74页
       ·MTT实验第74页
       ·蚀斑实验和TCID_(50)实验第74-75页
       ·基因表达谱芯片实验第75页
   ·结果与分析第75-88页
     ·不同浓度的NH_4Cl对FMDV感染BHK-21细胞的影响第75-76页
     ·在含NH_4Cl的培养液维持下存活的细胞数和细胞内病毒的阳性率第76-78页
     ·持续性感染FMDV的BHK-21单细胞克隆的筛选第78-79页
     ·病毒粒子的电镜观察第79页
     ·BHK-Op细胞形态学观察第79-80页
     ·病毒特异性蛋白的检测第80页
     ·持感细胞内病毒正链RNA与负链RNA的检测第80页
     ·持感细胞上清中病毒正链RNA与负链RNA的检测第80-81页
     ·细胞适应性实验第81-83页
     ·NH_4Cl对持续性感染病毒增殖的影响第83-84页
     ·持感病毒的感染性及毒力第84-85页
     ·持感病毒的吸附实验第85-86页
     ·持感病毒基因组蛋白突变第86-87页
     ·病毒持感细胞因子差异性分析第87-88页
   ·讨论第88-92页
第四章 单细胞实时荧光定量RT-PCR在正链RNA病毒研究中的应用第92-118页
   ·引言第92页
   ·材料和方法第92-102页
     ·材料第92-94页
     ·方法第94-102页
       ·细胞培养及病毒感染、滴度测定第94-95页
       ·单细胞荧光定量RT-PCR引物和探针的设计第95页
       ·荧光定量RT-PCR标准品的制备第95-96页
       ·单细胞分离和预处理第96-97页
       ·实时荧光定量RT-PCR检测单细胞中病毒正链RNA与负链RNA第97-98页
       ·实时荧光定量RT-PCR检测单细胞中FMDV和PV基因组RNA第98-100页
       ·正链RNA病毒复制的数学模型第100-102页
   ·结果第102-115页
     ·荧光定量RT-PCR反应的特异性和灵敏度第102-104页
     ·单细胞荧光定量RT-PCR检测病毒正链RNA与负链RNA量及正链RNA病毒复制数学模型初步分析第104-111页
     ·正链RNA病毒感染后在单细胞内的分布第111-112页
     ·病毒感染后不同时间单细胞内病毒RNA的检测第112-115页
   ·讨论第115-118页
参考文献第118-139页
博士研究生期间已发表和待发表的论文及申请的专利第139-140页
致谢第140页

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