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Human Cosavirus套式PCR检测方法的建立及基因组序列分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
符号说明第8-12页
第一章 文献综述第12-23页
 1 HCoSV 的研究进展第12-13页
 2 病原学第13-16页
   ·形态学特征第13页
   ·基因组结构第13-15页
   ·遗传分类第15页
   ·体外培养第15-16页
   ·致病性第16页
 3 流行病学第16-17页
   ·分子流行病学第16-17页
   ·环境中的HCoSV第17页
 4 HCoSV 的检测方法第17-22页
   ·微生物学检测第17-18页
     ·电镜(EM)直接观察法第17-18页
     ·免疫电镜法第18页
   ·免疫学检测技术第18-19页
     ·免疫吸附凝集试验第18页
     ·酶联免疫试验第18-19页
   ·分子生物学检测第19-22页
     ·RT-PCR 方法第20-21页
     ·核酸杂交法第21页
     ·荧光定量RT-PCR 法第21-22页
     ·宏基因组学( metagenomics)第22页
 5 本研究的目的与意义第22-23页
第二章 HCoSV 套式PCR 检测方法的建立及应用第23-31页
 1 材料第23-24页
   ·粪便样本第23页
   ·病毒样品第23页
   ·主要试剂第23-24页
   ·主要仪器第24页
 2 实验方法第24-25页
   ·引物的设计与合成第24页
   ·病毒总RNA 的提取第24-25页
   ·cDNA 的合成第25页
 3 套式PCR 方法的建立第25-26页
   ·PCR 条件的优化第25页
   ·PCR 扩增第25-26页
   ·PCR 产物克隆与DNA 序列分析第26页
   ·PCR 特异性试验第26页
   ·PCR 灵敏性试验第26页
   ·套式PCR检测方法的应用第26页
 4 结果第26-29页
   ·最佳的PCR 反应条件第26-27页
   ·PCR 法的特异性第27-28页
   ·PCR 法的灵敏性第28页
   ·临床样品的检测第28-29页
 5 讨论第29-31页
第三章 HCoSV 基因组的扩增及序列分析第31-49页
 1 技术原理第31-32页
 2 引物设计第32-34页
 3 反应条件第34-37页
   ·染色体步移技术第34-35页
     ·1~(st) PCR 反应第34页
     ·2~(nd) PCR 反应第34-35页
     ·3~(nd) PCR 反应第35页
   ·普通PCR 反应条件第35-36页
   ·长片段扩增反应条件第36-37页
 4 结果第37-47页
   ·HCoSV 本实验毒株基因结构图第37-38页
   ·HCoSV 本实验毒株基因组序列信息第38-41页
   ·系统分析及进化树第41-47页
 5 讨论第47-49页
第四章 HCoSV VP3 蛋白的原核表达及纯化第49-61页
 1 材料第49-50页
   ·粪便样品、菌株和质粒第49页
   ·主要试剂第49页
   ·主要仪器第49-50页
 2 实验方法第50-57页
   ·引物的设计与合成第50页
   ·RT-PCR 反应第50-51页
     ·cDNA 的合成第50页
     ·PCR 扩增第50-51页
   ·目的片段的纯化回收第51-52页
   ·目的基因的克隆第52-53页
     ·克隆质粒的构建第52页
     ·克隆质粒的筛选及制备第52-53页
       ·克隆质粒的转化及筛选第52页
       ·克隆质粒的提取及鉴定第52-53页
   ·原核表达载体PET-30a-VP3 的构建第53-55页
     ·双酶切反应第53-54页
     ·PET-30a 空载体的线性化双酶切第54-55页
     ·目的基因与线性化表达载体pET-30a 的连接第55页
     ·原核表达载体的转化与鉴定第55页
   ·重组表达载体的诱导表达第55页
   ·最优表达时间的确定第55-56页
   ·表达产物的纯化第56页
     ·包涵体的分离和变性第56页
     ·目的蛋白的纯化第56页
   ·表达产物的复性第56-57页
 3 结果第57-59页
   ·VP3 基因的PCR 结果第57页
   ·目的基因的克隆鉴定第57页
   ·重组表达载体的鉴定第57-58页
   ·蛋白原核表达及最优表达时间的确定第58页
   ·蛋白的可溶性分析第58-59页
   ·蛋白的纯化与复性第59页
 4 讨论第59-61页
第五章 结论第61-63页
参考文献第63-70页
附录Ⅰ 试剂配置第70-73页
攻读学位期间发表的学术论文目录第73-74页
致谢第74页

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