基于计算几何及序列保守性的蛋白质活性位点预测
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| ·选题背景和意义 | 第10页 |
| ·生物信息学研究现状 | 第10-13页 |
| ·生物信息学研究热点 | 第13-15页 |
| ·基因组学 | 第13-14页 |
| ·蛋白质组学 | 第14页 |
| ·药物信息学 | 第14页 |
| ·生物芯片研究 | 第14-15页 |
| ·计算机辅助药物设计概述 | 第15-16页 |
| ·本章小结 | 第16-17页 |
| 第二章 生物学知识及研究背景 | 第17-30页 |
| ·蛋白质结构 | 第17-22页 |
| ·蛋白质的基本组成单位 | 第17页 |
| ·蛋白质的结构层次 | 第17-22页 |
| ·蛋白质与小分子相互作用 | 第22页 |
| ·蛋白质结合位点研究方法 | 第22-25页 |
| ·蛋白质可及性表面 | 第25-27页 |
| ·蛋白质可及性表面定义 | 第25-26页 |
| ·DSSP | 第26-27页 |
| ·蛋白质序列保守性 | 第27-28页 |
| ·序列保守性定义 | 第27-28页 |
| ·ConSurf-DB | 第28页 |
| ·本章小结 | 第28-30页 |
| 第三章 三维凸包算法概述 | 第30-36页 |
| ·计算几何概述 | 第30页 |
| ·算法相关的概念 | 第30-32页 |
| ·计算三维凸包的算法 | 第32-35页 |
| ·卷包裹法 | 第32-33页 |
| ·分治算法 | 第33-34页 |
| ·增量算法 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第四章 蛋白质活性位点预测的新方法 | 第36-46页 |
| ·ConHu-算法流程 | 第36-41页 |
| ·ConHull算法结果 | 第41-44页 |
| ·算法创新性 | 第44-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第五章 算法结果比较及参数设置 | 第46-52页 |
| ·测试数据 | 第46页 |
| ·与其他算法比较 | 第46-47页 |
| ·参数设置讨论 | 第47-51页 |
| ·组合排序 | 第47-48页 |
| ·ASA值与K值 | 第48-49页 |
| ·三维凸包的Expand值 | 第49-51页 |
| ·本章小节 | 第51-52页 |
| 第六章 全文总结 | 第52-54页 |
| ·主要结论 | 第52-53页 |
| ·研究展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 附录一 | 第59-63页 |
| 攻读硕士学位期间己发表或录用的论文 | 第63-64页 |
| 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
