| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-28页 |
| ·硫肽类抗生素概述 | 第9-18页 |
| ·硫肽类抗生素简介 | 第9-13页 |
| ·硫肽类抗生素生物合成基因簇的研究进展 | 第13-18页 |
| ·细菌非编码 RNA | 第18-21页 |
| ·细菌非编码 RNA 简介 | 第18-19页 |
| ·细菌非编码 RNA 的生物信息学研究现状 | 第19-21页 |
| ·微生物基因组学和转录组学 | 第21-26页 |
| ·微生物基因组学 | 第21-22页 |
| ·微生物转录组学 | 第22-25页 |
| ·生物信息学工具和数据库开发 | 第25-26页 |
| ·本论文的主要工作 | 第26-28页 |
| 第二章 硫肽生物合成基因簇的挖掘 | 第28-49页 |
| ·引言 | 第28-29页 |
| ·材料与方法 | 第29-37页 |
| ·计算机辅助识别硫肽生物合成基因簇 | 第29页 |
| ·快速识别硫肽生物合成基因簇在线工具 ThioFinder 的开发 | 第29-34页 |
| ·硫肽类抗生素数据库 ThioBase 开发 | 第34-37页 |
| ·结果与讨论 | 第37-47页 |
| ·硫肽类抗生素生物合成基因簇的典型特征 | 第37-38页 |
| ·硫肽类抗生素生物合成基因簇的识别 | 第38-42页 |
| ·ThioBase 数据库 | 第42-44页 |
| ·基于硫肽基因型和化学型的组合分类法 | 第44-47页 |
| ·小结与展望 | 第47-49页 |
| 第三章 细菌非编码 RNA的特征分析 | 第49-63页 |
| ·引言 | 第49-50页 |
| ·材料与方法 | 第50-53页 |
| ·数据集 | 第50-53页 |
| ·种属特异性 ncRNA 基因转录起始和终止区域的特征分析 | 第53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-61页 |
| ·细菌 ncRNA 数据资源的整合 | 第53-54页 |
| ·不同种属细菌 ncRNA 基因的转录起始和终止区域的特征 | 第54-58页 |
| ·利用不同基因组 G+C 含量的细菌评估现有 ncRNA 预测工具 | 第58-61页 |
| ·小结与展望 | 第61-63页 |
| 第四章 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-75页 |
| 附录 | 第75-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
| 学术论文和科研成果目录 | 第79-81页 |
