基于动态权重匹配的RNA二级结构预测算法
摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-12页 |
第一章 前言 | 第12-17页 |
·问题的提出 | 第12-14页 |
·国内外研究现状 | 第14-16页 |
·论文结构安排 | 第16-17页 |
第二章 RNA序列与结构 | 第17-31页 |
·RNA的生物学背景 | 第17-21页 |
·RNA的组成 | 第17-19页 |
·RNA的分类与功能 | 第19-21页 |
·RNA的结构 | 第21-31页 |
·RNA的生物学结构特点 | 第21-25页 |
·RNA的一级结构 | 第25页 |
·二级结构及其实验测定 | 第25-26页 |
·RNA的二级结构特征 | 第26-29页 |
·RNA二级结构的图形表示方式 | 第29-31页 |
第三章 RNA二级结构预测的各种现有方法 | 第31-49页 |
·比较序列分析方法 | 第31-37页 |
·共变模型 | 第33-35页 |
·随机上下文无关语法模型 | 第35-37页 |
·动态规划算法 | 第37-40页 |
·组合优化算法 | 第40-42页 |
·螺旋区堆积法 | 第40-41页 |
·最大权重匹配算法 | 第41-42页 |
·启发式算法 | 第42-44页 |
·遗传算法 | 第42-43页 |
·模拟退火算法 | 第43页 |
·神经网络算法 | 第43-44页 |
·RNA二级结构预测算法总结及现有资源 | 第44-47页 |
·各类算法总结 | 第44-45页 |
·RNA二级结构预测现有资源 | 第45-47页 |
·本章小结 | 第47-49页 |
第四章 基于动态权重匹配的RNA折叠算法及其应用 | 第49-60页 |
·RNA二级结构与假结 | 第50-52页 |
·动态权重匹配算法 | 第52-54页 |
·测试集及预测结果 | 第54-57页 |
·讨论 | 第57-59页 |
·本章小结 | 第59-60页 |
第五章 总结与展望 | 第60-64页 |
·论文总结 | 第60-61页 |
·存在的问题和今后的工作 | 第61-64页 |
致谢 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-70页 |
攻读硕士学位期间发表的论文及取得的成果 | 第70-71页 |
附录 | 第71-83页 |
附录 A | 第71-77页 |
附录 B | 第77-83页 |