| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 第一部分 前言 | 第13-35页 |
| 1 基因组学研究概述 | 第13-16页 |
| ·基因组及基因组学简介 | 第13页 |
| ·基因组学研究现状 | 第13-15页 |
| ·基因组数据的统计 | 第13页 |
| ·人类基因组计划及模式生物基因组计划研究进展 | 第13-14页 |
| ·昆虫基因组测序进展 | 第14-15页 |
| ·基因组学研究的发展及应用 | 第15-16页 |
| 2 基因组研究技术和方法 | 第16-20页 |
| ·基因组测序策略 | 第17-20页 |
| ·核基因组测序策略 | 第17-18页 |
| ·线粒体基因组测序策略 | 第18-20页 |
| ·基因组序列数据的拼接及注释 | 第20页 |
| 3 线粒体基因组的研究概况 | 第20-32页 |
| ·线粒体及线粒体基因组 | 第20-21页 |
| ·动物线粒体基因组的主要特征 | 第21-24页 |
| ·线粒体基因组的结构特征 | 第21-22页 |
| ·线粒体基因组的遗传特征 | 第22-23页 |
| ·线粒体基因组的进化特征 | 第23-24页 |
| ·动物线粒体基因组各组分的特征 | 第24-31页 |
| ·蛋白质编码基因(protein-coding genes) | 第24页 |
| ·tRNA基因(tRNA genes) | 第24-27页 |
| ·rRNA基因(rRNA genes) | 第27-29页 |
| ·控制区(control region) | 第29-31页 |
| ·动物线粒体基因组测序进展及应用价值 | 第31-32页 |
| 4 直翅目昆虫线粒体基因组研究现状 | 第32-34页 |
| ·直翅目昆虫简介 | 第32-33页 |
| ·直翅目昆虫全线粒体基因组研究现状 | 第33页 |
| ·青脊竹蝗、云南蝗与亚洲飞蝗介绍 | 第33-34页 |
| 5 研究目的及意义 | 第34-35页 |
| 第二部分 实验材料与方法 | 第35-46页 |
| 1 实验材料 | 第35-37页 |
| ·标本的采集、保存、选择与鉴定 | 第35页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第35-37页 |
| ·主要实验仪器 | 第35-36页 |
| ·实验试剂 | 第36-37页 |
| 2 实验方法 | 第37-44页 |
| ·总DNA提取 | 第38-40页 |
| ·总DNA提取试剂的配制 | 第38-39页 |
| ·总DNA提取流程 | 第39页 |
| ·总DNA的检测 | 第39-40页 |
| ·长PCR及二次PCR引物的设计 | 第40页 |
| ·长PCR扩增及产物的纯化 | 第40-43页 |
| ·长PCR扩增 | 第40-41页 |
| ·长PCR产物的检测及纯化 | 第41-43页 |
| ·二次PCR扩增及产物的纯化 | 第43页 |
| ·二次PCR扩增 | 第43页 |
| ·二次PCR产物的检测及纯化 | 第43页 |
| ·序列测定 | 第43-44页 |
| ·二次PCR扩增产物直接测序 | 第44页 |
| ·克隆测序 | 第44页 |
| 3 序列数据的初步分析 | 第44-46页 |
| ·测序结果的检查与校对 | 第44-45页 |
| ·测序片段的拼接和组装 | 第45页 |
| ·线粒体基因组的注释 | 第45-46页 |
| 第三部分 实验结果 | 第46-50页 |
| 1 总DNA提取 | 第46-47页 |
| 2 长PCR | 第47页 |
| 3 二次PCR | 第47-48页 |
| 4 序列测定 | 第48页 |
| 5 序列组装 | 第48-50页 |
| 第四部分 青脊竹蝗线粒体基因组 | 第50-61页 |
| 1 青脊竹蝗线粒体基因组的结构组成及基本特征 | 第50-52页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第50-52页 |
| ·基因重叠区和基因间隔序列 | 第52页 |
| ·核苷酸组成特征 | 第52页 |
| 2 蛋白质基因 | 第52-56页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性 | 第52-55页 |
| ·蛋白质基因密码子的使用 | 第55-56页 |
| ·蛋白质基因氨基酸组成 | 第56页 |
| 3 tRNA基因 | 第56-59页 |
| 4 rRNA基因 | 第59-60页 |
| 5 控制区 | 第60-61页 |
| 第五部分 云南蝗线粒体基因组 | 第61-72页 |
| 1 云南蝗线粒体基因组的结构组成及基本特征 | 第61-63页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第61-63页 |
| ·基因重叠区和基因间隔序列 | 第63页 |
| ·核苷酸组成特征 | 第63页 |
| 2 蛋白质基因 | 第63-67页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性 | 第63-64页 |
| ·蛋白质基因密码子的使用 | 第64-67页 |
| ·蛋白质基因氨基酸组成 | 第67页 |
| 3 tRNA基因 | 第67-70页 |
| 4 rRNA基因 | 第70-71页 |
| 5 控制区 | 第71-72页 |
| 第六部分 亚洲飞蝗线粒体基因组 | 第72-85页 |
| 1 亚洲飞蝗线粒体基因组的结构组成及基本特征 | 第72-74页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第72-74页 |
| ·基因重叠区和基因间隔序列 | 第74页 |
| ·核苷酸组成特征 | 第74页 |
| 2 蛋白质基因 | 第74-78页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性 | 第74-75页 |
| ·蛋白质基因密码子的使用 | 第75-78页 |
| ·蛋白质基因氨基酸组成 | 第78页 |
| 3 tRNA基因 | 第78-81页 |
| 4 rRNA基因 | 第81-82页 |
| 5 控制区 | 第82-85页 |
| 第七部分 直翅目昆虫线粒体基因组比较分析及讨论 | 第85-103页 |
| 1 线粒体基因组的整体比较 | 第85-89页 |
| ·线粒体基因组的结构组成和基因顺序比较 | 第85-86页 |
| ·线粒体基因组的基因间隔区和基因重叠区比较 | 第86-87页 |
| ·线粒体基因组的碱基组成比较 | 第87-89页 |
| 2 蛋白质编码基因的比较和分析 | 第89-95页 |
| ·蛋白质编码基因的碱基组成 | 第89-91页 |
| ·蛋白质基因密码子的使用 | 第91-92页 |
| ·蛋白质基因起始密码子和终止密码子的使用 | 第91-92页 |
| ·蛋白质基因同义密码子使用偏向性 | 第92页 |
| ·蛋白质基因氨基酸组成比较 | 第92-93页 |
| ·蛋白质基因的亲水性结构分析 | 第93-95页 |
| 3 tRNA基因二级结构的比较与分析 | 第95页 |
| 4 rRNA基因的分析 | 第95-97页 |
| 5 控制区序列的比较分析 | 第97-103页 |
| 第八部分 结论 | 第103-106页 |
| 参考文献 | 第106-117页 |
| 附录一 | 第117-118页 |
| 附录二 | 第118-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第120页 |