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鸭坦布苏病毒的分子生物学快速诊断与E蛋白基因变异性分析

符号说明第1-10页
中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 引言第14-30页
   ·发病历史及现状第14页
   ·病原学特性第14-16页
   ·分子生物学特性第16-18页
     ·病毒基因组结构与功能第16页
     ·重要的病毒蛋白第16-17页
     ·E蛋白的结构与功能第17-18页
   ·流行病学特性第18-19页
   ·临床症状,解剖病变及病理组织学变化第19-20页
     ·临床症状第19页
     ·解剖病变第19页
     ·病理组织学变化第19-20页
   ·诊断方法第20-30页
     ·PCR检测方法第20-22页
       ·PCR技术的基本原理第20-21页
       ·逆转录PCR第21页
       ·套式PCR第21-22页
       ·一步法RT-PCR与两步法RT-PCR的比较第22页
     ·实时荧光定量PCR第22-27页
       ·实时荧光定量PCR原理第22页
       ·实时荧光定量PCR的几个重要参数第22-23页
       ·实时荧光定量PCR的定量方法第23-24页
       ·实时荧光定量PCR的分类第24-27页
     ·其他检测方法第27-28页
       ·LAMP第27页
       ·ELISA检测方法第27-28页
     ·各检测方法在鸭坦布苏病毒检测中的应用第28-30页
2 材料与方法第30-45页
   ·鸭坦布苏病毒一步法RT-PCR检测方法的建立第30-36页
     ·病毒、菌株及载体第30页
     ·主要仪器与试剂第30页
       ·主要仪器第30页
       ·主要试剂第30页
     ·引物的设计与合成第30-31页
     ·一步法RT-PCR引物的筛选第31-32页
     ·病毒核酸的制备第32-35页
       ·病毒DNA/RNA的提取第32-33页
       ·DTMUV RT-PCR扩增反应及电泳成像第33页
       ·PCR产物胶回收纯化第33-34页
       ·CaCl_2法制备TOP10大肠杆菌感受态细胞第34页
       ·胶回收产物的连接和转化第34-35页
       ·菌落PCR筛选阳性克隆及测序验证第35页
     ·一步法RT-PCR扩增条件的优化第35页
     ·特异性试验第35页
     ·敏感性试验第35-36页
     ·重复性试验第36页
     ·临床病料验证第36页
   ·鸭坦布苏病毒一步法实时荧光定量PCR检测方法的建立第36-40页
     ·病毒、菌株和载体第36页
     ·主要试剂与仪器第36-37页
       ·主要仪器第36页
       ·主要试剂第36-37页
     ·实时荧光定量RT-PCR引物和探针的设计第37页
     ·实时荧光定量RT-PCR标准模板的制备第37-39页
       ·病毒基因组DNA/RNA的提取第37-38页
       ·One-Step RT-PCR扩增用于体外转录的目的基因片段第38页
       ·体外转录RNA模板标准品的制备第38-39页
     ·一步法实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立第39-40页
       ·敏感性试验和标准曲线的建立第40页
       ·特异性试验第40页
       ·重复性和稳定性试验第40页
     ·实时荧光定量PCR与一步法RT-PCR检测方法的比较第40页
   ·鸭坦布苏病毒E基因克隆及变异性分析第40-45页
     ·病毒、菌株和载体第40-41页
     ·主要仪器与试剂第41页
       ·主要仪器第41页
       ·主要试剂第41页
     ·引物的设计与合成第41页
     ·鸭坦布苏病毒E基因区序列的测定第41-45页
       ·病毒基因组RNA的提取第41-42页
       ·RT-PCR扩增反应及电泳成像第42-43页
       ·PCR产物胶回收纯化第43-44页
       ·胶回收产物连接与转化第44页
       ·菌落PCR筛选阳性克隆及测序验证第44-45页
3 结果与分析第45-54页
   ·鸭坦布苏病毒一步法RT-PCR检测方法的建立第45-48页
     ·引物的筛选第45页
     ·一步法RT-PCR扩增条件的优化第45-46页
     ·一步法RT-PCR反应特异性试验结果第46-47页
     ·一步法RT-PCR反应敏感性试验结果第47-48页
     ·一步法RT-PCR反应重复性试验结果第48页
     ·临床样本检测第48页
   ·实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立第48-52页
     ·目的基因片段克隆及阳性质粒制备第48-49页
     ·敏感性试验及标准曲线的建立第49页
     ·特异性试验第49-50页
     ·重复性试验第50-51页
     ·与一步法RT-PCR检测方法的比较第51-52页
   ·鸭坦布苏病毒E基因的克隆及变异性分析第52-54页
4 讨论第54-58页
   ·鸭坦布苏病毒一步法RT-PCR检测方法的建立第54-55页
   ·实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立第55-56页
   ·DTMUVE蛋白基因变异性分析第56-58页
5 结论第58-59页
参考文献第59-66页
附录第66-68页
致谢第68-69页
攻读学位期间发表论文情况第69页

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