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荒漠地区优势地衣石果衣Endocarpon pusillum Hedwing全长cDNA文库的构建与初步分析

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
1 绪论第11-22页
   ·前言第11-12页
   ·地衣的抗旱特性第12-13页
     ·干旱对地衣的影响第12页
     ·地衣的抗旱机制第12-13页
   ·其它真菌和植物抗旱基因的研究进展第13-15页
     ·具有渗透调节作用的基因第13-14页
     ·具有抗氧化胁迫作用的酶类第14页
     ·保护生物大分子及膜结构的相关基因第14-15页
   ·地衣分子生物学研究进展第15-17页
     ·筛选地衣中抗性基因的几种方法第15-16页
     ·全长cDNA 文库的意义和技术第16-17页
   ·真菌基因组学的研究进展第17-21页
     ·绝对定量PCR 方法测定地衣型真菌基因组大小的原理及意义第18-20页
     ·相对定量PCR 方法测定基因拷贝数的原理及意义第20-21页
   ·本研究的目的及意义第21-22页
2 材料与方法第22-41页
   ·材料及试剂第22-26页
     ·地衣材料第22页
     ·质粒载体及菌种第22页
     ·酶及化学试剂第22页
     ·培养基及试剂第22-24页
     ·PCR 引物第24-26页
   ·实验方法第26-28页
     ·CTAB 法提取地衣型真菌基因组DNA第26页
     ·PCR 扩增核糖体18S rRNA 序列验证提出的DNA第26-27页
     ·地衣型真菌总RNA 的提取第27-28页
   ·全长cDNA 文库的构建过程第28-34页
     ·cDNA 第一链的合成第28-29页
     ·LD-PCR 合成第二链cDNA 并扩增全长cDNA 双链第29页
     ·蛋白酶K 消化第29-30页
     ·限制性内切酶Sfi I 酶切第30页
     ·cDNA 大小分级第30-31页
     ·ds cDNA 连接载体pDNR-LIB第31页
     ·重组质粒电转化E.coli 中第31-32页
     ·原始文库质量鉴定第32页
     ·菌液PCR 检测第32-33页
     ·原始文库的扩增第33页
     ·全长cDNA 文库的初步筛选第33-34页
   ·相对定量PCR 测定rRNA 基因的拷贝数第34-35页
   ·原肌球蛋白(Tropomyosin-1)的表达及纯化第35-41页
     ·原肌球蛋白TPM-1 全长基因的获得第35页
     ·质粒DNA 的提取(按照Omega 质粒提取试剂盒说明)第35-36页
     ·表达载体的酶切第36页
     ·凝胶回收DNA 片段(参照Omgea 试剂盒说明书)第36-37页
     ·DNA 片段与克隆载体的连接第37页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第37页
     ·大肠杆菌BL21 热激转化第37-38页
     ·聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)电泳检测第38-39页
     ·IPTG 诱导蛋白浓度的测定第39页
     ·蛋白质可溶性表达检测第39-40页
     ·可溶性蛋白TPM-1 的分离纯化—金属螯合纯化第40页
     ·可溶性蛋白TPM-1 的分离纯化—分子筛层析第40-41页
3 结果与分析第41-51页
   ·地衣型真菌Endocarpon pusillum 总RNA 的提取第41页
   ·双链cDNA 的合成第41-42页
   ·cDNA 的分级分离及检测第42页
   ·文库的初步鉴定第42-43页
   ·绝对定量PCR 计算基因组大小的结果第43-46页
   ·相对定量PCR 测定rRNA 基因的重复单位第46-48页
   ·原肌球蛋白(Tropomyosin-1)的序列分析第48页
   ·IPTG 诱导蛋白浓度的测定第48-49页
   ·蛋白可溶表达检测第49-50页
   ·可溶蛋白TPM-1 的分离纯化第50-51页
4 讨论第51-55页
   ·RNA 提取方法的比较第51-52页
   ·cDNA 文库的构建第52页
   ·准确定量模板浓度在荧光定量PCR 中的重要性第52页
   ·绝对定量PCR 方法测定基因组大小第52-53页
   ·相对定量PCR 方法测定rRNA 基因的拷贝数第53页
   ·地衣型真菌的蛋白在E.coli 中的表达第53-55页
5 结论第55-56页
参考文献第56-61页
附录第61-65页
致谢第65-66页
攻读学位期间发表论文第66页

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