| 致谢 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 缩略语表 | 第14-15页 |
| 目录 | 第15-20页 |
| 1 绪论 | 第20-42页 |
| ·需冷量 | 第21-25页 |
| ·芽休眠状态 | 第21-22页 |
| ·需冷量计算模型 | 第22-25页 |
| ·7.2℃模型 | 第23页 |
| ·犹他模型 | 第23-24页 |
| ·动力学模型 | 第24-25页 |
| ·芽休眠的生理及分子机制 | 第25-36页 |
| ·水分代谢 | 第25-26页 |
| ·激素代谢 | 第26-28页 |
| ·抗氧化代谢 | 第28-29页 |
| ·能量与物质代谢 | 第29-30页 |
| ·环境响应相关基因 | 第30-31页 |
| ·细胞发育相关基因 | 第31-32页 |
| ·DAM基因 | 第32-34页 |
| ·表观遗传机制 | 第34-36页 |
| ·落叶果树芽休眠分子机理的研究方法 | 第36-39页 |
| ·SSH技术 | 第36-37页 |
| ·基因芯片技术(DNA microarray) | 第37页 |
| ·高通量测序技术 | 第37-38页 |
| ·染色质免疫共沉淀技术 | 第38-39页 |
| ·梨芽休眠研究进展 | 第39-40页 |
| ·立题依据与研究内容 | 第40-42页 |
| 2 梨芽休眠的状态和需冷量 | 第42-59页 |
| ·材料与方法 | 第43-46页 |
| ·试验材料及处理 | 第43-44页 |
| ·试验材料 | 第43页 |
| ·试验处理 | 第43-44页 |
| ·试验方法 | 第44-46页 |
| ·萌芽率统计 | 第44页 |
| ·解除内休眠时期的确定 | 第44-45页 |
| ·低温积累量和需冷量的计算 | 第45页 |
| ·休眠状态的确定 | 第45-46页 |
| ·温湿度的记录 | 第46页 |
| ·统计分析 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-55页 |
| ·不同地区的日最高和最低温度 | 第46-47页 |
| ·梨萌芽率和休眠状态 | 第47-49页 |
| ·2010/11年度‘翠冠’梨萌芽率及休眠状态 | 第47-48页 |
| ·2011/12年度梨不同品种花芽和叶芽的萌芽率及休眠状态 | 第48-49页 |
| ·低温积累量 | 第49-54页 |
| ·梨花芽和叶芽的需冷量 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-59页 |
| ·温度和低温积累量的变化 | 第55页 |
| ·不同品种在同一地区的休眠状态 | 第55-56页 |
| ·相同品种在不同地区的休眠状态 | 第56-57页 |
| ·梨品种的需冷量 | 第57-59页 |
| 3 梨休眠期间花芽转录组和表达谱文库的构建与质量分析 | 第59-67页 |
| ·材料与方法 | 第59-61页 |
| ·试验材料 | 第60页 |
| ·试验方法 | 第60-61页 |
| ·萌芽率统计 | 第60页 |
| ·RNA的提取 | 第60页 |
| ·转录组文库的构建和测序 | 第60页 |
| ·表达谱文库的构建和测序 | 第60-61页 |
| ·转录组文库测序reads的过滤 | 第61页 |
| ·RNA-Seq文库测序reads的过滤 | 第61页 |
| ·结果与分析 | 第61-65页 |
| ·不同时期‘酥梨’花芽的休眠状态 | 第61-62页 |
| ·‘酥梨’花芽RNA质量 | 第62页 |
| ·转录组文库测序结果 | 第62-63页 |
| ·表达谱文库测序结果 | 第63-65页 |
| ·测序质量和产量 | 第63-64页 |
| ·测序饱和度分析 | 第64页 |
| ·测序随机性分析 | 第64-65页 |
| ·讨论 | 第65-67页 |
| 4 梨花芽休眠期间转录组分析 | 第67-85页 |
| ·材料与方法 | 第67-71页 |
| ·试验材料 | 第67页 |
| ·试验方法 | 第67-71页 |
| ·基因区间的确定 | 第67-68页 |
| ·Trinity组装 | 第68-69页 |
| ·BLAT比对 | 第69页 |
| ·序列拼接 | 第69-70页 |
| ·聚类 | 第70页 |
| ·Unigene序列功能注释 | 第70页 |
| ·Unigene序列GO分类 | 第70页 |
| ·Unigene序列代谢通路分析 | 第70-71页 |
| ·预测编码蛋白框(CDS) | 第71页 |
| ·结果与分析 | 第71-83页 |
| ·转录组组装结果 | 第71-73页 |
| ·转录组组装的概要 | 第71-72页 |
| ·Contig和Unigene序列长度分布 | 第72页 |
| ·Unigene序列同源性分析 | 第72-73页 |
| ·Unigene序列GO分类 | 第73-74页 |
| ·Unigene序列COG分析 | 第74-75页 |
| ·Unigene序列代谢通路分析 | 第75-81页 |
| ·编码蛋白框(CDS)的核苷酸和氨基酸序列分布 | 第81-83页 |
| ·讨论 | 第83-85页 |
| 5 梨花芽休眠期间基因表达谱分析 | 第85-100页 |
| ·材料与方法 | 第85-88页 |
| ·试验材料 | 第85页 |
| ·分析方法 | 第85-88页 |
| ·基因覆盖度统计 | 第85-86页 |
| ·基因表达量计算 | 第86页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第86页 |
| ·差异表达基因的功能分析 | 第86-87页 |
| ·差异表达基因的聚类分析 | 第87页 |
| ·差异表达基因的实时荧光定量PCR技术验证 | 第87-88页 |
| ·结果与分析 | 第88-97页 |
| ·基因覆盖度分布 | 第88-89页 |
| ·休眠期间差异表达基因模式变化 | 第89-90页 |
| ·休眠期间差异表达基因的功能分级 | 第90-94页 |
| ·休眠期间差异基因的聚类分析 | 第94-96页 |
| ·休眠期间差异基因的RNA-Seq表达量和Q-PCR验证分析 | 第96-97页 |
| ·讨论 | 第97-100页 |
| 6 梨两个休眠相关MADS-box基因特征及在其休眠过程中的表达分析 | 第100-109页 |
| ·材料与方法 | 第101-102页 |
| ·试验材料 | 第101页 |
| ·萌芽率统计 | 第101页 |
| ·RNA的提取及cDAN第一链的合成 | 第101页 |
| ·目的基因的序列分析 | 第101-102页 |
| ·Q-PCR分析 | 第102页 |
| ·数据处理 | 第102页 |
| ·结果与分析 | 第102-107页 |
| ·PpMADSl和PpMADS2的序列分析 | 第102-104页 |
| ·‘翠冠’和‘圆黄’梨花芽休眠进程的差异 | 第104-105页 |
| ·PpMADS1和PpMADS2在‘翠冠’梨花芽中的表达 | 第105-106页 |
| ·PpMADS1和PpMADS2在‘圆黄’梨花芽中的表达 | 第106页 |
| ·PpMADS1和PpMADS2在‘酥梨’花芽中的表达 | 第106-107页 |
| ·讨论 | 第107-109页 |
| 7 小结与展望 | 第109-112页 |
| 参考文献 | 第112-126页 |
| 作者简历 | 第126页 |
